More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4670 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4670  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  460  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8764  response regulator receiver protein  71.11 
 
 		 229 aa  294  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4069  two component transcriptional regulator, winged helix family  64 
 
 		 232 aa  269  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0969233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4194  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.07 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100781  normal  0.264432 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5345  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.44 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.264155 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  46.49 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  51.98 
 
 		 228 aa  211  9e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 227 aa  210  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  54.42 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.186273 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  51.54 
 
 		 228 aa  207  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  48.43 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  51.11 
 
 		 227 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 237 aa  205  4e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  49.56 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  45.95 
 
 		 231 aa  201  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.89 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.4 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3061  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 227 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.799336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.14 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  47.32 
 
 		 236 aa  197  9e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.19 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2358  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  46.43 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.47 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  47.06 
 
 		 236 aa  195  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1756  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.46 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.769657  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  47.51 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.06 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.33 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.88 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.66 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.42 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.33 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  43.69 
 
 		 229 aa  191  9e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.2 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.19 
 
 		 235 aa  190  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  47.06 
 
 		 230 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.72 
 
 		 223 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.61 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0132  response regulator receiver protein  48 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  46.49 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 228 aa  189  4e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 230 aa  188  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2476  two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000027247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0624  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  46.49 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2844  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 226 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  47.21 
 
 		 241 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  43.95 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3335  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.428008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.51 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 256 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4523  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 251 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.49 
 
 		 239 aa  185  5e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  38.6 
 
 		 234 aa  185  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.54 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  47.56 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 233 aa  184  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 234 aa  184  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  48.44 
 
 		 245 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  44.64 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3070  two component transcriptional regulator  48.02 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000463151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.95 
 
 		 226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0404  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 227 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.28 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.78 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.82 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 230 aa  182  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.65 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05646  two-component response regulator transcription regulator protein  45.25 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.64 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3815  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0278114  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  41.7 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0337  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 227 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1201  DNA-binding transcriptional regulator BaeR  46.02 
 
 		 243 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.106709  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 242 aa  181  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1549  response regulator receiver protein  50 
 
 		 241 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0273908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>