15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4667 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
212 aa  421  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  72.27 
 
 
249 aa  278  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8763  hypothetical protein  45.59 
 
 
303 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.74 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1973  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.16 
 
 
277 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7232  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.18 
 
 
295 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5278  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.11 
 
 
132 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299006  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4333  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.36 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.59 
 
 
254 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0161854  decreased coverage  0.00139428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.71 
 
 
238 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5686  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.65 
 
 
273 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0509  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.23 
 
 
287 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2688  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.46 
 
 
292 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00428161  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.75 
 
 
112 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4659  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.99 
 
 
261 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0138559  normal  0.655955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>