159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4665 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4665  Berberine/berberine domain protein  100 
 
 		 529 aa  1090    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.293743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4988  Berberine/berberine domain protein  40.46 
 
 		 529 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332344  hitchhiker  0.00488458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0050  hypothetical protein  42.06 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0997  Berberine/berberine domain-containing protein  39.46 
 
 		 539 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.367258  normal  0.977331 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3700  Berberine/berberine domain protein  40.75 
 
 		 508 aa  294  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3377  Berberine/berberine domain protein  40.23 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3218  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.81 
 
 		 554 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3897  FAD/FMN-containing dehydrogenases  37.54 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.370442  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0113  hexose oxidase  37.54 
 
 		 553 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.258284  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3473  putative oxidoreductase, FAD-binding  37.55 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1646  putative oxidoreductase, FAD-binding  37.55 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3077  putative oxidoreductase, FAD-binding  37.55 
 
 		 553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3978  FAD/FMN-containing dehydrogenases  37.37 
 
 		 550 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2895  oxidoreductase, FAD-binding, putative  37.36 
 
 		 553 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0685436  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  35.08 
 
 		 685 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  34.72 
 
 		 685 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  34.72 
 
 		 685 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 466 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  28.17 
 
 		 444 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  27.58 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0479  hypothetical protein  28.54 
 
 		 328 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0479005  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 		 532 aa  117  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  27.04 
 
 		 461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.69 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  28.27 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  28.17 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0518  histidine kinase  25.05 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0318  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  25.33 
 
 		 491 aa  98.2  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000970405  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.03 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.17 
 
 		 461 aa  95.1  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  27.25 
 
 		 474 aa  94.7  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.64 
 
 		 490 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  27.35 
 
 		 463 aa  94.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.84 
 
 		 448 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.52 
 
 		 449 aa  89.7  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  24.56 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2583  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 		 896 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.95 
 
 		 474 aa  87.4  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2650  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 		 896 aa  87.4  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  25.81 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2758  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 		 896 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  40 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1694  FAD-binding protein  31.13 
 
 		 894 aa  84  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  38.96 
 
 		 462 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  26.95 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  25.05 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  25 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  37.67 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.38 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.19 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3854  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.15 
 
 		 574 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1411  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.73 
 
 		 891 aa  79  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10388  glucooligosaccharide oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14340)  25.24 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.451589  normal  0.284571 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  29.79 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3156  FAD linked oxidase-like protein  28.33 
 
 		 577 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  39.74 
 
 		 499 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  26.89 
 
 		 480 aa  77  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  36.2 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  34.97 
 
 		 479 aa  77  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  35.22 
 
 		 478 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  32.27 
 
 		 468 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  37.5 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  34.18 
 
 		 479 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1510  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 614 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2842  FAD linked oxidase domain protein  28.85 
 
 		 864 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0215386 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.33 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1503  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1539  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.85 
 
 		 864 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.416598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  27.47 
 
 		 495 aa  74.3  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.95 
 
 		 464 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  38.56 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  24.6 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.58 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0408  putative reticuline oxidase  38.36 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7289  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.76 
 
 		 542 aa  70.1  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0772845  normal  0.274772 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  27.96 
 
 		 563 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08405  FAD-dependent monooxygenase (Eurofung)  38.4 
 
 		 596 aa  68.2  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  26.64 
 
 		 470 aa  67  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  25.83 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.67 
 
 		 726 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.28 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 754 aa  66.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  26.27 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  27.19 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  23.91 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.32 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  25.49 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  41.22 
 
 		 764 aa  63.5  0.000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 758 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1145  FAD/FMN-containing dehydrogenase  27.65 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  38.33 
 
 		 465 aa  62.4  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  29.34 
 
 		 705 aa  62.4  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01787  conserved hypothetical protein  28.86 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.433483  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  33.81 
 
 		 465 aa  62  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  24.46 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.33 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.15 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02648  isoamyl alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01180)  21.63 
 
 		 566 aa  60.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.908923 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.35 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>