75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4654 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4654  Abortive infection protein  100 
 
 
278 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0863972  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3361  Abortive infection protein  68.98 
 
 
278 aa  348  4e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0143226  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4470  abortive infection protein  60.79 
 
 
273 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0544526  normal  0.221702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4862  abortive infection protein  55.76 
 
 
278 aa  276  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2460  abortive infection protein  56.49 
 
 
278 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112668  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2601  Abortive infection protein  54.61 
 
 
282 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1621  Abortive infection protein  53.95 
 
 
281 aa  214  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.941047  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4219  Abortive infection protein  50.78 
 
 
296 aa  206  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1150  abortive infection protein  38.06 
 
 
286 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3181  hypothetical protein  42.26 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.407647  normal  0.680592 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0281  abortive infection protein  41.25 
 
 
289 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7417  Abortive infection protein  40.18 
 
 
296 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354862  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2395  abortive infection protein  39.33 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4601  abortive infection protein  37.5 
 
 
295 aa  93.6  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.786066  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3429  abortive infection protein  34.69 
 
 
305 aa  90.5  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.489231  normal  0.486694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2782  hypothetical protein  30.77 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1465  protease, putative  27.4 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1065  Abortive infection protein  35.37 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.144357  normal  0.178916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2522  CAAX amino terminal protease family protein  32.05 
 
 
298 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000820509  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0048  Abortive infection protein  32.08 
 
 
329 aa  79.7  0.00000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1909  abortive infection protein  30.96 
 
 
295 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000122916  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0101  abortive infection protein  30.52 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2441  CAAX amino terminal protease family protein  29.61 
 
 
298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.129008 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2943  CAAX amino terminal protease family protein  29.49 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000176394  hitchhiker  0.0000000168434 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1778  abortive infection protein  30.17 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050408  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2217  CAAX amino terminal protease family protein  28.76 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000163275  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1132  Abortive infection protein  29.93 
 
 
324 aa  72.4  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.349362  hitchhiker  0.0040252 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2237  abortive infection protein  28.76 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000302843  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2276  Abortive infection protein  28.52 
 
 
325 aa  71.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0702247 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2388  caax amino protease family  29.33 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0163342  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1408  CAAX amino terminal protease family protein  31.2 
 
 
282 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2178  CAAX amino terminal protease family protein  28.89 
 
 
298 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000162291  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2533  protease family protein  30.17 
 
 
314 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0262  CAAX amino terminal protease family protein  30.17 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1605  CAAX amino terminal protease family protein  30.17 
 
 
311 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2455  CAAX amino terminal protease family protein  33.33 
 
 
260 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000392228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0226  CAAX amino terminal protease family protein  30.17 
 
 
314 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2258  CAAX amino terminal protease family protein  31.95 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0960  CAAX amino terminal protease family protein  31.2 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2676  protease family protein  31.06 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.451283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2411  abortive infection protein  30.73 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13230  Abortive infection protein  30.17 
 
 
326 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.497232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1002  protease, putative  23.87 
 
 
292 aa  62.4  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000825875  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1886  abortive infection protein  31.4 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.384118  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3225  abortive infection protein  26.67 
 
 
344 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0165135  normal  0.0503949 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0509  CAAX amino terminal protease family protein  28.93 
 
 
433 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0878  metal-dependent membrane protease  24.55 
 
 
291 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000352169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0021  protease, putative  27.2 
 
 
283 aa  57  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1850  CAAX amino terminal protease family protein  28.97 
 
 
263 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0460286  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3525  abortive infection protein  24.18 
 
 
285 aa  53.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0591  Abortive infection protein  36 
 
 
287 aa  52.8  0.000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2419  abortive infection protein  27.39 
 
 
305 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5069  abortive infection protein  28.57 
 
 
270 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0393  Abortive infection protein  32.63 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00491577  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0129  CAAX amino terminal protease family protein  25.68 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0880  Abortive infection protein  22.22 
 
 
288 aa  47  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.41054  normal  0.151665 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5109  CAAX amino terminal protease family protein  32.14 
 
 
237 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4691  caax amino protease family  31.86 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000795841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5138  CAAX amino terminal protease family protein  28.44 
 
 
288 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.450282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4298  CAAX amino protease  31.86 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5786  Abortive infection protein  36 
 
 
269 aa  45.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5243  CAAX amino terminal protease family protein  30.95 
 
 
227 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.325917  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4872  CAAX amino terminal protease family protein  30.95 
 
 
237 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.499813  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1317  Abortive infection protein  37.5 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.254651  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0716  CAAX amino terminal protease family protein  28.28 
 
 
278 aa  45.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000180726  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0131  CAAX amino terminal protease family protein  25 
 
 
308 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000026669  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1659  Abortive infection protein  23.11 
 
 
301 aa  43.9  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0563  caax amino protease family  25.76 
 
 
238 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000143586  hitchhiker  0.000000000286497 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0580  Abortive infection protein  28.57 
 
 
269 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1515  abortive infection protein  32.16 
 
 
395 aa  43.5  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007323  GBAA_pXO2_0088  CAAX amino terminal protease family protein  28.85 
 
 
182 aa  43.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05400  CAAX amino terminal protease family  26.54 
 
 
260 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.612617  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4308  CAAX amino terminal protease family protein  33.75 
 
 
241 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0534572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0915  Abortive infection protein  28.44 
 
 
284 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.17238  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1293  abortive infection protein  32.97 
 
 
272 aa  42  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>