More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4653 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4653  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 387 aa  753    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.224813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  62.01 
 
 		 384 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4469  putative two-component system sensor kinase  66.67 
 
 		 384 aa  451  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.400588  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2459  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  62.96 
 
 		 384 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4861  histidine kinase  61.95 
 
 		 390 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0904553 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1620  histidine kinase  61.2 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.42 
 
 		 386 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7416  histidine kinase  45.58 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.375707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4218  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 		 382 aa  209  6e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0292279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  35.85 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  35.47 
 
 		 433 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7160  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 406 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.374119  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26850  signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 441 aa  149  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.479367  normal  0.194015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1872  histidine kinase  34.92 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235373  normal  0.411466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2303  histidine kinase  36.01 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0024754  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1845  histidine kinase  39.39 
 
 		 428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.307294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2846  histidine kinase  43.41 
 
 		 369 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000726126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1739  histidine kinase  35.94 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6212  putative two-component system sensor kinase  39.29 
 
 		 408 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.404432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  42.04 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  34.55 
 
 		 430 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1351  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.403859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  36.63 
 
 		 417 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0952  histidine kinase  33.33 
 
 		 408 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.849135  normal  0.301378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3288  histidine kinase  32.44 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.345987  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3184  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  35.57 
 
 		 442 aa  133  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.12 
 
 		 438 aa  132  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  34.81 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5643  histidine kinase  39.24 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.1289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  31.84 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7210  Signal transduction histidine kinase-like protein  43 
 
 		 379 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0824986 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  39.92 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.13 
 
 		 443 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  42.21 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7008  histidine kinase  32.77 
 
 		 402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.432266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1510  histidine kinase  29.83 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0382398 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0856  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 500 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  41 
 
 		 367 aa  127  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.32 
 
 		 406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1653  histidine kinase  37.79 
 
 		 470 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1846  Signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 416 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.280693  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0607  histidine kinase  40.47 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 445 aa  125  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0107718  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5877  histidine kinase  40.34 
 
 		 419 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.473152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7842  histidine kinase  37.3 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.209529 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1732  histidine kinase  32.98 
 
 		 387 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.424058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1615  histidine kinase  37.07 
 
 		 407 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0650745  normal  0.0536208 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4492  histidine kinase  41.24 
 
 		 410 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  37.11 
 
 		 399 aa  123  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0200  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.18 
 
 		 424 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  39.05 
 
 		 457 aa  122  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3239  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.42 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.771417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4000  histidine kinase  37.41 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20684  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03530  signal transduction histidine kinase  40.18 
 
 		 484 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.29 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 403 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7605  Histidine kinase  38.68 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4183  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  39.25 
 
 		 407 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.374339 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 420 aa  119  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.420367  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8244  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.15 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.249642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 394 aa  119  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0459585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1961  histidine kinase  38.91 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7811  histidine kinase  37.05 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3245  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.14 
 
 		 430 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000678537  normal  0.37846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  32.21 
 
 		 380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8413  histidine kinase  34.29 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7014  histidine kinase  39.13 
 
 		 388 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.149042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  30.03 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7104  histidine kinase  34.5 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.999935  normal  0.409362 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.63 
 
 		 470 aa  116  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  41.21 
 
 		 372 aa  116  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.13 
 
 		 370 aa  116  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2821  histidine kinase  36.94 
 
 		 423 aa  115  8.999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0543421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5264  histidine kinase  31.56 
 
 		 376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0768  putative two-component system sensor kinase  35.53 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4901  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  40.54 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.316421  normal  0.344545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 536 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3356  histidine kinase  42.06 
 
 		 426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6406  histidine kinase  32.82 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8801  putative two-component system sensor kinase  36.24 
 
 		 359 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23670  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 404 aa  113  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4509  Histidine kinase  34.84 
 
 		 380 aa  113  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.9215  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5069  histidine kinase  31.2 
 
 		 403 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.101973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2781  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 424 aa  113  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57519  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3670  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.28 
 
 		 371 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2107  histidine kinase  32.38 
 
 		 401 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.51786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  34.98 
 
 		 381 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2009  histidine kinase  36.04 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4895  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.91 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.235337 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  34.18 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3388  histidine kinase  31.34 
 
 		 402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000377733  hitchhiker  0.000242442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2709  histidine kinase  37.1 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607523  normal  0.683898 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4578  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.05 
 
 		 370 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.204819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>