143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4606 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 1261 aa  2527    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1523 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  29.75 
 
 		 1500 aa  394  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  31.16 
 
 		 1509 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  29.43 
 
 		 845 aa  287  9e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  28.39 
 
 		 843 aa  271  5e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1383 aa  270  1e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  29.01 
 
 		 849 aa  261  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  29.33 
 
 		 838 aa  257  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  28.5 
 
 		 1324 aa  248  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.18 
 
 		 1309 aa  234  7.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  28.18 
 
 		 1314 aa  231  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  27.83 
 
 		 900 aa  197  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  26.3 
 
 		 1311 aa  178  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  28.64 
 
 		 897 aa  164  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  27.4 
 
 		 1000 aa  162  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.41 
 
 		 899 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  28.53 
 
 		 859 aa  158  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  29.1 
 
 		 829 aa  157  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  26.02 
 
 		 1068 aa  149  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  27.8 
 
 		 675 aa  146  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  25.03 
 
 		 1010 aa  145  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  26.72 
 
 		 992 aa  143  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  25.94 
 
 		 963 aa  140  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  27.83 
 
 		 1056 aa  139  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  25.13 
 
 		 1326 aa  136  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  29.17 
 
 		 934 aa  135  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 911 aa  134  7.999999999999999e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1039 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 785 aa  132  6e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 		 1088 aa  126  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  24.89 
 
 		 801 aa  114  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  22.59 
 
 		 1262 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  22.38 
 
 		 1185 aa  111  9.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  24.26 
 
 		 958 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  33.6 
 
 		 373 aa  102  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  25.13 
 
 		 713 aa  101  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  23.33 
 
 		 1125 aa  100  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  22.97 
 
 		 1128 aa  98.2  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.6 
 
 		 1146 aa  97.1  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  22.3 
 
 		 1050 aa  94  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  21 
 
 		 1136 aa  94.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  21.32 
 
 		 1288 aa  93.6  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  24.52 
 
 		 793 aa  92.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 1283 aa  88.2  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  31.25 
 
 		 385 aa  85.5  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 837 aa  79.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  31.63 
 
 		 392 aa  77.8  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  21.63 
 
 		 1212 aa  77.4  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 		 526 aa  76.6  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 640 aa  76.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  28.46 
 
 		 1131 aa  75.9  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  27.3 
 
 		 877 aa  75.9  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  31.47 
 
 		 1199 aa  74.3  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  24.52 
 
 		 2145 aa  73.6  0.00000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  31.6 
 
 		 953 aa  73.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.61 
 
 		 1186 aa  73.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2249  hypothetical protein  24.51 
 
 		 916 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.560102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5512  hypothetical protein  24.1 
 
 		 918 aa  71.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104688  normal  0.128387 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.17 
 
 		 1550 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 924 aa  70.5  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 		 857 aa  69.3  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  30.7 
 
 		 671 aa  68.9  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 652 aa  68.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1017 aa  68.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 843 aa  65.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 1105 aa  65.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  31.52 
 
 		 1108 aa  64.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  30.14 
 
 		 847 aa  63.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 814 aa  63.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  33.52 
 
 		 702 aa  63.2  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30 
 
 		 1911 aa  63.5  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  24.32 
 
 		 1003 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1657  hypothetical protein  27.6 
 
 		 513 aa  63.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.826128  normal  0.755126 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  23.9 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  26.79 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.58 
 
 		 966 aa  61.6  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1404 aa  60.8  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  26.62 
 
 		 686 aa  59.3  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 776 aa  58.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00460  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.51 
 
 		 921 aa  57.8  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.622636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.79 
 
 		 1228 aa  58.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  26.54 
 
 		 828 aa  58.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3752  transcriptional regulator, SARP family  31.13 
 
 		 992 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5691  transcriptional regulator, SARP family  28.88 
 
 		 956 aa  57.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  29.67 
 
 		 1022 aa  58.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3099  transcriptional regulator, SARP family  30.08 
 
 		 910 aa  57  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1496  transcriptional regulator, SARP family  27.78 
 
 		 1027 aa  57.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.905196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0438  hypothetical protein  26.14 
 
 		 822 aa  56.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.883391  normal  0.390424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  29.56 
 
 		 358 aa  56.2  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  29.15 
 
 		 680 aa  55.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10398  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 		 335 aa  54.7  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  25.29 
 
 		 892 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 1435 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  21.97 
 
 		 1468 aa  53.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  28.97 
 
 		 822 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02895  LipA and NB-ARC domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G11500)  26.73 
 
 		 1478 aa  52  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  29.55 
 
 		 990 aa  52  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  29.86 
 
 		 1014 aa  51.6  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  28.24 
 
 		 977 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>