191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4516 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  40.06 
 
 		 1523 aa  877    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  100 
 
 		 1509 aa  3016    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  32.68 
 
 		 1500 aa  531  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1383 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  34.98 
 
 		 845 aa  408  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  34.1 
 
 		 1324 aa  383  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  33.61 
 
 		 843 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  33.98 
 
 		 838 aa  356  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  33.45 
 
 		 849 aa  345  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  32.89 
 
 		 1309 aa  340  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  31.55 
 
 		 1314 aa  316  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  34.69 
 
 		 859 aa  277  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  32.41 
 
 		 900 aa  272  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  32.21 
 
 		 897 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.17 
 
 		 992 aa  266  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  30.08 
 
 		 1311 aa  256  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.77 
 
 		 1000 aa  255  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1010 aa  236  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  31.41 
 
 		 829 aa  234  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  30.42 
 
 		 934 aa  221  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  29.21 
 
 		 1326 aa  221  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 911 aa  211  9e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  31.53 
 
 		 675 aa  209  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 785 aa  194  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  27.48 
 
 		 1056 aa  189  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  24.88 
 
 		 1262 aa  188  8e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  27.66 
 
 		 963 aa  182  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1039 aa  179  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  27.56 
 
 		 899 aa  173  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 1105 aa  167  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  24.53 
 
 		 1185 aa  166  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 		 924 aa  166  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 		 1050 aa  166  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.72 
 
 		 1125 aa  157  1e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 		 1288 aa  155  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  35.84 
 
 		 1068 aa  147  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 1088 aa  142  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 		 1146 aa  137  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  23.84 
 
 		 828 aa  132  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 953 aa  132  7.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 		 1424 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  23.88 
 
 		 1131 aa  128  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  26.47 
 
 		 713 aa  125  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  24.01 
 
 		 1283 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1212 aa  122  4.9999999999999996e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  26.3 
 
 		 801 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 814 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 		 857 aa  117  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.23 
 
 		 767 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  22.75 
 
 		 1128 aa  116  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  33.83 
 
 		 373 aa  115  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  26.53 
 
 		 793 aa  106  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  21.91 
 
 		 1404 aa  104  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  22.49 
 
 		 1136 aa  103  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  26.24 
 
 		 686 aa  102  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  25 
 
 		 1488 aa  101  9e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  27.58 
 
 		 457 aa  101  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 		 1186 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  32.67 
 
 		 385 aa  100  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  24.1 
 
 		 1228 aa  98.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0459  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1017 aa  96.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.104459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 1215 aa  94  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.45 
 
 		 822 aa  93.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 843 aa  93.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5207  TPR repeat-containing protein  26.31 
 
 		 671 aa  93.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143534  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 640 aa  92.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.76 
 
 		 1328 aa  91.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5148  hypothetical protein  32.86 
 
 		 392 aa  90.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0430972  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  26.66 
 
 		 847 aa  89.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  26.49 
 
 		 1290 aa  87.8  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  31.46 
 
 		 1261 aa  88.2  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 454 aa  87.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5158  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 652 aa  86.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.455207  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.57 
 
 		 1475 aa  85.9  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 837 aa  84.7  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  23.02 
 
 		 672 aa  84.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  23.75 
 
 		 680 aa  82.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3881  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1199 aa  82  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0452998 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  21.82 
 
 		 577 aa  80.5  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  26.27 
 
 		 1014 aa  79  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  31.12 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.46 
 
 		 841 aa  78.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  23.2 
 
 		 1044 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 		 568 aa  77.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 751 aa  77.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 568 aa  77.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2522  Tetratricopeptide TPR_4  25.86 
 
 		 958 aa  76.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.27051  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 771 aa  74.3  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32160  tetratricopeptide repeat protein  39.71 
 
 		 702 aa  73.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.277202 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 966 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06955  conserved hypothetical protein  24.84 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1196 aa  72.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 444 aa  72.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  31.75 
 
 		 481 aa  72  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.64 
 
 		 919 aa  71.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  21.83 
 
 		 862 aa  71.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.37 
 
 		 991 aa  70.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1511  hypothetical protein  27.52 
 
 		 633 aa  69.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 949 aa  69.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  22.58 
 
 		 877 aa  68.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>