More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4452 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  100 
 
 
230 aa  463  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  43.36 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  33.56 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  33.56 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  33.56 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  33.56 
 
 
267 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  32.43 
 
 
263 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  36.08 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  36.99 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  27.68 
 
 
247 aa  80.1  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  40.48 
 
 
280 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  40.13 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  32.07 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  35.9 
 
 
266 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  38.71 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  37.1 
 
 
263 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  35.33 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  36.8 
 
 
263 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  34.04 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  29.94 
 
 
242 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0503  hypothetical protein  38.02 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000358381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  29.61 
 
 
264 aa  69.7  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2615  DNA replication protein-like protein  35.56 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00158711  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  32.65 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  34.9 
 
 
241 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  32.82 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  31.79 
 
 
343 aa  68.9  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  30.28 
 
 
283 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0607  IstB domain protein ATP-binding protein  32.09 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  33.85 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  30 
 
 
426 aa  65.9  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  29.33 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  33.09 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  24.56 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  28.1 
 
 
469 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  30.14 
 
 
284 aa  62.8  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  36.3 
 
 
267 aa  63.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  30.14 
 
 
284 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  27.08 
 
 
470 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  29.63 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  30.14 
 
 
286 aa  62  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  29.41 
 
 
306 aa  60.5  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  26.53 
 
 
260 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  26.56 
 
 
248 aa  58.5  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  26.49 
 
 
264 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  27.27 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  28.12 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  25.78 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  27.27 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  28.38 
 
 
319 aa  57.8  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  27.38 
 
 
297 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  26.56 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  26.6 
 
 
293 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  27.22 
 
 
264 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  27.66 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4484  IstB domain protein ATP-binding protein  30.34 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  25.13 
 
 
492 aa  54.7  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32 
 
 
570 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  28.8 
 
 
442 aa  53.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0001  chromosomal replication initiation protein  31.2 
 
 
557 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  26.56 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2958  DNA replication protein-like protein  28.24 
 
 
307 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  31.2 
 
 
528 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4413  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4440  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  normal  0.57261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0599  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0777  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0813  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1022  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1067  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1127  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1138  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1257  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1578  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1637  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1828  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.703545  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1925  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.467248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2020  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2045  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2094  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2141  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.264877  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2181  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2322  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2647  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2667  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2720  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2806  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2871  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.449035  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2875  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3140  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3186  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3517  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0252496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3548  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3764  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3790  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3945  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4324  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4344  IstB ATP binding domain-containing protein  29.73 
 
 
248 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0041  DNA replication protein DnaC  29.45 
 
 
337 aa  52.8  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>