160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4385 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  100 
 
 
205 aa  412  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  76.59 
 
 
205 aa  326  1e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  73.17 
 
 
205 aa  315  4e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  72.2 
 
 
205 aa  313  1e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  73.4 
 
 
205 aa  311  4e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  62.02 
 
 
210 aa  261  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  58.25 
 
 
206 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  54.15 
 
 
205 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  55.34 
 
 
206 aa  228  4e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  56.86 
 
 
206 aa  228  4e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  53.88 
 
 
206 aa  228  5e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  56.16 
 
 
205 aa  227  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  54.76 
 
 
210 aa  225  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  56.31 
 
 
206 aa  220  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  53.4 
 
 
282 aa  218  5e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  53.4 
 
 
208 aa  217  8e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  51.21 
 
 
209 aa  214  6e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  39.41 
 
 
204 aa  155  5e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  38.81 
 
 
208 aa  152  3e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  36.54 
 
 
205 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  36.06 
 
 
205 aa  140  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  34.16 
 
 
205 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  36.06 
 
 
205 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  34.13 
 
 
205 aa  134  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  35.96 
 
 
205 aa  134  1e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  34.13 
 
 
206 aa  133  2e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  34.6 
 
 
209 aa  130  2e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  37.02 
 
 
209 aa  128  7e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  35.92 
 
 
211 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  117  1e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  8.51308e-11 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  32.84 
 
 
206 aa  117  1e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.52766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  35.92 
 
 
211 aa  117  1e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  116  2e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  35.92 
 
 
211 aa  116  2e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  32.85 
 
 
209 aa  117  2e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  33.66 
 
 
206 aa  116  2e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.50489e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  35.44 
 
 
211 aa  115  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.52491e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  33.17 
 
 
209 aa  116  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  31.43 
 
 
210 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.02331e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  31.88 
 
 
209 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  35.96 
 
 
217 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.93859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  31.43 
 
 
210 aa  115  4e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.80581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  33.01 
 
 
206 aa  115  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  115  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  32.35 
 
 
206 aa  115  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12847e-09 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  31.88 
 
 
219 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  33.33 
 
 
209 aa  114  9e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  32.04 
 
 
207 aa  114  1e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  34.47 
 
 
213 aa  113  2e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  33.98 
 
 
213 aa  112  4e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  32.52 
 
 
204 aa  112  4e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  32.23 
 
 
215 aa  108  4e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  32.7 
 
 
215 aa  108  4e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  33.97 
 
 
209 aa  108  7e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  32.23 
 
 
215 aa  107  9e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  32.23 
 
 
215 aa  107  9e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
214 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  34.13 
 
 
212 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  34.09 
 
 
215 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  32.08 
 
 
208 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  31.22 
 
 
214 aa  106  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  32.35 
 
 
209 aa  105  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  31.6 
 
 
208 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  32.23 
 
 
215 aa  105  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  31.07 
 
 
230 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4359  protein of unknown function DUF47  31.53 
 
 
208 aa  104  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.547523  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  30.33 
 
 
215 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  31.19 
 
 
204 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  30.88 
 
 
214 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.97448e-05  hitchhiker  6.94622e-09 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  29.76 
 
 
208 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  31.19 
 
 
215 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  30.24 
 
 
208 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  28.92 
 
 
206 aa  101  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  100  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3001  hypothetical protein  30.58 
 
 
207 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.63551e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  32.85 
 
 
208 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  30.33 
 
 
215 aa  99.8  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  29.27 
 
 
208 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0042  protein of unknown function DUF47  30.24 
 
 
207 aa  100  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0593  hypothetical protein  29.76 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>