190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4384 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 108 aa  209  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7086  transcriptional regulator, XRE family  62.37 
 
 		 119 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.633613  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  57.14 
 
 		 99 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  54.76 
 
 		 99 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8282  putative transcriptional regulator, XRE family  42.17 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145655  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  34.67 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1462  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  39.53 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  34.12 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1591  DNA-binding transcriptional regulator HipB  31.58 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1709  DNA-binding transcriptional regulator HipB  31.58 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01470  DNA-binding transcriptional regulator  35.59 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2138  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0287483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2149  DNA-binding transcriptional regulator HipB  35.59 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01480  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 97 aa  51.2  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  39.13 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 117 aa  50.4  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  36.23 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  44 
 
 		 184 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0888  XRE family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0891  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0190  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000995138  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0033  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.400371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.86 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0883  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0887  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 218 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 117 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0930  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00205943  normal  0.115025 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15930  predicted transcriptional regulator  36.84 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000543618  hitchhiker  0.000000237472 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  46.67 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 100 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0267  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 118 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.257195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  42 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 83 aa  47  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1144  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  36.25 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1050  transcriptional regulator, XRE family  40.82 
 
 		 184 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000995235  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  46.3 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0889  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 210 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2075  helix-turn-helix domain protein  38.1 
 
 		 196 aa  45.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241547  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  40.26 
 
 		 180 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  39.06 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0874  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 206 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000967944  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0009  HTH-type transcriptional regulator SinR  35.85 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1896  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 512 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  43.75 
 
 		 509 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  31.33 
 
 		 255 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0059  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 180 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3917  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153892  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3290  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.605967 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2435  transcriptional regulator, XRE family  29.87 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  32.88 
 
 		 75 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0512  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 185 aa  43.9  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4776  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0811435  normal  0.544838 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 219 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 252 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 406 aa  43.5  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2338  helix-turn-helix domain protein  37.5 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  40.68 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5087  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000142264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26490  Helix-turn-helix protein  48.94 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  30.12 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  38.98 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1565  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3354  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.604997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 187 aa  42.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5130  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.87 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.87177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  33.33 
 
 		 383 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1291  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0600797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0885  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>