More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4365 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
468 aa  915    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  39.86 
 
 
415 aa  225  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
407 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
397 aa  126  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  35 
 
 
403 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  31.29 
 
 
422 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
401 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  33.94 
 
 
413 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7302  putative two-component system sensor kinase  33.33 
 
 
417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
402 aa  109  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  31.34 
 
 
597 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  38.67 
 
 
325 aa  108  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  37.17 
 
 
529 aa  106  9e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4661  histidine kinase  31.28 
 
 
380 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.249963  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
393 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  30.11 
 
 
423 aa  101  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3803  histidine kinase  38.53 
 
 
374 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.263208  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  34.22 
 
 
2361 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
552 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
412 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  35.71 
 
 
368 aa  97.4  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  32.89 
 
 
399 aa  97.1  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2736  histidine kinase  27.17 
 
 
430 aa  96.7  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.554536  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2170  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
438 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.289043  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2381  histidine kinase-related ATPase, putative  25.08 
 
 
382 aa  96.3  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  32.84 
 
 
457 aa  96.3  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  28.06 
 
 
442 aa  95.5  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  29.52 
 
 
422 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0817  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  32.73 
 
 
466 aa  94.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000394288  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
385 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.884966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  31.49 
 
 
378 aa  94.4  4e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0623  sensor protein UhpB  30.11 
 
 
527 aa  94.4  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
339 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6709  histidine kinase  31.4 
 
 
438 aa  94  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.735832  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  31.97 
 
 
386 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
425 aa  94  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3252  putative two-component system sensor kinase  37.44 
 
 
372 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
451 aa  93.6  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4478  histidine kinase  29.66 
 
 
400 aa  93.2  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.334166 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0748  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.27 
 
 
393 aa  93.2  9e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.279755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  34.62 
 
 
432 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
1168 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33000  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
411 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.250015 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1634  histidine kinase  29.49 
 
 
384 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.262727  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
386 aa  92  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
546 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
352 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  31.58 
 
 
481 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 
421 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5720  histidine kinase  29.65 
 
 
439 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4063  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
372 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0814  signal transduction histidine kinase, glucose-6-phosphate specific  29.61 
 
 
466 aa  91.3  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000114737  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5904  Histidine kinase  32.47 
 
 
399 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0106883  normal  0.0686301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0766  histidine kinase  31.23 
 
 
464 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.701174  normal  0.667801 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
363 aa  90.1  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
584 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5303  putative two-component system sensor kinase  30.55 
 
 
367 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0551174  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  29.81 
 
 
407 aa  90.1  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2483  histidine kinase  29.37 
 
 
514 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.705062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  33.02 
 
 
437 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  34.91 
 
 
580 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  31.6 
 
 
362 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
334 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3039  histidine kinase  35.18 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0758324  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1368  histidine kinase  30.4 
 
 
525 aa  88.6  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672249  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  26.05 
 
 
381 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3360  histidine kinase  34.39 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0262665  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11590  signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
612 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0338093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  35 
 
 
338 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  30.98 
 
 
430 aa  89  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08500  signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.115699  normal  0.612619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
441 aa  87.8  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1797  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  31.65 
 
 
406 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4510  histidine kinase  28.69 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0223002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  30.91 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3640  histidine kinase  33.83 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1657  histidine kinase  26.75 
 
 
366 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.174163  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1019  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.38 
 
 
392 aa  86.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  35.29 
 
 
650 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  30.37 
 
 
401 aa  87  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  30.09 
 
 
383 aa  86.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  28.83 
 
 
385 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1803  putative sensor histidine kinase  27.94 
 
 
366 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1864  sensor histidine kinase, putative  27.94 
 
 
366 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.575815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  33.33 
 
 
405 aa  86.7  9e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  30.93 
 
 
523 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  30.82 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  27.04 
 
 
376 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  27.04 
 
 
376 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1840  putative sensor histidine kinase  27.94 
 
 
368 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4576  histidine kinase  32.27 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312812  normal  0.130927 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
574 aa  85.9  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1050  histidine kinase  31.27 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.183218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  31.97 
 
 
387 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>