214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4347 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4347  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  100 
 
 		 236 aa  470  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0371298  normal  0.659111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2713  hypothetical protein  86.44 
 
 		 236 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0649  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  64.83 
 
 		 237 aa  312  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0469  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  66.67 
 
 		 235 aa  308  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0914  glutamine amidotransferase-like protein  64.83 
 
 		 238 aa  305  3e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3449  glutamine amidotransferase  54.7 
 
 		 240 aa  254  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3223  glutamine amidotransferase  56.89 
 
 		 240 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2660  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  55.32 
 
 		 239 aa  245  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1033  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  51.52 
 
 		 235 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1705  glutamine amidotransferase  50.85 
 
 		 272 aa  198  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192765  hitchhiker  0.00572744 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6530  glutamine amidotransferase  47.83 
 
 		 250 aa  189  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.18713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  45.19 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.824669  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13745  cobyric acid synthase cobQ2  45.85 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000597942  normal  0.560943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4902  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  44.87 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4991  glutamine amidotransferase  44.87 
 
 		 238 aa  184  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5270  glutamine amidotransferase  44.87 
 
 		 238 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5521  glutamine amidotransferase  43.8 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0283  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  46.89 
 
 		 247 aa  176  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1290  glutamine amidotransferase  44.07 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4003  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.29 
 
 		 245 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0007  glutamine amidotransferase  40.97 
 
 		 243 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3272  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.73 
 
 		 242 aa  161  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0012  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  40.58 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0444  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  42.45 
 
 		 243 aa  158  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2008  glutamine amidotransferase  39.61 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0374573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1346  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.25 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000213034  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1484  glutamine amidotransferase  42.22 
 
 		 270 aa  154  9e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3477  glutamine amidotransferase  40.79 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.856737  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3349  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.39 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323164 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1154  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  37.55 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0995  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  43.63 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00101565  normal  0.046971 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1626  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.61 
 
 		 238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1441  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  44.64 
 
 		 235 aa  145  6e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.45382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2070  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  39.65 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0157617  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1026  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  43.13 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1207  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  36.36 
 
 		 243 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000807553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1393  CobB/CobQ family glutamine amidotransferase  36.36 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000283202  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0439  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.05 
 
 		 248 aa  141  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2612  glutamine amidotransferase  35.43 
 
 		 245 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000419892  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2307  glutamine amidotransferase  33.19 
 
 		 240 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0042539  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2170  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.43 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.586275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2123  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  38.43 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0589  glutamine amidotransferase  37.23 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.188888  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0077  CobB/CobQ-like protein  37.9 
 
 		 264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000405616 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1979  glutamine amidotransferase  36.1 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0846367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1784  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  32.88 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000240979  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1945  glutamine amidotransferase  36.1 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2037  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  34.78 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000233635 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1429  cobyric acid synthase, putative  35.85 
 
 		 241 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3001  domain of unknown function DUF1727  38.43 
 
 		 744 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.954679 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0967  glutamine amidotransferase  31.28 
 
 		 243 aa  124  9e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3015  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  39.91 
 
 		 249 aa  122  4e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1558  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  35.5 
 
 		 262 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.115303 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1230  putative glutamine amidotransferase  33.65 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.102244  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0449  glutamine amidotransferase  32.88 
 
 		 235 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0883  cobyric acid synthase, putative  33.04 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1234  cobyric acid synthase  33.9 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4286  CobB/CobQ-like glutamine amidotransferase  34.02 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1207  cobyric acid synthase  35.47 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.295396  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1600  glutamine amidotransferase  34.25 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0984  CobB/CobQ domain protein glutamine amidotransferase  33.01 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000559589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4133  CobB/CobQ domain-containing protein glutamine amidotransferase  34.18 
 
 		 270 aa  110  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.601486  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1789  glutamine amidotransferase  29.91 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.959878  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1783  glutamine amidotransferase  27.49 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000285682 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3692  cobyric acid synthase CobQ  32.72 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  30.73 
 
 		 501 aa  62  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  31.93 
 
 		 493 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1901  cobyric acid synthase  33.33 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.461706 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5723  cobyric acid synthase CobQ  32.12 
 
 		 484 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.501504  normal  0.497712 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3564  cobyric acid synthase  31.87 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0326183  normal  0.13415 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3778  cobyric acid synthase  30.72 
 
 		 488 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.221434 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0375  cobyric acid synthase  23.67 
 
 		 492 aa  57  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0399109  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  33.07 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  27.36 
 
 		 534 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0858  cobyric acid synthase CobQ  28.24 
 
 		 465 aa  55.5  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.924146  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3272  cobyric acid synthase CobQ  34.97 
 
 		 480 aa  55.5  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00599844 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3285  cobyric acid synthase  39.13 
 
 		 525 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.485856  normal  0.893315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  29.6 
 
 		 494 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  29.92 
 
 		 506 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5190  cobyric acid synthase CobQ  32.93 
 
 		 500 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.424958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1457  cobyric acid synthase  24.18 
 
 		 492 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  28.21 
 
 		 534 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4723  cobyric acid synthase CobQ  32.93 
 
 		 500 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  0.401883 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  25.13 
 
 		 503 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3563  cobyric acid synthase  31.25 
 
 		 484 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.637799  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  28.78 
 
 		 481 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1311  cobyric acid synthase  30.43 
 
 		 483 aa  52.4  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.306129  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1274  cobyric acid synthase  30.43 
 
 		 506 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.929502  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0387  cobyric acid synthase CobQ  30.54 
 
 		 488 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2992  cobyric acid synthase  30.51 
 
 		 532 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  30.51 
 
 		 797 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1471  cobyric acid synthase CobQ  31.95 
 
 		 480 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129857 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  27.78 
 
 		 514 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  29.09 
 
 		 485 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  33.63 
 
 		 492 aa  50.8  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  34.62 
 
 		 491 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4257  cobyric acid synthase  33.33 
 
 		 524 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.650213 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5262  cobyric acid synthase CobQ  29.59 
 
 		 488 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.841841 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  28.22 
 
 		 494 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2386  cobyric acid synthase  32.89 
 
 		 524 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>