More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4321 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  100 
 
 
391 aa  762    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2909  sensor histidine kinase  75.79 
 
 
377 aa  522  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  66.85 
 
 
397 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  67.33 
 
 
391 aa  442  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  66.96 
 
 
412 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  57.91 
 
 
392 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  51.95 
 
 
387 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  50.92 
 
 
406 aa  344  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0895  histidine kinase  54.73 
 
 
435 aa  328  9e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0538379  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  50.91 
 
 
422 aa  328  9e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  51.06 
 
 
423 aa  326  5e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  51.14 
 
 
465 aa  308  8e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  50.14 
 
 
394 aa  305  9.000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  53.07 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  51.21 
 
 
393 aa  302  8.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  51.52 
 
 
425 aa  300  3e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  48.94 
 
 
415 aa  300  4e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  49.6 
 
 
409 aa  298  8e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  47.52 
 
 
397 aa  298  8e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  45.14 
 
 
398 aa  292  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  54.84 
 
 
384 aa  282  6.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  54.87 
 
 
416 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  45.09 
 
 
382 aa  259  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  49.61 
 
 
401 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4930  histidine kinase  53.94 
 
 
397 aa  251  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  52.1 
 
 
402 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.85 
 
 
401 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  44.85 
 
 
392 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  44.85 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  44.85 
 
 
392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  43.43 
 
 
397 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 
443 aa  239  5e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6750  histidine kinase  45.95 
 
 
394 aa  238  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.479634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  41.42 
 
 
410 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0403  histidine kinase  47.27 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0336  histidine kinase  46.06 
 
 
410 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  49.28 
 
 
347 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0996  ATP-binding region ATPase domain protein  45.96 
 
 
483 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  49.79 
 
 
257 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.29 
 
 
582 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.22 
 
 
585 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 
587 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
489 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.71 
 
 
581 aa  192  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  40.94 
 
 
587 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.49 
 
 
429 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 
585 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  40.58 
 
 
587 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  40.58 
 
 
587 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  40.58 
 
 
587 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  40.58 
 
 
587 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  40.58 
 
 
587 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  40.22 
 
 
587 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  40.58 
 
 
587 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  40.22 
 
 
587 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
458 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
423 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
592 aa  186  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  43.32 
 
 
599 aa  184  3e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  34.88 
 
 
436 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3839  two-component sensor PhoR  38.91 
 
 
434 aa  182  7e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000175105  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
584 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
437 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  35.14 
 
 
436 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  35.14 
 
 
436 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.63 
 
 
596 aa  181  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
584 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  34.88 
 
 
436 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
453 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  34.88 
 
 
436 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  34.88 
 
 
436 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  36.55 
 
 
437 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  34.88 
 
 
436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  34.88 
 
 
448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  41.67 
 
 
346 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1486  histidine kinase  32.79 
 
 
575 aa  180  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  32.42 
 
 
565 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
456 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  47.92 
 
 
376 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1277  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
439 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1306  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
439 aa  179  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935955  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  37.76 
 
 
363 aa  179  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
589 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  41.54 
 
 
584 aa  178  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  39.06 
 
 
346 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2688  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.84 
 
 
432 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000622001  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  42.28 
 
 
581 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
600 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
346 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  46.12 
 
 
591 aa  177  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4449  histidine kinase  34.07 
 
 
439 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.912128 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  32.88 
 
 
554 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
554 aa  177  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0825  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 
439 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1195  histidine kinase  34.79 
 
 
439 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.843993  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1183  histidine kinase  34.79 
 
 
439 aa  177  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.965515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0488  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
442 aa  176  9e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  31.21 
 
 
598 aa  176  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 
346 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.306668  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2215  histidine kinase  40 
 
 
356 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.269438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>