203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4283 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4283  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
180 aa  361  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.7769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3264  deaminase-reductase domain-containing protein  85.56 
 
 
180 aa  315  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.843644  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3340  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  40.57 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1725  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3554  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  37.77 
 
 
215 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09530  dihydrofolate reductase  39.22 
 
 
193 aa  95.1  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.170117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4238  deaminase-reductase domain-containing protein  37.1 
 
 
180 aa  92.4  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.472551 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1797  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.81 
 
 
180 aa  85.1  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00000739813  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2943  deaminase-reductase domain-containing protein  38.36 
 
 
193 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.385448  normal  0.0142692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2861  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.73 
 
 
199 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2032  riboflavin biosynthesis protein RibD  38.75 
 
 
218 aa  82.4  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.995676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0624  putative riboflavin biosynthesis protein  33.17 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1101  riboflavin biosynthesis protein RibD  33.55 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5268  hypothetical protein  34.15 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7746  hypothetical protein  30.73 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  34.64 
 
 
199 aa  76.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.43 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5367  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  32.54 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1800  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.89 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000587882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1405  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.55 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.326886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3877  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.8 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175903  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.43 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3449  hypothetical protein  33.66 
 
 
193 aa  70.9  0.000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  36.55 
 
 
182 aa  70.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0395  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.5 
 
 
211 aa  70.5  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.282096  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1817  riboflavin biosynthesis protein RibD  31.16 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1612  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.2 
 
 
206 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.978772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0987  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0516935  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.64 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  32.45 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1206  deaminase-reductase domain-containing protein  33.78 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161997  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  28.47 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2307  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.69 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.209299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.49 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4337  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.69 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  27.86 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  33.58 
 
 
180 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3571  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.94 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  30.23 
 
 
180 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.75 
 
 
177 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.84 
 
 
188 aa  62.4  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5756  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.17 
 
 
214 aa  62  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.14 
 
 
184 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3939  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.07 
 
 
206 aa  61.2  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.175221  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3022  deaminase-reductase domain-containing protein  30.68 
 
 
186 aa  61.2  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431336  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0658  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.49 
 
 
181 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.012578  normal  0.222801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2683  deaminase-reductase domain-containing protein  32.65 
 
 
222 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.755992  normal  0.0789677 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  30.77 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0636  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.5 
 
 
176 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0237  bifunctional deaminase-reductase-like protein  36.36 
 
 
173 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0971055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2025  deaminase-reductase domain-containing protein  30.56 
 
 
193 aa  58.9  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34577  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.14 
 
 
175 aa  58.9  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1834  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 
193 aa  58.5  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.244078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4462  deaminase-reductase domain-containing protein  35.95 
 
 
202 aa  58.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  29.58 
 
 
181 aa  58.5  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  27.12 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2892  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.24 
 
 
181 aa  57.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3335  deaminase-reductase domain-containing protein  30.26 
 
 
177 aa  57.8  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  26.9 
 
 
175 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2523  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 
213 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  27.62 
 
 
186 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3760  deaminase-reductase domain-containing protein  30.07 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.873948  hitchhiker  0.00426255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  32.21 
 
 
180 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3583  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.74 
 
 
197 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.255249  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.28 
 
 
176 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.1 
 
 
188 aa  55.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.13 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  23.57 
 
 
172 aa  55.1  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3238  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.93 
 
 
187 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0227971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.88 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  29.35 
 
 
183 aa  55.1  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1023  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.98 
 
 
186 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3180  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  30.97 
 
 
173 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.694404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2685  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.75 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 
186 aa  53.1  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.18 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3761  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.32 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3644  hypothetical protein  30.53 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.57 
 
 
180 aa  52.4  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  26.42 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2843  bifunctional deaminase-reductase-like  39.13 
 
 
215 aa  52  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.14 
 
 
178 aa  52  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  26.03 
 
 
183 aa  52  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0636  deaminase-reductase domain-containing protein  30.57 
 
 
201 aa  51.6  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1292  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.35 
 
 
220 aa  51.2  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0658264  normal  0.0482718 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  22.67 
 
 
173 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  31.93 
 
 
200 aa  51.2  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.51 
 
 
189 aa  50.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.85 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3614  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.41 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33338  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1302  putative deaminase-reductase  32.17 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.557556 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4484  bifunctional deaminase-reductase-like protein  41.56 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0543157  normal  0.0203987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  31.29 
 
 
173 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4214  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.49 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  30.72 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.92 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  30.92 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.83 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0352  deaminase-reductase domain-containing protein  32.62 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.931297  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4102  bifunctional deaminase-reductase domain protein  41.49 
 
 
220 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0938686  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  26.63 
 
 
172 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>