More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4177 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 476 aa  929    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  66.91 
 
 		 424 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  62.7 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  53.93 
 
 		 413 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  47.75 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  46.91 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  52.61 
 
 		 461 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  45.33 
 
 		 450 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  49.87 
 
 		 424 aa  359  5e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  49.47 
 
 		 452 aa  348  1e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  48.74 
 
 		 414 aa  343  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  49.47 
 
 		 428 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  51.37 
 
 		 405 aa  335  9e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  49.48 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  43.93 
 
 		 457 aa  333  3e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  48.9 
 
 		 442 aa  333  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 419 aa  332  6e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  47.51 
 
 		 446 aa  326  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  47.62 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  47.35 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  43.42 
 
 		 450 aa  320  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 413 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 413 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 432 aa  319  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  48.66 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  44.23 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 413 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  44.44 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  51.08 
 
 		 452 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  43.3 
 
 		 425 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  48.01 
 
 		 412 aa  310  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  43.83 
 
 		 403 aa  306  5.0000000000000004e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  47.33 
 
 		 416 aa  306  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  46.97 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  45.14 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  46.97 
 
 		 416 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  48.11 
 
 		 428 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  40.33 
 
 		 494 aa  291  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  44.27 
 
 		 441 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  43.98 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  45.57 
 
 		 412 aa  281  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  42.06 
 
 		 431 aa  280  5e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 426 aa  276  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  43.55 
 
 		 436 aa  273  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  41.55 
 
 		 426 aa  272  9e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  41.42 
 
 		 441 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  41.62 
 
 		 417 aa  266  5.999999999999999e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 509 aa  266  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 406 aa  262  8e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  37.91 
 
 		 426 aa  260  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  41.53 
 
 		 450 aa  260  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  41.32 
 
 		 453 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  41.71 
 
 		 475 aa  252  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 431 aa  246  9e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  40.16 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  39.64 
 
 		 412 aa  241  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  36.91 
 
 		 433 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  35.96 
 
 		 412 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  40.84 
 
 		 418 aa  236  8e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  36.16 
 
 		 421 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  41.8 
 
 		 491 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  35.57 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  39.68 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  33.83 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  34.32 
 
 		 412 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  35.27 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  35.62 
 
 		 474 aa  212  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  33.76 
 
 		 418 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  34.29 
 
 		 410 aa  209  9e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  34.64 
 
 		 440 aa  208  2e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  36.79 
 
 		 431 aa  206  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  33.63 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  38.99 
 
 		 426 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 447 aa  203  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  33.41 
 
 		 424 aa  202  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  35.21 
 
 		 453 aa  199  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  36.52 
 
 		 429 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 441 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 428 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 410 aa  193  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.86 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  36.53 
 
 		 413 aa  192  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 415 aa  191  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 440 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  33.9 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  38.76 
 
 		 426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  36.08 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  34.32 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  29.57 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  34.68 
 
 		 401 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  28.24 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 		 413 aa  177  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  30.25 
 
 		 403 aa  176  6e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  37.43 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  29.84 
 
 		 424 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  31.74 
 
 		 410 aa  173  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>