262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4091 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 135 aa  270  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  58.96 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  51.15 
 
 		 134 aa  145  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  51.16 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  47.45 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  48.51 
 
 		 174 aa  128  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1595  large conductance mechanosensitive channel protein  51.09 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0156  large conductance mechanosensitive channel protein  51.49 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.024147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6609  large conductance mechanosensitive channel protein  44.7 
 
 		 145 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  49.57 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  44.26 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  36.99 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  47.37 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  36.5 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  34.97 
 
 		 152 aa  95.9  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  34.97 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09820  large conductance mechanosensitive channel protein  39.85 
 
 		 132 aa  94.7  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.390629 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  32.31 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  35.76 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  45.8 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  34.03 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  32.21 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  42.15 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  43.31 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  40.18 
 
 		 132 aa  90.5  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0316  large conductance mechanosensitive channel protein  34.27 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000219825  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  41.82 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  32.17 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  44.79 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2978  large conductance mechanosensitive channel protein  38.1 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4838  large-conductance mechanosensitive channel  46.15 
 
 		 144 aa  87  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619813 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  33.8 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  34.27 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  35.21 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  43.75 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  36.52 
 
 		 168 aa  84  7e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4648  large conductance mechanosensitive channel protein  47.47 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.508499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  34.44 
 
 		 148 aa  83.6  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  32.64 
 
 		 146 aa  83.6  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  40.62 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  33.56 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  31.37 
 
 		 151 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  41.74 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  34.75 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2430  large conductance mechanosensitive channel protein  36.57 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.569149  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  40.62 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  36.8 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  36.84 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  41.49 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  30.77 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  34.69 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  34.69 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  37.86 
 
 		 152 aa  76.6  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  30.77 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  28.57 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0785  large-conductance mechanosensitive channel  44.53 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  28.29 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  32.26 
 
 		 125 aa  75.5  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  36.57 
 
 		 166 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1408  large conductance mechanosensitive channel protein  39.09 
 
 		 274 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  33.64 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4294  large-conductance mechanosensitive channel  36.05 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.485783  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4380  large-conductance mechanosensitive channel  36.05 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.443969  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  39.58 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  45.45 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  35.04 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  29.73 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  43.37 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4672  large-conductance mechanosensitive channel  35.37 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.419542  normal  0.906592 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  27.21 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  33.9 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  32.87 
 
 		 151 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  42.17 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  43.37 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  43.37 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  42.17 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  42.17 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  42.17 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  42.17 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  42.17 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  43.37 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  27.21 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  28.1 
 
 		 154 aa  68.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3455  large conductance mechanosensitive channel protein  37.59 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0277457  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0850  large-conductance mechanosensitive channel  30.47 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1892  large-conductance mechanosensitive channel  42.16 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.211789 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  30 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  33.08 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  31.5 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  31.2 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  26.39 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2038  large conductance mechanosensitive channel protein  32.31 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  30.71 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  37.23 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  38.46 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1343  large conductance mechanosensitive channel protein  36.27 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.954232  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  30.16 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  35.45 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  40.86 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>