59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4027 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  100 
 
 
428 aa  822  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  57.82 
 
 
423 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  50.12 
 
 
388 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  48.83 
 
 
415 aa  304  2e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  49.44 
 
 
428 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  43.74 
 
 
388 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  40.67 
 
 
411 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.82332e-08 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  39.57 
 
 
414 aa  230  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  37.14 
 
 
392 aa  229  8e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  44.54 
 
 
403 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  40.52 
 
 
400 aa  222  1e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  43.67 
 
 
400 aa  222  1e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  46.34 
 
 
411 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  43.26 
 
 
396 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  39.95 
 
 
438 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  38.98 
 
 
418 aa  216  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  41.05 
 
 
407 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  35.05 
 
 
412 aa  209  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  41.13 
 
 
422 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  38.92 
 
 
396 aa  199  8e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  32.54 
 
 
385 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  38.93 
 
 
443 aa  173  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  38.24 
 
 
372 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  36.26 
 
 
487 aa  153  6e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  36.78 
 
 
383 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  36.34 
 
 
412 aa  146  8e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  36.34 
 
 
412 aa  146  8e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  36.34 
 
 
369 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  31.2 
 
 
407 aa  145  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  35.53 
 
 
381 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  33.26 
 
 
477 aa  142  8e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  33.6 
 
 
399 aa  140  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  36.36 
 
 
416 aa  136  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  3.64534e-05 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  32.85 
 
 
382 aa  131  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  35.2 
 
 
358 aa  127  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  34.14 
 
 
474 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  34.78 
 
 
399 aa  120  5e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.17 
 
 
402 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  30.95 
 
 
444 aa  109  8e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  27.06 
 
 
420 aa  100  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  25.07 
 
 
399 aa  96.3  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  25.13 
 
 
401 aa  89.4  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  23.73 
 
 
385 aa  77.4  4e-13  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  25 
 
 
419 aa  77.4  5e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.77 
 
 
375 aa  74.3  4e-12  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  26.93 
 
 
417 aa  72  2e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  22.94 
 
 
357 aa  59.3  1e-07  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  23.93 
 
 
383 aa  56.6  8e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2043  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  46.48 
 
 
310 aa  53.5  7e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.625698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  23.48 
 
 
407 aa  47.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  24.57 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  21.32 
 
 
399 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1893  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.43 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  37.23 
 
 
465 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  35.2 
 
 
249 aa  43.5  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1809  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.44 
 
 
298 aa  43.1  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.704562  normal  0.629911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  42.86 
 
 
463 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  32.22 
 
 
262 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2819  methyltransferase small  38.3 
 
 
379 aa  43.1  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>