242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3940 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3285  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.7 
 
 		 913 aa  825    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2554  phosphoenolpyruvate carboxylase  79.98 
 
 		 875 aa  1322    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0748469  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.94 
 
 		 879 aa  1098    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0018  phosphoenolpyruvate carboxykinase (GTP)  46.27 
 
 		 918 aa  722    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0134547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30020  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.62 
 
 		 900 aa  916    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2735  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.83 
 
 		 888 aa  855    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0956137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2973  Phosphoenolpyruvate carboxylase  47.12 
 
 		 927 aa  707    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0974  Phosphoenolpyruvate carboxylase  45.25 
 
 		 955 aa  712    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000578394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4129  Phosphoenolpyruvate carboxylase  67.94 
 
 		 892 aa  1082    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0397  phosphoenolpyruvate carboxylase  62.24 
 
 		 915 aa  975    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  66.11 
 
 		 890 aa  1095    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2248  Phosphoenolpyruvate carboxylase  55.01 
 
 		 891 aa  811    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.182119  hitchhiker  0.000536821 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1398  phosphoenolpyruvate carboxylase  47.55 
 
 		 917 aa  743    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3940  Phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 908 aa  1802    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.622429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.85 
 
 		 931 aa  520  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3806  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.27 
 
 		 907 aa  487  1e-136  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.589788  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.45 
 
 		 933 aa  483  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.6 
 
 		 929 aa  480  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.66 
 
 		 952 aa  472  1.0000000000000001e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.47 
 
 		 906 aa  466  9.999999999999999e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.86 
 
 		 957 aa  464  1e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 938 aa  465  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 		 939 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.07 
 
 		 1018 aa  458  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.95 
 
 		 900 aa  459  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.99 
 
 		 954 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.48 
 
 		 932 aa  445  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.15 
 
 		 926 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.68 
 
 		 1038 aa  439  1e-121  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.94 
 
 		 946 aa  437  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.2 
 
 		 896 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.01 
 
 		 947 aa  433  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.78 
 
 		 898 aa  434  1e-120  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.53 
 
 		 950 aa  435  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.05 
 
 		 1024 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.05 
 
 		 1024 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.15 
 
 		 898 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.52 
 
 		 918 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.68 
 
 		 937 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.62 
 
 		 933 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.05 
 
 		 936 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.77 
 
 		 896 aa  426  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.48 
 
 		 933 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 		 920 aa  425  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.56 
 
 		 1017 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.79 
 
 		 1023 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.4 
 
 		 914 aa  422  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 		 931 aa  422  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.49 
 
 		 945 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.19 
 
 		 997 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.76 
 
 		 937 aa  419  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.1 
 
 		 946 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.27 
 
 		 882 aa  419  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.1 
 
 		 946 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.1 
 
 		 946 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.62 
 
 		 972 aa  419  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.49 
 
 		 928 aa  416  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.5 
 
 		 995 aa  414  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.29 
 
 		 1017 aa  413  1e-114  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 		 1030 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.89 
 
 		 1002 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.29 
 
 		 892 aa  413  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.57 
 
 		 883 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.1 
 
 		 892 aa  414  1e-114  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  30.47 
 
 		 1021 aa  416  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.07 
 
 		 1075 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 1001 aa  412  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.47 
 
 		 994 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.05 
 
 		 929 aa  412  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.58 
 
 		 1009 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.56 
 
 		 936 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.47 
 
 		 930 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.28 
 
 		 954 aa  412  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.26 
 
 		 929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.88 
 
 		 942 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.26 
 
 		 929 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.73 
 
 		 928 aa  409  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 		 949 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 		 940 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.99 
 
 		 1006 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.16 
 
 		 929 aa  405  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 		 896 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.26 
 
 		 949 aa  405  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 		 1002 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.5 
 
 		 934 aa  404  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.74 
 
 		 985 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.36 
 
 		 938 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.4 
 
 		 929 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.88 
 
 		 900 aa  402  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  32.1 
 
 		 938 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.58 
 
 		 945 aa  400  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 		 897 aa  402  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.47 
 
 		 989 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.92 
 
 		 937 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.69 
 
 		 926 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.61 
 
 		 989 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.99 
 
 		 947 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.78 
 
 		 998 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.05 
 
 		 989 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.78 
 
 		 998 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>