260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3860 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3860  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 393 aa  785    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.758933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4114  protein serine/threonine phosphatase  45.61 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1306  protein serine/threonine phosphatase  32.67 
 
 		 406 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0436  Stage II sporulation E family protein  35.09 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.185971  normal  0.30296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5396  protein serine/threonine phosphatase  29.41 
 
 		 412 aa  135  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1626  protein serine/threonine phosphatase  28.53 
 
 		 412 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2171  protein serine/threonine phosphatase  30.79 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.529271  hitchhiker  0.000569605 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4712  protein serine/threonine phosphatase  30.21 
 
 		 431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.883041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3121  protein serine/threonine phosphatase  30.96 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3204  protein serine/threonine phosphatase  32.19 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000275755 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0122  Stage II sporulation E family protein  30.12 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.671125  normal  0.349873 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2194  Stage II sporulation E family protein  31.48 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4365  protein serine/threonine phosphatase  29.57 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2934  protein serine/threonine phosphatase  28.78 
 
 		 406 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3042  protein serine/threonine phosphatase  28.89 
 
 		 492 aa  89.7  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0802508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.58 
 
 		 389 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  27.69 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  30.11 
 
 		 391 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  27.92 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.46 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  22.39 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.99 
 
 		 563 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2829  GAF domain-containing protein  31.84 
 
 		 393 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2453  serine phosphatase  25.91 
 
 		 438 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  28.74 
 
 		 660 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.8 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  23.21 
 
 		 754 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.76 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  28.52 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  25.3 
 
 		 708 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  28.24 
 
 		 451 aa  72.8  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3218  Stage II sporulation E family protein  26.79 
 
 		 630 aa  72.4  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2718  serine phosphatase  30.46 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  30.12 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  30.12 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  30.12 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0959  serine phosphatase  26.32 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  25.74 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  27.62 
 
 		 516 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  31.46 
 
 		 941 aa  70.5  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  26.69 
 
 		 648 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  24.74 
 
 		 516 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.62 
 
 		 606 aa  69.7  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  26.48 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  23.55 
 
 		 678 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3449  response regulator receiver protein  30.73 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3915  stage II sporulation E family protein  30.35 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.688937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1338  serine phosphatase  24.74 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3900  serine phosphatase  30.35 
 
 		 642 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3974  stage II sporulation E family protein  30.35 
 
 		 661 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.135452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.74 
 
 		 465 aa  67.4  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  25.59 
 
 		 644 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0227  stage II sporulation protein E, protein serine/threonine phosphatase  28.72 
 
 		 851 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2618  putative PAS/PAC sensor protein  30.54 
 
 		 685 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.78 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  24.15 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.74 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  23.26 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  28.24 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  22.47 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  25.63 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1421  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.25 
 
 		 995 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  23.36 
 
 		 684 aa  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  23.81 
 
 		 423 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  26.12 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  27.22 
 
 		 683 aa  62  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.94 
 
 		 728 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  23.68 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.38 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  28.91 
 
 		 645 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  28.85 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  25.74 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  29.51 
 
 		 671 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  25.1 
 
 		 705 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4764  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.91 
 
 		 482 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0579698  hitchhiker  0.0000553449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2748  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.38 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  28.25 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0186  protein serine/threonine phosphatase  28.99 
 
 		 512 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1832  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 		 543 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1253  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.84 
 
 		 1332 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2796  cyclic nucleotide-binding protein  25.49 
 
 		 453 aa  60.5  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.180681  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  23.95 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  23.69 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2035  serine phosphatase  25.3 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  22.55 
 
 		 584 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  27.88 
 
 		 467 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  22.89 
 
 		 705 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  30.62 
 
 		 361 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  27.56 
 
 		 708 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.51 
 
 		 516 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.95 
 
 		 1480 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0739  serine phosphatase  23.16 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.339985  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.92 
 
 		 1004 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.83 
 
 		 470 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3351  stage II sporulation E family protein  27.46 
 
 		 278 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  27.37 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.34 
 
 		 385 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  24.89 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>