38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3828 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3828  Conserved TM helix repeat-containing protein  100 
 
 		 265 aa  514  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0517  hypothetical protein  56.27 
 
 		 275 aa  253  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.328951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16810  hypothetical protein  50 
 
 		 257 aa  221  8e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.403378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1787  TM helix repeat-containing protein  57.2 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1740  TM helix protein  57.2 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1751  TM helix repeat-containing protein  53.01 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.232886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1719  TM helix repeat-containing protein  56.38 
 
 		 335 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.082128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1737  TM helix repeat-containing protein  54.1 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.5984  decreased coverage  0.000938993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5533  TM helix repeat-containing protein  46.18 
 
 		 272 aa  178  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  0.837846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5911  TM helix repeat-containing protein  45.38 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1329  TM helix repeat-containing protein  45.23 
 
 		 297 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00100917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0074  hypothetical protein  34.88 
 
 		 358 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7234  hypothetical protein  34.15 
 
 		 460 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.273739  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1406  TM helix protein  25.94 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0345535  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1684  TM helix repeat-containing protein  28.77 
 
 		 499 aa  64.3  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1981  TM helix repeat-containing protein  26.15 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0913829  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0909  TM helix repeat-containing protein  26.09 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1301  TM helix repeat-containing protein  30.28 
 
 		 543 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2159  TM helix protein  24.77 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.760211  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2252  TM helix repeat-containing protein  30.14 
 
 		 525 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1329  TM helix repeat-containing protein  29.58 
 
 		 543 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521958 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2091  hypothetical protein  28.18 
 
 		 582 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.395964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4747  TM helix repeat-containing protein  27.81 
 
 		 275 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00173258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2407  TM helix protein  27.62 
 
 		 565 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.533371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1787  TM helix protein  31.43 
 
 		 494 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2021  TM helix repeat-containing protein  25.79 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.0315066 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1704  TM helix repeat-containing protein  26.4 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2078  TM helix protein  24.06 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1614  TM helix repeat-containing protein  27.49 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.232731  normal  0.487938 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0961  hypothetical protein  21.39 
 
 		 274 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0269  TM helix protein  24.41 
 
 		 306 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1308  hypothetical protein  22.4 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0455  TM helix repeat-containing protein  31.96 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1708  TM helix protein  29 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0232168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0638  hypothetical protein  27.78 
 
 		 278 aa  42.7  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0500  TM helix protein  25.49 
 
 		 547 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.587519  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0423  TM helix protein  26.8 
 
 		 306 aa  42.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1056  TM helix repeat-containing protein  25.36 
 
 		 229 aa  42  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0376279  normal  0.186599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>