More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3780 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3780  Peptidylprolyl isomerase  100 
 
 
228 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.685255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2820  peptidylprolyl isomerase  59.03 
 
 
206 aa  247  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.400749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0028  Peptidylprolyl isomerase  58.93 
 
 
177 aa  187  9e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.189916  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0017  peptidylprolyl isomerase  59.39 
 
 
187 aa  187  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.516433 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0817  peptidylprolyl isomerase  58.79 
 
 
181 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.104667  normal  0.714543 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00710  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  59.76 
 
 
176 aa  185  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3069  peptidylprolyl isomerase  57.49 
 
 
174 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00667109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0518  Peptidylprolyl isomerase  57.23 
 
 
172 aa  183  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00260  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  64.5 
 
 
182 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.06558 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5243  Peptidylprolyl isomerase  55.17 
 
 
174 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0323546  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0068  Peptidylprolyl isomerase  61.21 
 
 
178 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6492  Peptidylprolyl isomerase  50.54 
 
 
287 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  61.02 
 
 
184 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499869  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2912  Peptidylprolyl isomerase  55.42 
 
 
172 aa  178  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.530558  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1946  hypothetical protein  55.03 
 
 
188 aa  176  2e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0019  Peptidylprolyl isomerase  56.8 
 
 
173 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567765  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0010  peptidylprolyl isomerase  61.82 
 
 
175 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0010  peptidylprolyl isomerase  61.82 
 
 
175 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0018  peptidylprolyl isomerase  61.82 
 
 
175 aa  175  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381111  normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0059  peptidylprolyl isomerase  55.81 
 
 
176 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.958253  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0013  Peptidylprolyl isomerase  55.23 
 
 
181 aa  174  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000477678 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4444  peptidylprolyl isomerase  54.17 
 
 
175 aa  175  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  0.482225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0105  Peptidylprolyl isomerase  55.17 
 
 
178 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.268329  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0018  Peptidylprolyl isomerase  56.57 
 
 
179 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00130  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  54.29 
 
 
179 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1854  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  53.7 
 
 
376 aa  173  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2561  peptidylprolyl isomerase  55.29 
 
 
176 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0012  peptidylprolyl isomerase  55.81 
 
 
181 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0508371  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1936  hypothetical protein  55.03 
 
 
188 aa  172  2.9999999999999996e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0013  Peptidylprolyl isomerase  60.48 
 
 
182 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0020  Peptidylprolyl isomerase  61.21 
 
 
173 aa  172  5.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10009  iron-regulated peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase A ppiA  61.21 
 
 
182 aa  171  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0124  peptidylprolyl isomerase  54.17 
 
 
175 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.671624  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0057  Peptidylprolyl isomerase  61.4 
 
 
176 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1668  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  51.14 
 
 
201 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00512404  normal  0.631105 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0109  Peptidylprolyl isomerase  62.87 
 
 
182 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4482  peptidylprolyl isomerase  60 
 
 
176 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0108931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4996  peptidylprolyl isomerase  60.48 
 
 
176 aa  168  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.120878  hitchhiker  0.000125843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0294  Peptidylprolyl isomerase  57.49 
 
 
170 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0893  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  54.07 
 
 
178 aa  166  4e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0022  Peptidylprolyl isomerase  60.23 
 
 
177 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.721658  normal  0.0469829 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0022  Peptidylprolyl isomerase  61.45 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.424958  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0164  Peptidylprolyl isomerase  57.71 
 
 
179 aa  162  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.299152 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0045  Peptidylprolyl isomerase  53.93 
 
 
193 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10708  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  49.4 
 
 
378 aa  161  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0011  Peptidylprolyl isomerase  57.14 
 
 
179 aa  159  5e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3601  Peptidylprolyl isomerase  42.37 
 
 
241 aa  158  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.840173  hitchhiker  0.00334322 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2367  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  52.73 
 
 
372 aa  157  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.153158  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2580  peptidylprolyl isomerase  50.3 
 
 
266 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0676  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.56 
 
 
468 aa  155  4e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00095762  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14660  predicted protein  46.49 
 
 
178 aa  154  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014674  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1591  Peptidylprolyl isomerase  53.98 
 
 
179 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0017  peptidylprolyl isomerase  58.54 
 
 
170 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0498338  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2368  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  51.52 
 
 
357 aa  151  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0638959  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative  45.95 
 
 
657 aa  151  7e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1136  Peptidylprolyl isomerase  53.33 
 
 
161 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39722  predicted protein  40.27 
 
 
571 aa  149  3e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0613  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  50.36 
 
 
202 aa  148  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0308143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1482  peptidylprolyl isomerase  48.28 
 
 
376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07190  probable peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  55.4 
 
 
310 aa  145  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301434  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  53.49 
 
 
189 aa  144  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.63935  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1004  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.35 
 
 
195 aa  144  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00627317  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1852  Peptidylprolyl isomerase  51.41 
 
 
181 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02546  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  54.17 
 
 
164 aa  143  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00140  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (rotamase) - cyclophilin family  55.81 
 
 
172 aa  142  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.439146  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2191  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  53.19 
 
 
310 aa  142  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00827429  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00380  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G01750)  49.09 
 
 
629 aa  142  5e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.156652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2216  peptidylprolyl isomerase  49.69 
 
 
254 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000598862 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01490  cyclophilin-like peptidyl prolyl cis-trans isomerase, putative  46.11 
 
 
174 aa  142  6e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1652  peptidylprolyl isomerase  55.69 
 
 
168 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2206  Peptidylprolyl isomerase  63.91 
 
 
168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2294  Peptidylprolyl isomerase  63.91 
 
 
168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0333378  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0504  peptidylprolyl isomerase  50.34 
 
 
181 aa  139  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0012  peptidylprolyl isomerase  55.56 
 
 
180 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0105  Peptidylprolyl isomerase  49.03 
 
 
172 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0969  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.16 
 
 
196 aa  138  6e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1981  Peptidylprolyl isomerase  46.78 
 
 
222 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34689 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1859  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  49.13 
 
 
197 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000317427  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38525  predicted protein  45.12 
 
 
665 aa  136  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_18195  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.37 
 
 
160 aa  136  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.896835  normal  0.71444 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14434  predicted protein  46.01 
 
 
533 aa  136  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.191518  normal  0.369132 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40159  Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.37 
 
 
629 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.152782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0323  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  39.8 
 
 
466 aa  135  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0551  peptidylprolyl isomerase  53.57 
 
 
164 aa  135  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0789  Peptidylprolyl isomerase  54.26 
 
 
163 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.191731  normal  0.0671641 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1444  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  51.77 
 
 
310 aa  135  5e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2219  peptidylprolyl isomerase  53.33 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0486  peptidylprolyl isomerase  53.57 
 
 
164 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1165  peptidylprolyl isomerase  44.72 
 
 
156 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1082  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.97 
 
 
160 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0949  Peptidylprolyl isomerase  51.57 
 
 
197 aa  132  5e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.436598  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3720  peptidylprolyl isomerase  50.28 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.392854  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1100  Peptidylprolyl isomerase  53.12 
 
 
147 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.377046  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2157  peptidylprolyl isomerase  52.69 
 
 
168 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1711  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  41.05 
 
 
195 aa  131  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.756281  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43430  predicted protein  45.06 
 
 
184 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00586531  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1534  peptidylprolyl isomerase  40.8 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.861621  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00200  conserved hypothetical protein  46.11 
 
 
573 aa  129  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0125915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0070  peptidylprolyl isomerase  48.57 
 
 
194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2344  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  48.92 
 
 
139 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>