38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3773 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3773  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.761879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2521  hypothetical protein  63.41 
 
 		 297 aa  256  5e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4083  hypothetical protein  47.83 
 
 		 314 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1370  hypothetical protein  43.96 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1372  hypothetical protein  39.87 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0439  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.773659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7625  putative integral membrane protein  44.6 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.371548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5183  hypothetical protein  42.86 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0743  hypothetical protein  45.24 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0741  hypothetical protein  44.77 
 
 		 320 aa  155  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.133882 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1327  hypothetical protein  45.1 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299611  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2359  hypothetical protein  47.19 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.986223  hitchhiker  0.00967269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1186  putative integral membrane protein  37.24 
 
 		 340 aa  127  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.114103 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2552  hypothetical protein  42.7 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3864  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325314 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4294  putative integral membrane protein  37.45 
 
 		 348 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2122  hypothetical protein  29.88 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05451  hypothetical protein  22.13 
 
 		 321 aa  62.4  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.291486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2689  hypothetical protein  26.04 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5232  hypothetical protein  25.81 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4939  hypothetical protein  26.91 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1960  hypothetical protein  33.07 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0759  hypothetical protein  27.4 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3850  hypothetical protein  26.74 
 
 		 343 aa  53.5  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001054  hypothetical protein  25.68 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.331608  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1821  hypothetical protein  22.67 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07041  hypothetical protein  30.19 
 
 		 327 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05151  hypothetical protein  21.4 
 
 		 320 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.601459  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05441  hypothetical protein  21.81 
 
 		 318 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180339  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0489  hypothetical protein  20.14 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.418577  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2414  hypothetical protein  23.42 
 
 		 307 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2712  hypothetical protein  23.02 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3697  hypothetical protein  21.63 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.500857 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0667  hypothetical protein  30.07 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.964376  normal  0.807997 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0238  hypothetical protein  25.25 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04891  hypothetical protein  18.93 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.879079 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  27.88 
 
 		 392 aa  44.3  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1693  hypothetical protein  29.39 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>