More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3729 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 
558 aa  1092    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  63.44 
 
 
552 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  43.94 
 
 
604 aa  402  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.88 
 
 
600 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.73 
 
 
543 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.69 
 
 
596 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.23 
 
 
618 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.46 
 
 
580 aa  365  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  46.83 
 
 
427 aa  329  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.36 
 
 
698 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  39.34 
 
 
631 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.62 
 
 
528 aa  311  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.56 
 
 
543 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  49.44 
 
 
420 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.59 
 
 
583 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  32.9 
 
 
589 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  32.27 
 
 
845 aa  280  7e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.96 
 
 
582 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  37.21 
 
 
966 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  32.5 
 
 
520 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  29.01 
 
 
997 aa  264  3e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.24 
 
 
573 aa  263  4.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  32.65 
 
 
585 aa  258  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  43.51 
 
 
656 aa  258  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  33.02 
 
 
592 aa  254  3e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.21 
 
 
1018 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.86 
 
 
953 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.93 
 
 
591 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  37.08 
 
 
444 aa  251  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 
624 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  31.6 
 
 
1012 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.28 
 
 
426 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  32.51 
 
 
517 aa  242  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  29.91 
 
 
990 aa  241  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  40.98 
 
 
511 aa  238  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  28.81 
 
 
971 aa  237  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.67 
 
 
568 aa  236  7e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  32.96 
 
 
541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  33.62 
 
 
992 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.14 
 
 
598 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07520  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.52 
 
 
499 aa  229  7e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.139948 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.05 
 
 
976 aa  229  8e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  37.47 
 
 
633 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  33.76 
 
 
1003 aa  223  6e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  35.2 
 
 
575 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  30.85 
 
 
637 aa  218  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  39.84 
 
 
699 aa  219  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  39.31 
 
 
699 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  27.34 
 
 
1007 aa  217  5e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  41.78 
 
 
511 aa  216  5.9999999999999996e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  39.58 
 
 
699 aa  217  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  31.9 
 
 
688 aa  216  9e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  39.58 
 
 
699 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.66 
 
 
534 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.66 
 
 
534 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  33.55 
 
 
734 aa  211  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  37.32 
 
 
542 aa  208  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  36.14 
 
 
575 aa  208  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00592  Beta-hexosaminidase A precursor  40.93 
 
 
673 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36 
 
 
537 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  42.86 
 
 
520 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  42.11 
 
 
492 aa  205  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  44.63 
 
 
498 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.39 
 
 
594 aa  203  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  44.24 
 
 
552 aa  203  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0470  b-N-acetylglucosaminidase, glycoside hydrolase family 3 protein  34.64 
 
 
395 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.22 
 
 
373 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  27.43 
 
 
528 aa  197  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  43.29 
 
 
499 aa  196  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  39.13 
 
 
503 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  38.23 
 
 
365 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.67 
 
 
1002 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4512  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.64 
 
 
482 aa  193  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.625596  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  41.31 
 
 
538 aa  193  8e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1972  glycosy hydrolase family protein  36.24 
 
 
374 aa  192  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2055  glycosy hydrolase family protein  37.61 
 
 
378 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.57 
 
 
365 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  39.57 
 
 
484 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.57 
 
 
365 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0719  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.47 
 
 
392 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2813  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.96 
 
 
375 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2578  glycoside hydrolase family 3 protein  35.34 
 
 
375 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  40.53 
 
 
504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  36.94 
 
 
386 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4013  Beta-N-acetylhexosaminidase  28.79 
 
 
559 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2172  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
375 aa  182  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1402  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.68 
 
 
530 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2928  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.57 
 
 
382 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  39.39 
 
 
365 aa  181  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.23 
 
 
543 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  39.23 
 
 
538 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2890  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.19 
 
 
553 aa  178  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.301856  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.4 
 
 
490 aa  178  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01416  beta-N-acetylglucosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04060)  32.29 
 
 
923 aa  177  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.249687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 
361 aa  176  7e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0163  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.36 
 
 
379 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0101171  normal  0.219232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  35.76 
 
 
490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2559  Beta-N-acetylhexosaminidase  37.5 
 
 
398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0717  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.8 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0128  glycoside hydrolase family 3 protein  45.11 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.174382  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>