More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3649 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0072  glycerol kinase  65.73 
 
 		 498 aa  657    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.811469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06800  glycerol kinase  62.23 
 
 		 505 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.998961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4607  glycerol kinase  69.52 
 
 		 507 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0538756  normal  0.18472 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0389  glycerol kinase  62.98 
 
 		 504 aa  638    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.171673  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29920  glycerol kinase  62.77 
 
 		 514 aa  646    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7485  glycerol kinase  67.94 
 
 		 505 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5127  glycerol kinase  69.94 
 
 		 507 aa  700    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0787  glycerol kinase  76.66 
 
 		 500 aa  780    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.856633  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5299  glycerol kinase  65.48 
 
 		 503 aa  653    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5042  glycerol kinase  65.67 
 
 		 505 aa  662    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0497  glycerol kinase  69.94 
 
 		 507 aa  697    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.493772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3649  glycerol kinase  100 
 
 		 499 aa  1019    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0485  glycerol kinase  63.82 
 
 		 505 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.361575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3902  glycerol kinase  64.59 
 
 		 499 aa  634    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05770  glycerol kinase  64.87 
 
 		 504 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3291  glycerol kinase  65.33 
 
 		 505 aa  672    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.503481  hitchhiker  0.00561872 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1768  glycerol kinase  63.91 
 
 		 498 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1021  glycerol kinase  64.52 
 
 		 522 aa  650    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0896749  normal  0.284515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6409  glycerol kinase  66.33 
 
 		 504 aa  665    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1798  glycerol kinase  64.99 
 
 		 502 aa  636    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.603788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1919  glycerol kinase  75.45 
 
 		 497 aa  778    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.460363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0558  glycerol kinase  63.44 
 
 		 506 aa  653    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000280451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3917  glycerol kinase  63.84 
 
 		 499 aa  633  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1985  glycerol kinase  63.67 
 
 		 504 aa  631  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119795 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23050  glycerol kinase  63.8 
 
 		 510 aa  624  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15590  glycerol kinase  65.04 
 
 		 514 aa  624  1e-177  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.208439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2248  glycerol kinase  62.87 
 
 		 504 aa  624  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0805048  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2178  glycerol kinase  62.53 
 
 		 501 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.976336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2384  glycerol kinase  62.37 
 
 		 499 aa  618  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1434  glycerol kinase  60.48 
 
 		 503 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.12289  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2094  glycerol kinase  59.64 
 
 		 505 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.141027 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5935  glycerol kinase  62.78 
 
 		 500 aa  607  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1000  glycerol kinase  61.52 
 
 		 504 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0798  glycerol kinase  61.9 
 
 		 496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.421282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2331  glycerol kinase  61.9 
 
 		 499 aa  600  1e-170  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1395  glycerol kinase  60 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000530901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4220  glycerol kinase  61.08 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.517314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1086  glycerol kinase  61.17 
 
 		 499 aa  593  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0915009  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5040  glycerol kinase  59.96 
 
 		 502 aa  586  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0380  glycerol kinase  58.96 
 
 		 507 aa  585  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5241  glycerol kinase  57.46 
 
 		 510 aa  579  1e-164  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4547  glycerol kinase  60.73 
 
 		 501 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4433  glycerol kinase  60.12 
 
 		 501 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4873  glycerol kinase  57.26 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4066  glycerol kinase  59.72 
 
 		 501 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.737182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4962  glycerol kinase  57.26 
 
 		 510 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13727  glycerol kinase  57.85 
 
 		 517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.45379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1214  glycerol kinase  57.6 
 
 		 505 aa  568  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5124  glycerol kinase  59.44 
 
 		 506 aa  559  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5304  glycerol kinase  57.97 
 
 		 507 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5467  glycerol kinase  58.25 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1327  glycerol kinase  58.17 
 
 		 505 aa  550  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.412698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3321  glycerol kinase  53.01 
 
 		 499 aa  546  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.24675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1008  glycerol kinase  56.89 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822011  hitchhiker  0.00553696 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1553  glycerol kinase  54.42 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2514  glycerol kinase  52.64 
 
 		 510 aa  541  1e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.29996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0419  glycerol kinase  52.21 
 
 		 499 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.33105 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2963  glycerol kinase  52.56 
 
 		 513 aa  542  1e-153  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0867  glycerol kinase  51.83 
 
 		 499 aa  538  9.999999999999999e-153  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.111674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0638  glycerol kinase  52.41 
 
 		 499 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0284  glycerol kinase  53.01 
 
 		 498 aa  540  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1465  glycerol kinase  54.58 
 
 		 505 aa  539  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1359  glycerol kinase  51.42 
 
 		 498 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00195196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4610  glycerol kinase  56.2 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.440109 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0619  glycerol kinase  51.49 
 
 		 500 aa  535  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1385  glycerol kinase  51.42 
 
 		 498 aa  537  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0514122  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0494  glycerol kinase  55.8 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0948  glycerol kinase  52.03 
 
 		 496 aa  529  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000269449  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4417  glycerol kinase  53.51 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0934  glycerol kinase  52.29 
 
 		 527 aa  529  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1020  glycerol kinase  52.02 
 
 		 497 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0055  glycerol kinase  53.6 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1122  glycerol kinase  51.67 
 
 		 513 aa  530  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4415  glycerol kinase  53.51 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2067  glycerol kinase  50.8 
 
 		 500 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469281  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4302  glycerol kinase  53.51 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4485  glycerol kinase  53.51 
 
 		 502 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2678  glycerol kinase  50.8 
 
 		 500 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2707  glycerol kinase  50.8 
 
 		 500 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.160178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2463  glycerol kinase  55.6 
 
 		 505 aa  531  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2436  glycerol kinase  55.6 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4332  glycerol kinase  53.31 
 
 		 502 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0533738  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7482  glycerol kinase  55.4 
 
 		 505 aa  525  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6006  glycerol kinase  50.5 
 
 		 505 aa  527  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0794993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2603  glycerol kinase  50.2 
 
 		 500 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.817773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0682  glycerol kinase  53.94 
 
 		 505 aa  526  1e-148  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1322  glycerol kinase  52.94 
 
 		 496 aa  528  1e-148  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.537601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2876  glycerol kinase  51.41 
 
 		 500 aa  525  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2559  glycerol kinase  51.21 
 
 		 500 aa  527  1e-148  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2731  glycerol kinase  50.4 
 
 		 500 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3168  glycerol kinase  52.89 
 
 		 507 aa  528  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4047  glycerol kinase  53.49 
 
 		 502 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1364  glycerol kinase  53.44 
 
 		 496 aa  525  1e-148  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1029  glycerol kinase  52.83 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.21153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0807  glycerol kinase  52.03 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000315642  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0906  glycerol kinase  50.4 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4681  glycerol kinase  52.43 
 
 		 494 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.648243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4233  glycerol kinase  51.22 
 
 		 496 aa  523  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000910223  decreased coverage  0.00000000961259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2688  glycerol kinase  55.05 
 
 		 496 aa  521  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0725  glycerol kinase  50.4 
 
 		 518 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.315112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>