225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3558 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3558  LamB/YcsF family protein  100 
 
 
255 aa  506  1e-142  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.455471  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1970  LamB/YcsF family protein  71.2 
 
 
254 aa  357  1e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149579  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0177  LamB/YcsF family protein  64.52 
 
 
252 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2198  LamB/YcsF family protein  69.35 
 
 
250 aa  323  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.929247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0093  LamB/YcsF family protein  62.5 
 
 
252 aa  310  1e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  58.96 
 
 
256 aa  306  2e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0099  LamB/YcsF family protein  63.49 
 
 
254 aa  301  7e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0180068 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0497  LamB/YcsF family protein  60.24 
 
 
254 aa  298  4e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0608  LamB/YcsF family protein  59.76 
 
 
253 aa  296  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.329744  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  65.73 
 
 
254 aa  295  4e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5112  LamB/YcsF family protein  62.25 
 
 
254 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4727  LamB/YcsF family protein  62.25 
 
 
254 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.812327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4813  LamB/YcsF family protein  62.25 
 
 
254 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.297543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3513  LamB/YcsF family protein  59.6 
 
 
251 aa  291  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.655915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  58.33 
 
 
252 aa  290  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19260  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  61.45 
 
 
255 aa  289  2e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5927  LamB/YcsF family protein  62.15 
 
 
252 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286455  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5327  LamB/YcsF family protein  60.16 
 
 
254 aa  288  5e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  56.05 
 
 
254 aa  288  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09670  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  62.25 
 
 
253 aa  288  8e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.33099 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00400  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  59.27 
 
 
252 aa  281  5e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.736442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0320  LamB/YcsF family protein  59.84 
 
 
257 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  56.85 
 
 
255 aa  279  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0083  LamB/YcsF family protein  60.89 
 
 
304 aa  278  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2973  LamB/YcsF family protein  60.24 
 
 
301 aa  278  9e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0191185  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0870  LamB/YcsF family protein  58 
 
 
255 aa  277  9e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.781458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7092  hypothetical protein  59.76 
 
 
251 aa  273  1e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105335  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1451  LamB/YcsF family protein  63.05 
 
 
252 aa  273  2e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0541  LamB/YcsF family protein  56.85 
 
 
249 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  50.59 
 
 
254 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0535  LamB/YcsF family protein  56.75 
 
 
256 aa  256  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.884685  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2401  LamB/YcsF family protein  55.25 
 
 
258 aa  254  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0096  LamB/YcsF family protein  56.63 
 
 
249 aa  253  2e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000523388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0975  LamB/YcsF family protein  54.88 
 
 
250 aa  251  7e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0323656  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0592  LamB/YcsF family protein  53.23 
 
 
264 aa  249  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413581  normal  0.62944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2834  LamB/YcsF family protein  52.19 
 
 
254 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.886287  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 
258 aa  248  7e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0313  LamB/YcsF family protein  53.01 
 
 
249 aa  248  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0099  LamB/YcsF family protein  55.2 
 
 
255 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2622  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 
255 aa  242  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 
255 aa  241  7e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2770  LamB/YcsF family protein  54.55 
 
 
299 aa  239  3e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00407074  hitchhiker  1.26458e-05 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
257 aa  236  3e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2634  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 
254 aa  235  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.412357  decreased coverage  4.04715e-05 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 
255 aa  234  1e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  45.67 
 
 
257 aa  233  2e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  49.2 
 
 
250 aa  232  4e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  48.59 
 
 
274 aa  229  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29760  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  53.98 
 
 
255 aa  229  5e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1503  LamB/YcsF family protein  46.03 
 
 
255 aa  226  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  46.4 
 
 
250 aa  226  2e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  42.69 
 
 
255 aa  224  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2272  LamB/YcsF family protein  49.4 
 
 
255 aa  223  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  48.29 
 
 
255 aa  222  5e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  42.28 
 
 
253 aa  221  1e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1029  LamB/YcsF family protein  48.52 
 
 
250 aa  220  1e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  42.11 
 
 
253 aa  221  1e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2802  LamB/YcsF family protein  46.77 
 
 
273 aa  220  1e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.785043 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  42.34 
 
 
255 aa  219  2e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  42 
 
 
255 aa  220  2e-56  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3392  LamB/YcsF family protein  46.53 
 
 
253 aa  219  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0612122 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  42.97 
 
 
256 aa  219  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5814  LamB/YcsF family protein  47.01 
 
 
257 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492113  normal  0.0676141 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  45.31 
 
 
251 aa  218  7e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 
254 aa  218  7e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  41.94 
 
 
255 aa  218  8e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 
253 aa  218  9e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2936  LamB/YcsF family protein  44.53 
 
 
251 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0465  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 
261 aa  217  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  44.53 
 
 
254 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 
253 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  42.45 
 
 
252 aa  216  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2862  hypothetical protein  44.13 
 
 
252 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191254  normal  0.477951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5021  LamB/YcsF family protein  48.19 
 
 
260 aa  216  3e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  43.83 
 
 
253 aa  216  3e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2920  hypothetical protein  44.53 
 
 
252 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.9923  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2722  hypothetical protein  44.58 
 
 
251 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.453  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 
253 aa  215  6e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  41.46 
 
 
253 aa  215  6e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  41.46 
 
 
253 aa  215  6e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2118  hypothetical protein  44.13 
 
 
252 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624243  normal  0.300984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12450  hypothetical protein  48.36 
 
 
250 aa  214  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.858403  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  48.39 
 
 
256 aa  214  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2772  hypothetical protein  44.13 
 
 
252 aa  214  1e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4098  LamB/YcsF family protein  45.08 
 
 
259 aa  214  1e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152851  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0005  hypothetical protein  44.08 
 
 
270 aa  213  2e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76896  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0807  hypothetical protein  47.35 
 
 
247 aa  213  2e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  40.89 
 
 
253 aa  213  3e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0274  hypothetical protein  44.31 
 
 
266 aa  211  8e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1723  hypothetical protein  44.31 
 
 
266 aa  211  8e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0366  hypothetical protein  44.31 
 
 
266 aa  211  8e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 
250 aa  211  8e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  41.2 
 
 
250 aa  211  8e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0902  LamB/YcsF family protein  47.43 
 
 
255 aa  210  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58540  hypothetical protein  48.77 
 
 
251 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27032  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  48 
 
 
260 aa  209  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4577  LamB/YcsF family protein  44.96 
 
 
258 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.701806  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5077  LamB/YcsF family protein  48 
 
 
255 aa  210  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.709601  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4561  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 
260 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.249278  normal  0.157453 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  47.11 
 
 
254 aa  209  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>