177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3530 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  100 
 
 		 235 aa  464  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4740  transcriptional regulator, TetR family  56.38 
 
 		 196 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  0.406356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  50 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 202 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  105  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1023  regulatory protein TetR  37.24 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.932216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  29.52 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20410  transcriptional regulator, tetR family  32.35 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.539092  normal  0.887832 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 383 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  36.07 
 
 		 266 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 206 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 234 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  30.58 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  36.73 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2681  regulatory protein TetR  25.82 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  23 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 202 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  22.28 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.5 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1467  hypothetical protein  29.22 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.165444  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 190 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2696  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000528624  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  31.53 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  45.1 
 
 		 182 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 188 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  28.5 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 189 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 237 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 202 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 193 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 204 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>