More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3516 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
388 aa  736    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  45.26 
 
 
388 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  49.48 
 
 
374 aa  242  7e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.08 
 
 
433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  45.56 
 
 
365 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  41.67 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  46.26 
 
 
463 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
405 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.26 
 
 
386 aa  176  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.22 
 
 
403 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
444 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  39.76 
 
 
452 aa  169  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  46.93 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 
586 aa  166  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.93 
 
 
395 aa  166  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
428 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  47.16 
 
 
402 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  43.61 
 
 
420 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 
326 aa  157  3e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  45.13 
 
 
435 aa  157  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  37.84 
 
 
429 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
435 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
435 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.46 
 
 
435 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.95 
 
 
417 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  51.26 
 
 
439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  38.44 
 
 
410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  45.33 
 
 
412 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.88 
 
 
375 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
461 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
445 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  42.02 
 
 
434 aa  150  5e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  48.37 
 
 
624 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  35.87 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
445 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  42.29 
 
 
489 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  36 
 
 
405 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  38.31 
 
 
429 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 
343 aa  143  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  43.88 
 
 
476 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
418 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.32 
 
 
415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
621 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  43.56 
 
 
434 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 
570 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  43.06 
 
 
383 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.25 
 
 
466 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  47.93 
 
 
463 aa  137  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.66 
 
 
438 aa  136  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  38.56 
 
 
433 aa  135  9e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  35.39 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  43.7 
 
 
444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  40.26 
 
 
430 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  35.98 
 
 
442 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  43.84 
 
 
438 aa  132  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  45.11 
 
 
429 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  44.1 
 
 
389 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 
408 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.27 
 
 
417 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
408 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  42.93 
 
 
587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  44.12 
 
 
426 aa  126  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  38.01 
 
 
410 aa  125  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.55 
 
 
725 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.47 
 
 
508 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  42.93 
 
 
580 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
431 aa  120  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  38.04 
 
 
446 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
382 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.6 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
465 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
459 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  34.46 
 
 
419 aa  112  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  37.89 
 
 
237 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.79 
 
 
565 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
454 aa  106  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.61 
 
 
398 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
447 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
537 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
618 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.227088  decreased coverage  0.00155525 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  34.86 
 
 
453 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
594 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
386 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
775 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
469 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
576 aa  90.5  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3408  histidine kinase  42.27 
 
 
686 aa  90.5  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000158036  hitchhiker  0.000062789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4453  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
376 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2444  histidine kinase  37.44 
 
 
425 aa  89  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000824837  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  39.65 
 
 
470 aa  89.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
490 aa  88.2  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3427  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 
564 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
407 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0560  histidine kinase  30 
 
 
670 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.618015  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  32.72 
 
 
462 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>