47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3466 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
295 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  75.52 
 
 
288 aa  418  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  58.3 
 
 
273 aa  322  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  54.78 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  32.38 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  33.19 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  33.65 
 
 
291 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  29.8 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  28.22 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0909  aminoglycoside phosphotransferase  31.33 
 
 
341 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251306  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  28.29 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  35.27 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  27.23 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1993  serine/threonine protein kinase  32.37 
 
 
328 aa  51.6  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4899  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  32.09 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1107  serine/threonine protein kinase  29.73 
 
 
329 aa  47.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  26.61 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0087  serine/threonine protein kinase  31.16 
 
 
340 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0362  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
342 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  30.77 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3335  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244161  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2984  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3091  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
343 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3271  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0405  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6422  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4360  serine/threonine protein kinase  29.53 
 
 
359 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2459  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3119  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3073  serine/threonine protein kinase  31.03 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2936  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2153  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0212  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
346 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3411  serine/threonine protein kinase  30.87 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3069  serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 
343 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal  0.724762 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0224  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
343 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  29.95 
 
 
256 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  25.31 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2520  serine/threonine protein kinase  25.6 
 
 
332 aa  43.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.549925  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  29.02 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0183  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
346 aa  42.7  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4061  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0202985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3959  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4036  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.171931  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4154  serine/threonine protein kinase  33.96 
 
 
340 aa  42.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>