243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3446 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3446  integrase family protein  100 
 
 		 492 aa  992    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3464  integrase family protein  91.51 
 
 		 377 aa  669    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6721  integrase family protein  43.54 
 
 		 494 aa  381  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.917048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  42.03 
 
 		 656 aa  358  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3350  phage integrase  37.12 
 
 		 508 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.292325  normal  0.0949526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3388  phage integrase  37.12 
 
 		 508 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.328241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0457  integrase family protein  32.21 
 
 		 487 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  33.76 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  33.06 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  30.13 
 
 		 387 aa  140  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  30.11 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  29.05 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  31.38 
 
 		 377 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  30.19 
 
 		 381 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.16 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  30.56 
 
 		 383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.38 
 
 		 409 aa  123  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 391 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.27 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  26.27 
 
 		 389 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 368 aa  117  5e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.49 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.49 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  26.74 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.53 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  29.38 
 
 		 305 aa  114  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.2 
 
 		 385 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.18 
 
 		 379 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  27.13 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 379 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  30.29 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1422  phage integrase  28.68 
 
 		 442 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  25.93 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  24.93 
 
 		 373 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1440  phage integrase family protein  35.92 
 
 		 393 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  32.54 
 
 		 378 aa  107  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  24.22 
 
 		 370 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  26.57 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  25.14 
 
 		 369 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  24.53 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0172  integrase family protein  27.3 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.398776  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0709  phage integrase family protein  32.04 
 
 		 386 aa  104  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  27.11 
 
 		 378 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.1 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  26.87 
 
 		 416 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  24.16 
 
 		 369 aa  103  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4274  phage integrase  28.53 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.173259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3454  integrase family protein  41.36 
 
 		 337 aa  100  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3747  phage integrase family protein  31.7 
 
 		 471 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.51033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  25 
 
 		 391 aa  100  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  27.75 
 
 		 422 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  33.65 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2786  phage integrase family protein  31.37 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  25.9 
 
 		 325 aa  98.2  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  22.78 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  24.93 
 
 		 392 aa  98.2  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  26.5 
 
 		 383 aa  97.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  27.51 
 
 		 402 aa  97.4  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0878  phage integrase  40 
 
 		 429 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.37 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1351  integrase family protein  26.16 
 
 		 416 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  23.12 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  35.56 
 
 		 443 aa  91.7  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  26.58 
 
 		 422 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  30.16 
 
 		 384 aa  90.5  6e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  31.58 
 
 		 378 aa  89.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  26.42 
 
 		 357 aa  88.6  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  25.28 
 
 		 431 aa  87.4  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  28.87 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2275  integrase  26.05 
 
 		 393 aa  87  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3269  phage integrase family protein  34.65 
 
 		 465 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  26.6 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8572  DNA binding domain protein, excisionase family  24.94 
 
 		 507 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0167813  normal  0.0589685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  19.05 
 
 		 381 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  26.07 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  24.93 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  28.7 
 
 		 398 aa  82  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.75 
 
 		 370 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2505  integrase family protein  33.16 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3437  integrase family protein  38.26 
 
 		 458 aa  78.2  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  20.69 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5534  integrase family protein  24.93 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  31.11 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  23.4 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  30.48 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  26.09 
 
 		 393 aa  70.5  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1885  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  27.78 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1096  integrase  25.76 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.077251  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  23.33 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2665  integrase family protein  25.21 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000119591  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.94 
 
 		 365 aa  66.6  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  28.02 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  27.22 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  26.53 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  29.09 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  29.58 
 
 		 506 aa  64.7  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  22.77 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>