More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3413 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  45.77 
 
 
876 aa  682  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  59.74 
 
 
854 aa  942  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  62.35 
 
 
862 aa  967  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  58.02 
 
 
867 aa  914  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  50.29 
 
 
887 aa  745  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  57.06 
 
 
889 aa  905  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  47.28 
 
 
837 aa  660  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  53.01 
 
 
849 aa  809  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  51.83 
 
 
849 aa  818  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  56.01 
 
 
851 aa  914  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  56.31 
 
 
853 aa  891  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  58.08 
 
 
867 aa  914  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  45.74 
 
 
874 aa  668  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  51 
 
 
858 aa  781  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  54.53 
 
 
853 aa  847  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  56.99 
 
 
865 aa  851  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  51.91 
 
 
868 aa  742  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  53.91 
 
 
863 aa  882  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  58.87 
 
 
852 aa  936  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  57.82 
 
 
869 aa  911  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  56.26 
 
 
860 aa  900  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  58.08 
 
 
867 aa  914  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  54.59 
 
 
853 aa  857  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00664e-06 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  56.37 
 
 
858 aa  914  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  1.85174e-05 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  44.29 
 
 
869 aa  687  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  77.72 
 
 
846 aa  1280  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  56.6 
 
 
853 aa  874  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  43.85 
 
 
871 aa  685  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  55.89 
 
 
856 aa  870  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  52.07 
 
 
848 aa  862  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  100 
 
 
848 aa  1705  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  65.64 
 
 
855 aa  1109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  59.15 
 
 
861 aa  933  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  62.31 
 
 
851 aa  1025  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  56.89 
 
 
848 aa  906  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  56.5 
 
 
868 aa  848  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  52.1 
 
 
862 aa  805  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  66.2 
 
 
855 aa  1135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  56.73 
 
 
862 aa  878  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  69.68 
 
 
850 aa  1199  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  58.32 
 
 
850 aa  911  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  55.97 
 
 
861 aa  880  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  46.03 
 
 
878 aa  616  1e-175  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  44.38 
 
 
838 aa  602  1e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  46.01 
 
 
857 aa  602  1e-171  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  43.28 
 
 
882 aa  595  1e-168  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  41.8 
 
 
892 aa  585  1e-166  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  40.33 
 
 
882 aa  560  1e-158  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  39.95 
 
 
842 aa  511  1e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  4.02596e-05 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  33.69 
 
 
853 aa  489  1e-136  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  37.95 
 
 
834 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  34.42 
 
 
887 aa  479  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  33.96 
 
 
848 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  34.95 
 
 
877 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  34.47 
 
 
877 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  33.73 
 
 
853 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  34.95 
 
 
877 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  34.83 
 
 
877 aa  472  1e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  36.7 
 
 
877 aa  468  1e-130  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  39.31 
 
 
823 aa  467  1e-130  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  37.03 
 
 
879 aa  467  1e-130  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  34.28 
 
 
918 aa  466  1e-130  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34.03 
 
 
878 aa  466  1e-130  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  34.28 
 
 
877 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  34.16 
 
 
877 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  34.28 
 
 
877 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  34.19 
 
 
906 aa  462  1e-128  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  34.86 
 
 
875 aa  455  1e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  35.5 
 
 
889 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  37 
 
 
807 aa  382  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.39 
 
 
882 aa  263  8e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.03 
 
 
852 aa  225  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  36.89 
 
 
883 aa  223  1e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.78 
 
 
853 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  37.13 
 
 
881 aa  217  7e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.35 
 
 
785 aa  216  1e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.73 
 
 
882 aa  211  4e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.79 
 
 
859 aa  209  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0962  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.39 
 
 
871 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.83 
 
 
784 aa  206  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.31 
 
 
858 aa  206  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  35.2 
 
 
895 aa  206  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  34.2 
 
 
877 aa  205  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.09 
 
 
857 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.89 
 
 
778 aa  203  1e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.88 
 
 
859 aa  202  2e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.4 
 
 
869 aa  201  4e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.56 
 
 
830 aa  199  2e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.97 
 
 
835 aa  197  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77752  arginine/alanine aminopeptidase  30.97 
 
 
890 aa  197  9e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.204376 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_65905  alanine/arginine aminopeptidase  33.53 
 
 
870 aa  195  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.167791  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  35.05 
 
 
846 aa  188  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.92 
 
 
933 aa  186  1e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  31.96 
 
 
844 aa  186  2e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.39 
 
 
859 aa  186  2e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.69 
 
 
886 aa  184  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.29 
 
 
932 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.69 
 
 
932 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1883  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  31.51 
 
 
843 aa  181  5e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04910  leucyl aminopeptidase, putative  27.84 
 
 
1018 aa  177  9e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>