More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3384 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3384  rod shape-determining protein RodA  100 
 
 		 390 aa  769    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.32855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7278  rod shape-determining protein  50.53 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1543  rod shape-determining protein RodA  55.38 
 
 		 401 aa  349  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.391462  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2464  rod shape-determining protein RodA  48.56 
 
 		 386 aa  328  9e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2186  Sfr protein  53.01 
 
 		 407 aa  317  3e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1215  cell cycle protein  48.66 
 
 		 411 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323316  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5265  cell cycle protein  47.55 
 
 		 411 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3461  rod shape-determining protein RodA  46.87 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0402831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1684  rod shape-determining protein RodA  48.49 
 
 		 381 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.290105  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7281  rod shape-determining protein RodA  43.62 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2127  rod shape-determining protein RodA  38.32 
 
 		 365 aa  256  7e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000937002  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  37.87 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14170  cell cycle protein  37.37 
 
 		 379 aa  245  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.73666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0752  cell cycle protein  41.36 
 
 		 401 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0983  cell cycle protein  38.44 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.867453  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1634  rod shape-determining protein RodA  38.22 
 
 		 378 aa  241  1e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.990952  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0060  rod shape-determining protein RodA  38.46 
 
 		 373 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3056  rod shape-determining protein RodA  36.25 
 
 		 419 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.176215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1611  rod shape-determining protein RodA  37.8 
 
 		 377 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.749237  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17671  cell division membrane protein  34.26 
 
 		 423 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.830985  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0544  rod shape-determining protein RodA  39.1 
 
 		 378 aa  227  3e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000511075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0567  rod shape-determining protein roda  37.33 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.398514  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17871  cell division membrane protein  36.34 
 
 		 422 aa  226  7e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.17316  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1308  rod shape-determining protein RodA  33.77 
 
 		 369 aa  223  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0292319  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17711  cell division membrane protein  36.07 
 
 		 422 aa  222  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1672  rod shape determining protein  35.75 
 
 		 422 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.111343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2541  rod shape-determining protein RodA  33.83 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  37.81 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11520  rod shape-determining protein RodA  41.07 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0049464  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0351  rod shape-determining protein RodA  35.27 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000405805  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0474  rod shape-determining protein RodA  37.23 
 
 		 378 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268193  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0956  rod shape-determining protein RodA  37.63 
 
 		 382 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2730  rod shape-determining protein RodA  34.04 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00606092  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2816  cell cycle protein  37.2 
 
 		 374 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0804  rod shape-determining protein RodA  34.06 
 
 		 421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.901806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4069  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 		 417 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4287  rod shape-determining protein RodA  37.02 
 
 		 426 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4108  rod shape-determining protein RodA  33.99 
 
 		 417 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.136733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  35.68 
 
 		 371 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1466  rod shape-determining protein RodA  36.51 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.104097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2589  rod shape-determining protein RodA  34.16 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.319193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1554  rod shape-determining protein RodA  40.16 
 
 		 357 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1328  rod shape-determining protein rodA  34.42 
 
 		 372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0472  rod shape-determining protein RodA  36.53 
 
 		 373 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000647199  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1234  rod shape-determining protein RodA  34.99 
 
 		 366 aa  212  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1459  cell cycle protein  35.77 
 
 		 388 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.759672  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0103  rod shape-determining protein RodA  33.14 
 
 		 374 aa  209  6e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0858825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2764  rod shape-determining protein RodA  35.93 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1919  rod shape-determining protein RodA  39.29 
 
 		 360 aa  209  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.403487  hitchhiker  0.000000909205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4584  cell cycle protein  32.86 
 
 		 438 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1827  stage V sporulation protein E  34.44 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.914762  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3454  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0032814  hitchhiker  0.00311192 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1325  rod shape-determining protein rodA  34.15 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0401  cell division protein  38.69 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.908892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1104  cell division protein FtsW  36.06 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.921577  normal  0.914762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2588  rod shape-determining protein RodA  36.41 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0958791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07034  hypothetical protein  35.93 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4344  rod shape-determining protein RodA  36.17 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000124977  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1108  rod shape-determining protein RodA  34.59 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.380475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3302  cell cycle protein  35.85 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.311457  decreased coverage  0.00878539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2662  rod shape-determining protein RodA  37.08 
 
 		 398 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3276  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 368 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000878779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1091  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 368 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00567468  hitchhiker  0.000000470166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3400  rod shape-determining protein RodA  36.73 
 
 		 384 aa  206  4e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.293133  normal  0.487857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3318  rod shape-determining protein RodA  35.56 
 
 		 368 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000382573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2870  rod shape-determining protein RodA  33.52 
 
 		 368 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000228961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0994  rod shape-determining protein RodA  34.15 
 
 		 367 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000228896  normal  0.174291 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1730  rod shape-determining protein RodA  34.45 
 
 		 407 aa  206  6e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0257403  decreased coverage  0.00417518 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3486  rod shape-determining protein RodA  34.62 
 
 		 368 aa  205  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107855  hitchhiker  0.00000000162732 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0990  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000109624  normal  0.0370361 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1055  rod shape-determining protein RodA  33.88 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000470795  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0568  rod shape-determining protein RodA  33.57 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0777  cell division protein FtsW  34.24 
 
 		 361 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.968195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1167  rod shape-determining protein RodA  35.95 
 
 		 372 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0846  rod shape-determining protein RodA  37.4 
 
 		 386 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813507 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0760  rod shape-determining protein RodA  32.07 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2936  rod shape-determining protein RodA  36.06 
 
 		 368 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00888464  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3201  cell cycle protein  31.52 
 
 		 426 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000354109  normal  0.150861 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000981  rod shape-determining protein RodA  35.2 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0160  rod shape-determining protein RodA  38.96 
 
 		 368 aa  202  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.714589  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  32.51 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  32.51 
 
 		 368 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  37.64 
 
 		 367 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3131  cell cycle protein  34.68 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3450  rod shape-determining protein RodA  37.17 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.921865 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0984  rod shape-determining protein RodA  34.23 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.709964  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0591  rod shape-determining protein RodA  36.24 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3151  cell wall shape-determining protein  32.61 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0537844  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2325  RodA, rod cell shape determining protein  38.27 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.574517  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  41.55 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  41.55 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0999  rod shape-determining protein RodA  38.27 
 
 		 379 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.771718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  41.55 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5928  rod shape-determining protein RodA  34.6 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1180  cell wall shape-determining protein  32.97 
 
 		 370 aa  199  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0230726  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1486  rod shape-determining protein RodA  36.98 
 
 		 389 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1998  rod shape-determining protein RodA  32.28 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0307055  normal  0.0830692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4402  putative rod shape-determining protein, rodA  37.37 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0420  cell cycle protein  34.8 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000126174  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2950  cell wall shape-determining protein  35.44 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00101238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>