More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3379 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3379  ribosomal protein L27  100 
 
 		 86 aa  169  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1548  ribosomal protein L27  85.71 
 
 		 85 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104993  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2060  ribosomal protein L27  86.05 
 
 		 87 aa  148  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2181  50S ribosomal protein L27  85.54 
 
 		 88 aa  147  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.188028  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1504  ribosomal protein L27  85.06 
 
 		 94 aa  139  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00591698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7271  50S ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 85 aa  138  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.956462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1188  50S ribosomal protein L27  82.35 
 
 		 87 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12510  50S ribosomal protein L27  81.18 
 
 		 85 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7270  50S ribosomal protein L27  80.95 
 
 		 85 aa  137  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410235  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3480  50S ribosomal protein L27  84.15 
 
 		 84 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.219876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2459  50S ribosomal protein L27  80.95 
 
 		 85 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.177847 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11410  LSU ribosomal protein L27P  80.72 
 
 		 85 aa  135  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.624774  hitchhiker  0.0010423 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1651  ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 84 aa  135  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000313884 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2282  ribosomal protein L27  80.72 
 
 		 84 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.277784  hitchhiker  0.000388636 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3549  50S ribosomal protein L27  79.76 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3456  50S ribosomal protein L27  81.93 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3554  50S ribosomal protein L27  79.76 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3622  50S ribosomal protein L27  79.76 
 
 		 88 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2636  50S ribosomal protein L27  82.72 
 
 		 88 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3450  50S ribosomal protein L27  76.83 
 
 		 84 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2259  ribosomal protein L27  78.57 
 
 		 86 aa  132  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.583782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5479  50S ribosomal protein L27  82.72 
 
 		 84 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2144  50S ribosomal protein L27  80.25 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.67084e-17 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12468  50S ribosomal protein L27  81.48 
 
 		 86 aa  131  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.141175  normal  0.856367 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2390  50S ribosomal protein L27  80.25 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0854372  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0757  50S ribosomal protein L27  79.01 
 
 		 97 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.819574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3945  50S ribosomal protein L27  81.48 
 
 		 88 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3859  50S ribosomal protein L27  80.49 
 
 		 84 aa  130  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.598699  hitchhiker  0.0021541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5259  50S ribosomal protein L27  76.74 
 
 		 95 aa  130  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137345  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10120  LSU ribosomal protein L27P  75 
 
 		 85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.28486  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11550  LSU ribosomal protein L27P  77.65 
 
 		 88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.66488  normal  0.230054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1589  ribosomal protein L27  80 
 
 		 85 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00579219  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1623  50S ribosomal protein L27  74.12 
 
 		 85 aa  127  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.723727  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1474  ribosomal protein L27  83.72 
 
 		 87 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.867034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1120  50S ribosomal protein L27  73.49 
 
 		 99 aa  123  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000194791  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18260  LSU ribosomal protein L27P  71.43 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0740446  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 94 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  70.93 
 
 		 92 aa  117  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 89 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1524  50S ribosomal protein L27  70.24 
 
 		 86 aa  116  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.846788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3345  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1221  50S ribosomal protein L27  80.28 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.393173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2772  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 87 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436114  normal  0.118024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1220  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 88 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1617  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 82 aa  114  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000121175  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1223  ribosomal protein L27  68.67 
 
 		 83 aa  114  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141785 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1112  ribosomal protein L27  69.77 
 
 		 86 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.55245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0180  ribosomal protein L27  71.43 
 
 		 87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00344183  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15061  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.610968  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15311  50S ribosomal protein L27  68.24 
 
 		 86 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.854601  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 88 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2128  50S ribosomal protein L27  64.77 
 
 		 88 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.861173  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1443  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  67.86 
 
 		 92 aa  110  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0545  50S ribosomal protein L27  65.91 
 
 		 88 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 93 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 85 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05970  LSU ribosomal protein L27P  63.53 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000567704  hitchhiker  0.000000000000675699 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4921  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0271507  normal  0.71556 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  66.28 
 
 		 86 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  69.05 
 
 		 100 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0916  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4876  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4413  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1451  50S ribosomal protein L27  68.6 
 
 		 87 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000109711  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17721  50S ribosomal protein L27  64.04 
 
 		 90 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.106255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 90 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  64.37 
 
 		 95 aa  107  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1815  ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 102 aa  107  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  65.17 
 
 		 89 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0499  ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 93 aa  106  8.000000000000001e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4336  50S ribosomal protein L27  67.47 
 
 		 98 aa  107  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000256783  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0342  50S ribosomal protein L27  75.36 
 
 		 85 aa  106  9.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  8.5444e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0107  50S ribosomal protein L27  61.9 
 
 		 88 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.176189 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 85 aa  106  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2703  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2575  50S ribosomal protein L27  62.5 
 
 		 92 aa  106  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  63.95 
 
 		 87 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3073  50S ribosomal protein L27  63.22 
 
 		 91 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000209952  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 97 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 93 aa  105  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2247  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000479005  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  60.92 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13010  LSU ribosomal protein L27P  72.46 
 
 		 95 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000839598  normal  0.102019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05401  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 88 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.05 
 
 		 87 aa  104  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1816  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2218  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000800329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3916  50S ribosomal protein L27  60.23 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00853508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2665  ribosomal protein L27  62.35 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0238  ribosomal protein L27  69.88 
 
 		 87 aa  104  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14110  ribosomal protein L27  73.91 
 
 		 92 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0679  ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 84 aa  104  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000246581  normal  0.202248 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  61.8 
 
 		 89 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>