More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3378 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2180  GTPase ObgE  80.79 
 
 
454 aa  677  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3378  GTP-binding protein Obg/CgtA  100 
 
 
454 aa  902  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7269  GTPase ObgE  70.55 
 
 
450 aa  608  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564658  normal  0.11435 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1549  GTP-binding protein Obg/CgtA  69.38 
 
 
463 aa  602  1e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0025241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2281  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.6 
 
 
505 aa  580  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523689  hitchhiker  0.000211996 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7270  GTPase ObgE  63.66 
 
 
500 aa  548  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11420  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.28 
 
 
517 aa  545  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.32525  decreased coverage  0.000779693 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3455  GTPase ObgE  65.07 
 
 
513 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.382796  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2458  GTP-binding protein Obg/CgtA  67.62 
 
 
450 aa  543  1e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1624  GTPase ObgE  63.34 
 
 
519 aa  535  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.647176  normal  0.880816 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12520  GTPase ObgE  65.64 
 
 
493 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.337649  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1650  GTPase ObgE  64.59 
 
 
509 aa  531  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420929  hitchhiker  0.000176178 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2258  GTP-binding protein Obg/CgtA  66.45 
 
 
503 aa  534  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.979161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1590  GTP-binding protein Obg/CgtA  63.99 
 
 
491 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00877411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2061  GTP-binding protein Obg/CgtA  62.42 
 
 
488 aa  518  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5478  GTP-binding protein Obg/CgtA  64.9 
 
 
480 aa  518  1e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587105  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3858  GTPase ObgE  64.68 
 
 
481 aa  513  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1189  GTPase ObgE  63.89 
 
 
488 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5258  GTPase ObgE  64.53 
 
 
541 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1475  GTP-binding protein Obg/CgtA  61.17 
 
 
486 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.754526  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11560  GTPase ObgE  63.83 
 
 
500 aa  499  1e-140  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.32436 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3479  GTPase ObgE  65.34 
 
 
481 aa  498  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.395045  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2143  GTPase ObgE  61.95 
 
 
529 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.37985e-16 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3449  GTPase ObgE  62.03 
 
 
516 aa  500  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0579297  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2389  GTPase ObgE  61.41 
 
 
529 aa  498  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045234  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3553  GTPase ObgE  61.96 
 
 
485 aa  493  1e-138  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1505  GTPase ObgE  64.11 
 
 
504 aa  493  1e-138  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00667966  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3621  GTPase ObgE  61.96 
 
 
485 aa  493  1e-138  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722103  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3548  GTPase ObgE  61.96 
 
 
485 aa  493  1e-138  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1222  GTPase ObgE  64.3 
 
 
529 aa  489  1e-137  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18250  GTPase ObgE  59.52 
 
 
509 aa  479  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.106834  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12467  GTPase ObgE  60.57 
 
 
479 aa  479  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.642368  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3944  GTPase ObgE  61.74 
 
 
480 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10130  GTPase ObgE  60.21 
 
 
515 aa  474  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.398815  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2637  GTPase ObgE  61.3 
 
 
482 aa  471  1e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.869058  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0758  GTPase ObgE  61.18 
 
 
476 aa  461  1e-128  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.639245  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1618  GTPase ObgE  55.08 
 
 
563 aa  442  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.664599  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1222  Obg family GTPase CgtA  54.45 
 
 
560 aa  409  1e-113  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.89684e-08 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2011  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.19 
 
 
464 aa  343  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.47894e-05  hitchhiker  3.62877e-14 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14100  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.06 
 
 
426 aa  332  7e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  2.64035e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0683  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.99 
 
 
482 aa  330  4e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  7.15993e-05  normal  0.0309742 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13020  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.84 
 
 
463 aa  325  9e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00331169  normal  0.0440429 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05980  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.04 
 
 
464 aa  301  2e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00718326  decreased coverage  1.09453e-12 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3213  GTPase ObgE  52.31 
 
 
338 aa  296  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.59735  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1323  GTP-binding protein Obg/CgtA  42.2 
 
 
425 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.010857  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1837  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.17 
 
 
435 aa  292  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4227  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.76 
 
 
437 aa  290  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0058864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0912  GTPase ObgE  44.29 
 
 
432 aa  286  6e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1734  GTPase ObgE  41.92 
 
 
430 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00227669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1701  GTPase ObgE  41.92 
 
 
430 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0184021  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0863  GTPase ObgE  48.31 
 
 
346 aa  280  3e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0164  GTPase ObgE  50.15 
 
 
338 aa  280  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.9426e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0147  GTPase ObgE  50.15 
 
 
338 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0092  GTP-binding protein Obg/CgtA  40 
 
 
458 aa  280  4e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0390385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4326  GTPase ObgE  51.63 
 
 
353 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.524865 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3312  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.88 
 
 
425 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.12054e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1609  spo0B-associated GTP-binding protein  45.75 
 
 
419 aa  279  8e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.24468  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2113  GTPase ObgE  40 
 
 
423 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0084934  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1279  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.73 
 
 
434 aa  277  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0405743  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1873  small GTP-binding protein  48.48 
 
 
425 aa  277  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.492878  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4311  GTPase ObgE  51.46 
 
 
354 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4180  GTPase ObgE  51.46 
 
 
354 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2532  GTP1/OBG domain-containing protein  42.96 
 
 
422 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.382744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4333  GTPase ObgE  51.46 
 
 
354 aa  276  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1121  GTPase ObgE  41.04 
 
 
427 aa  276  6e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  1.27765e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0163  GTP1/OBG subdomain-containing protein  43.36 
 
 
424 aa  276  8e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0372  GTPase ObgE  38.73 
 
 
434 aa  275  1e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3155  GTPase ObgE  42.99 
 
 
428 aa  275  1e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.416963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3197  GTPase ObgE  48.92 
 
 
338 aa  274  2e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12232e-08  unclonable  1.844e-23 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0826  GTPase ObgE  40.93 
 
 
435 aa  275  2e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.350132  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0306  GTPase ObgE  49.38 
 
 
338 aa  273  4e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00590808  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4286  GTPase ObgE  42.39 
 
 
427 aa  273  4e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.543017  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1813  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.31 
 
 
426 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2537  GTPase ObgE  43.19 
 
 
428 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.53833  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2954  GTPase ObgE  48.92 
 
 
338 aa  272  9e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4558  GTPase ObgE  42.96 
 
 
428 aa  271  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0186661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4573  GTPase ObgE  42.72 
 
 
428 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00906811  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0849  GTPase ObgE  40.97 
 
 
435 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0116462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2668  GTP-binding protein Obg/CgtA  45.91 
 
 
427 aa  271  2e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00700338  normal  0.373543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3275  GTP-binding protein Obg/CgtA  47.65 
 
 
369 aa  269  6e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000381573 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4185  GTPase ObgE  42.72 
 
 
428 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4532  GTPase ObgE  42.66 
 
 
428 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4520  GTPase ObgE  42.72 
 
 
428 aa  268  1e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.634505 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4174  GTPase ObgE  42.72 
 
 
428 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000228664  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4672  GTPase ObgE  42.49 
 
 
428 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.089574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1010  GTPase ObgE  47.02 
 
 
338 aa  268  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00968457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4338  GTPase ObgE  42.49 
 
 
428 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1208  GTPase ObgE  39.95 
 
 
430 aa  268  2e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  4.54316e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0185  GTP-binding protein Obg/CgtA  43.35 
 
 
417 aa  267  3e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.829454  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3104  GTPase ObgE  46.71 
 
 
365 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0196  GTPase ObgE  46.24 
 
 
362 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0676  GTPase ObgE  41.82 
 
 
428 aa  264  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00140283  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0857  GTPase ObgE  48.27 
 
 
397 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.121335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2217  GTPase ObgE  46.15 
 
 
353 aa  263  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000677684  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0751  GTP-binding protein Obg/CgtA  44.04 
 
 
415 aa  262  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  9.3637e-06  hitchhiker  0.00586809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2956  GTPase ObgE  45.51 
 
 
365 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0366  GTPase ObgE  38.07 
 
 
439 aa  260  4e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0449672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0561  GTPase ObgE  44.55 
 
 
423 aa  259  7e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2548  GTP-binding protein Obg/CgtA  39.06 
 
 
429 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.040032  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0252  GTPase ObgE  46.82 
 
 
337 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0998753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>