More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3227 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  394  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  63.68 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  58.76 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 199 aa  206  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  54.5 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  53.85 
 
 		 201 aa  184  8e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  55.85 
 
 		 195 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  52.85 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  39.5 
 
 		 194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  35.68 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 209 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 219 aa  61.2  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2182  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0854  transcriptional regulator BetI  31.71 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  33.04 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2312  transcriptional regulator BetI  28.65 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.48058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  35.71 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  33.93 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  33.93 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  33.93 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 183 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3158  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.303852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  32.14 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  29.46 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 326 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  29.33 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  40.28 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  40.28 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  40.28 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  40.28 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1898  transcriptional regulator BetI  34.23 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.516786 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  40.28 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 181 aa  53.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>