More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3145 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  100 
 
 		 349 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  55.94 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  44.31 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  45.69 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  42.61 
 
 		 331 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  33.63 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  34.46 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  33.53 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  32.17 
 
 		 348 aa  133  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  33.85 
 
 		 373 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  49.58 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  29.8 
 
 		 327 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  30.88 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  48.74 
 
 		 160 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  49.25 
 
 		 222 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  31.31 
 
 		 340 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  30.9 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  27.96 
 
 		 394 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  32.09 
 
 		 330 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.61 
 
 		 235 aa  114  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  27.63 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  30.39 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  29.28 
 
 		 343 aa  112  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  28.94 
 
 		 366 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  47.41 
 
 		 210 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  44 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  30.33 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  30.21 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  50.89 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  44.63 
 
 		 417 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  42.98 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  29.43 
 
 		 345 aa  106  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 236 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  44.03 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  28.66 
 
 		 342 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  45 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  30.84 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  44.17 
 
 		 459 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  45.3 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1561  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.53 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.308616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  49.51 
 
 		 281 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7290  NLP/P60 protein  44.92 
 
 		 329 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0724969  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  42.34 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  30.53 
 
 		 432 aa  99.8  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 372 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 372 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  43.12 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  33.5 
 
 		 342 aa  98.6  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  41.46 
 
 		 257 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 346 aa  98.6  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5530  NLP/P60 protein  39.33 
 
 		 491 aa  97.4  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.479781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.53 
 
 		 438 aa  96.7  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  48.96 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  46.94 
 
 		 350 aa  95.9  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  41.51 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.53 
 
 		 452 aa  95.9  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0586  NLP/P60 protein  45.08 
 
 		 432 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  47 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  41.82 
 
 		 475 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  28.9 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 232 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6731  NLP/P60 protein  45.16 
 
 		 308 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00865661  normal  0.270738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  33.48 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 342 aa  95.1  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3054  NLP/P60 protein  45.38 
 
 		 381 aa  94.4  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0610428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  25.53 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  40.54 
 
 		 341 aa  94  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  42.34 
 
 		 342 aa  94  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.37 
 
 		 531 aa  94  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  33.17 
 
 		 301 aa  94  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  38.97 
 
 		 329 aa  93.6  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  42.45 
 
 		 274 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8469  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  42.06 
 
 		 362 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 363 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  40 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  50.53 
 
 		 368 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0773  NLP/P60 protein  31.86 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2139  NLP/P60 protein  48.51 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.606148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 204 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0041  NLP/P60  46.46 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  42.86 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  41.07 
 
 		 240 aa  91.3  3e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  42.86 
 
 		 361 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  39.81 
 
 		 370 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 298 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2110  NLP/P60 protein  41.44 
 
 		 491 aa  90.5  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0361918  normal  0.848147 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  43.4 
 
 		 315 aa  90.5  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2700  NLP/P60 protein  39.32 
 
 		 188 aa  90.5  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000637216  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  41.6 
 
 		 556 aa  90.1  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  44.44 
 
 		 269 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 246 aa  89.7  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 348 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0298  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 437 aa  89.4  9e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.283102  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  53.26 
 
 		 317 aa  89.4  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  42.31 
 
 		 363 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1816  NLP/P60 protein  33.75 
 
 		 859 aa  89  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  40.87 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>