More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3114 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3114  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
226 aa  437  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1046  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  72.9 
 
 
218 aa  299  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3030  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  67.29 
 
 
226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0235882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34670  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.06 
 
 
225 aa  264  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5993  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  63.13 
 
 
218 aa  259  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.554232 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0407  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.03 
 
 
252 aa  250  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0667813  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10419  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  64.68 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553415  normal  0.826852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0990  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  65.38 
 
 
212 aa  239  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2786  Thiamine-phosphate diphosphorylase  68.16 
 
 
213 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416302  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1343  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  67 
 
 
221 aa  235  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  hitchhiker  0.000481563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0534  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  67.92 
 
 
226 aa  234  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0707  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  64.06 
 
 
221 aa  231  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0544  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.82 
 
 
226 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0556  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  66.82 
 
 
226 aa  231  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.655904  normal  0.62194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0198  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  67.94 
 
 
237 aa  228  4e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4886  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  61.38 
 
 
221 aa  223  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1455  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57 
 
 
222 aa  216  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2503  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  60.1 
 
 
240 aa  209  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000857032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3749  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.61 
 
 
222 aa  207  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  57.92 
 
 
221 aa  204  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  59.05 
 
 
237 aa  201  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.404805  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0496  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  56.12 
 
 
220 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0770  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.77 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  0.090821 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07950  thiamine-phosphate diphosphorylase  49.34 
 
 
247 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0172008  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3070  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.3 
 
 
237 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
343 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.15 
 
 
343 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1842  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  50.72 
 
 
229 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.65 
 
 
368 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0370  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  49.51 
 
 
208 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.25045 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.86 
 
 
347 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.06 
 
 
360 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.65 
 
 
379 aa  154  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2041  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  47.78 
 
 
208 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19391  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.85 
 
 
353 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.706748 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.46 
 
 
346 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1057  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.34 
 
 
343 aa  149  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.004946  normal  0.0997928 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0896  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.81 
 
 
352 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.833365  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  46.35 
 
 
208 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  46.04 
 
 
213 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0711  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  44.9 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1502  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.38 
 
 
346 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.63479  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16941  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.72 
 
 
350 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13191  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.28 
 
 
343 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.422887 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0840  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.94 
 
 
350 aa  128  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.373367  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.58 
 
 
365 aa  128  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1122  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
208 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0730  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.09 
 
 
216 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0124065  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10858  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.27 
 
 
208 aa  122  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.84468  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1923  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  45.26 
 
 
221 aa  122  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.425908  normal  0.352595 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1811  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.07 
 
 
221 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.645451  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0641  thiamine-phosphate diphosphorylase  40.3 
 
 
209 aa  121  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0370584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.45 
 
 
221 aa  121  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.040851  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.2 
 
 
220 aa  121  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2471  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.58 
 
 
219 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232112  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.5 
 
 
353 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1463  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.21 
 
 
211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.82 
 
 
351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14731  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.84 
 
 
351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.161501  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.39 
 
 
344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.9 
 
 
218 aa  118  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  40.88 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1601  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.84 
 
 
234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.1 
 
 
210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.71 
 
 
236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.98 
 
 
536 aa  113  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  42.21 
 
 
228 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.38 
 
 
218 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0929  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.8 
 
 
211 aa  112  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.013677  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
214 aa  112  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.15 
 
 
217 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0037  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.58 
 
 
206 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.66 
 
 
352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1558  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.536172  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1824  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.39 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.106561 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0372  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.6 
 
 
219 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000497058  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.84 
 
 
207 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.84 
 
 
207 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2520  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.09 
 
 
207 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.67 
 
 
211 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3495  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.7 
 
 
206 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1712  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
220 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0573115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.15 
 
 
205 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.40521  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0209  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.31 
 
 
211 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1657  hypothetical protein  36.54 
 
 
210 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000901813 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1379  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.58 
 
 
215 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000146383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4827  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.22 
 
 
224 aa  107  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06844  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.31 
 
 
204 aa  105  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.37 
 
 
207 aa  105  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3476  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
223 aa  105  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0457508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2395  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41 
 
 
252 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.19 
 
 
205 aa  105  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1223  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 
217 aa  105  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  42.05 
 
 
212 aa  105  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.11 
 
 
202 aa  104  9e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.65 
 
 
206 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.36 
 
 
220 aa  104  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  35.75 
 
 
479 aa  103  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0261  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  43.69 
 
 
211 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.243144  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3508  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.16 
 
 
223 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0511603  normal  0.415354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>