More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3071 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3071  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427548  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2066  translation initiation factor 3  89.35 
 
 		 179 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.383221  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5483  translation initiation factor IF-3  82.25 
 
 		 250 aa  296  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  81.66 
 
 		 199 aa  290  8e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  77.66 
 
 		 222 aa  289  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2139  translation initiation factor IF-3  85.53 
 
 		 177 aa  283  9e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0045601  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  80.12 
 
 		 225 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  83.33 
 
 		 277 aa  271  5.000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3039  translation initiation factor IF-3  71.43 
 
 		 212 aa  270  9e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271102  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  75 
 
 		 243 aa  269  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  82.17 
 
 		 204 aa  267  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25690  translation initiation factor 3  78.79 
 
 		 168 aa  265  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2385  translation initiation factor IF-3  75.3 
 
 		 192 aa  265  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  0.289584 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1624  translation initiation factor IF-3  74.56 
 
 		 415 aa  265  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.640548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  79.62 
 
 		 205 aa  264  5e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  75.15 
 
 		 351 aa  262  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22440  translation initiation factor 3  74.25 
 
 		 329 aa  261  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  75.29 
 
 		 227 aa  261  4.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1103  translation initiation factor IF-3  68.78 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0433779  normal  0.928932 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12250  translation initiation factor 3  78.05 
 
 		 195 aa  258  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109497  normal  0.154931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  71.68 
 
 		 182 aa  256  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14590  translation initiation factor 3  67.98 
 
 		 401 aa  254  3e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1882  translation initiation factor IF-3  77.92 
 
 		 204 aa  254  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0284235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1875  translation initiation factor IF-3  77.92 
 
 		 239 aa  254  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.384688 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2981  translation initiation factor 3  69.32 
 
 		 238 aa  253  7e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3025  translation initiation factor 3  69.32 
 
 		 238 aa  253  7e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2996  translation initiation factor 3  69.32 
 
 		 238 aa  253  8e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171641  normal  0.0309942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3328  translation initiation factor IF-3  68.13 
 
 		 243 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.825238  normal  0.390058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2418  translation initiation factor IF-3  77.07 
 
 		 196 aa  252  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11658  translation initiation factor IF-3  71.86 
 
 		 201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1477  translation initiation factor 3  64.71 
 
 		 396 aa  248  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0613769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1480  translation initiation factor IF-3  72.61 
 
 		 356 aa  244  4e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000187235 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21910  translation initiation factor 3  69.46 
 
 		 208 aa  238  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.559617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1728  initiation factor 3  83.7 
 
 		 149 aa  238  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00351932  hitchhiker  0.00163995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3542  initiation factor 3  74.82 
 
 		 175 aa  224  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.407448  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0475  translation initiation factor IF-3  59.88 
 
 		 253 aa  214  7e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1301  translation initiation factor 3  59.52 
 
 		 175 aa  207  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.444006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  61.78 
 
 		 357 aa  205  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  60.13 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0232  translation initiation factor 3  60.39 
 
 		 211 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.627991  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  58.82 
 
 		 198 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  57.52 
 
 		 197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  60 
 
 		 198 aa  193  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  59.21 
 
 		 165 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  55.56 
 
 		 164 aa  189  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  53.71 
 
 		 193 aa  187  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  53.25 
 
 		 202 aa  181  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  53.8 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  54.61 
 
 		 154 aa  180  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  52.29 
 
 		 179 aa  179  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  54.25 
 
 		 172 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  54.19 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  54.14 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  54.32 
 
 		 170 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2853  translation initiation factor IF-3  52.98 
 
 		 174 aa  177  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0116753 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  52.53 
 
 		 173 aa  175  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  51.33 
 
 		 154 aa  175  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0065  translation initiation factor IF-3  51.59 
 
 		 184 aa  174  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  54.9 
 
 		 174 aa  173  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2103  translation initiation factor 3  54.43 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.286317  normal  0.133955 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1218  translation initiation factor IF-3  53.55 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0326522  normal  0.465185 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  53.25 
 
 		 154 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1613  translation initiation factor IF-3  57.55 
 
 		 145 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000306668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  51.61 
 
 		 155 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_002620  TC0221  translation initiation factor IF-3  45.93 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00015702  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  52.23 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  52.23 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  52.23 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  52.23 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  53.85 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  46.59 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  50 
 
 		 238 aa  169  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 195 aa  169  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  50.32 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  50.32 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  53.21 
 
 		 194 aa  169  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 166 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 166 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 186 aa  168  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  48.45 
 
 		 249 aa  168  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  54.19 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  51.3 
 
 		 173 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 166 aa  168  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 195 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  51.27 
 
 		 181 aa  168  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  50.98 
 
 		 174 aa  167  5e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  51.63 
 
 		 166 aa  167  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  51.61 
 
 		 178 aa  167  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2858  translation initiation factor 3  50 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.357759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  52.9 
 
 		 190 aa  166  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0441  translation initiation factor IF-3  48.08 
 
 		 179 aa  166  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.077533  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 172 aa  166  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  49.04 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  50.33 
 
 		 190 aa  165  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>