More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3062 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2058  hypothetical protein  71.64 
 
 		 480 aa  713    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00793169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3062  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 482 aa  963    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.30158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2906  FAD dependent oxidoreductase  61.23 
 
 		 474 aa  571  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000261915  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1113  FAD dependent oxidoreductase  58.51 
 
 		 473 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6023  hypothetical protein  58.39 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0508891  normal  0.530201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1987  FAD dependent oxidoreductase  58.85 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.129488  normal  0.389289 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3857  FAD dependent oxidoreductase  56.62 
 
 		 462 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5174  FAD dependent oxidoreductase  55.08 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1109  FAD dependent oxidoreductase  54.39 
 
 		 457 aa  473  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.921836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5086  FAD dependent oxidoreductase  55.08 
 
 		 456 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.973879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5464  FAD dependent oxidoreductase  55.29 
 
 		 456 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5703  FAD dependent oxidoreductase  56.16 
 
 		 472 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5713  FAD dependent oxidoreductase  56.43 
 
 		 460 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.782867 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1896  FAD dependent oxidoreductase  51.29 
 
 		 460 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117344  normal  0.381986 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0253  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)  50.96 
 
 		 460 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2026  FAD dependent oxidoreductase  50.96 
 
 		 460 aa  426  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.721167  normal  0.721714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0622  FAD dependent oxidoreductase  45.68 
 
 		 463 aa  363  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1549  FAD dependent oxidoreductase  45.31 
 
 		 472 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0684426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3231  FAD dependent oxidoreductase  48.83 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.749546  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1492  FAD dependent oxidoreductase  50.33 
 
 		 462 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1280  FAD dependent oxidoreductase  45.49 
 
 		 462 aa  350  4e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00857441  normal  0.15279 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0950  FAD dependent oxidoreductase  47.13 
 
 		 466 aa  336  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230558  normal  0.1985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0908  FAD dependent oxidoreductase  43.79 
 
 		 460 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2617  FAD dependent oxidoreductase  40.62 
 
 		 460 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523362  normal  0.489524 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0903  FAD dependent oxidoreductase  42.4 
 
 		 454 aa  303  5.000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2804  FAD dependent oxidoreductase  42.35 
 
 		 464 aa  277  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2153  FAD dependent oxidoreductase  40.22 
 
 		 475 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.518095  normal  0.441318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0875  FAD dependent oxidoreductase  38.12 
 
 		 476 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.120395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4303  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 468 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0905  FAD dependent oxidoreductase  37.89 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19770  hypothetical protein  39.1 
 
 		 468 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0919  FAD dependent oxidoreductase  38.86 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108527  normal  0.544612 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1702  hypothetical protein  37.86 
 
 		 468 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2675  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 468 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0496606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3678  hypothetical protein  36.65 
 
 		 489 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0780  FAD dependent oxidoreductase  37.61 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.240885  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3244  FAD dependent oxidoreductase  35.86 
 
 		 491 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3143  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0879  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 		 491 aa  230  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2910  hypothetical protein  36.4 
 
 		 493 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0699  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3367  aminophosphonate oxidoreductase  34.63 
 
 		 463 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.585702  normal  0.425425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2549  hypothetical protein  34.79 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.165188  decreased coverage  0.00741775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3166  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 463 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3762  hypothetical protein  35.34 
 
 		 465 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3861  FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5870  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 463 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.982629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44210  putative glycine/D-amino acid oxidase  34.57 
 
 		 465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.032969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6498  FAD dependent oxidoreductase  32.99 
 
 		 491 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.438276  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3392  FAD dependent oxidoreductase  32 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2220  aminophosphonate oxidoreductase  34.2 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2530  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 521 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3143  FAD dependent oxidoreductase  33.79 
 
 		 462 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3139  aminophosphonate oxidoreductase  33.71 
 
 		 462 aa  176  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5715  FAD dependent oxidoreductase  33.48 
 
 		 480 aa  176  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3163  aminophosphonate oxidoreductase  33.56 
 
 		 462 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0194513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3079  aminophosphonate oxidoreductase  33.48 
 
 		 462 aa  172  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0471981 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0284  putative oxidoreductase  30.34 
 
 		 473 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2891  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 443 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3196  FAD dependent oxidoreductase  33.63 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1496  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 		 453 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381032  normal  0.348972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0095  hypothetical protein  28.38 
 
 		 470 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0631849  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2810  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 496 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.73838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3679  FAD dependent oxidoreductase  32.55 
 
 		 463 aa  167  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2905  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2861  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 		 468 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0390  hypothetical protein  27.31 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3946  hypothetical protein  32.6 
 
 		 470 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7089  FAD dependent oxidoreductase  29.95 
 
 		 459 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39720  putative amino acid oxidase  33.19 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3417  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 471 aa  156  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000555141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1885  hypothetical protein  27.93 
 
 		 464 aa  156  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2277  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4628  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3170  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540221 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000757  glycine/D-amino acid oxidase  29.01 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.270345  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1013  FAD dependent oxidoreductase  30.5 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.244373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0254  FAD dependent oxidoreductase  33.25 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2235  FAD dependent oxidoreductase  30.45 
 
 		 447 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.622258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0812  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 473 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3177  FAD dependent oxidoreductase  25.77 
 
 		 428 aa  140  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000102861  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0118  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 464 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04889  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 466 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2005  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 443 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.343798  normal  0.360324 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6842  FAD dependent oxidoreductase  29 
 
 		 465 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.133179 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1515  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 463 aa  133  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5196  FAD dependent oxidoreductase  27.73 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0139  FAD dependent oxidoreductase  27.99 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2784  FAD dependent oxidoreductase  27.05 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3861  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 470 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  0.682317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4351  FAD dependent oxidoreductase  29.8 
 
 		 494 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5599  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 424 aa  130  8.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.637375 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6399  twin-arginine translocation pathway signal  28.5 
 
 		 482 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3223  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1546  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 424 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.358116  normal  0.715864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1934  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 472 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2389  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.986344 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3646  hypothetical protein  32.41 
 
 		 469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0271589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2019  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 473 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0889  FAD dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 487 aa  126  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>