More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3058 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3058  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  100 
 
 
402 aa  804    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00328868  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2054  acetylornithine aminotransferase  70.9 
 
 
403 aa  552  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.307045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2154  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.57 
 
 
401 aa  500  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000952275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2028  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  65.91 
 
 
399 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.832641  normal  0.501384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3065  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  64.97 
 
 
401 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.664029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6074  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  67.53 
 
 
400 aa  474  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.882536  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1260  acetylornithine aminotransferase  58.99 
 
 
399 aa  443  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.161601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1740  acetylornithine aminotransferase  57.69 
 
 
414 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212917 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3172  acetylornithine aminotransferase  55.17 
 
 
444 aa  408  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.22064  normal  0.239102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5468  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.51 
 
 
436 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2838  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  55.19 
 
 
393 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0375409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3158  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  54.22 
 
 
416 aa  382  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3311  acetylornithine aminotransferase  52.96 
 
 
390 aa  383  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0246414  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4128  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  53.47 
 
 
396 aa  380  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0278283  decreased coverage  0.00000134579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3527  acetylornithine aminotransferase  52.45 
 
 
395 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327175  normal  0.819815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11673  acetylornithine aminotransferase  53.15 
 
 
400 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000327992  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2969  acetylornithine aminotransferase  51.16 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.435478  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3013  acetylornithine aminotransferase  51.16 
 
 
402 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.686794 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2984  acetylornithine aminotransferase  50.9 
 
 
402 aa  361  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0590766 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3025  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.77 
 
 
393 aa  350  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.048422  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1500  acetylornithine aminotransferase  49.5 
 
 
423 aa  342  9e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000760659 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2370  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  52.46 
 
 
425 aa  341  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0163259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21710  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  49.12 
 
 
419 aa  340  2e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5453  acetylornithine aminotransferase  51.42 
 
 
387 aa  340  4e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0392628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2471  acetylornithine aminotransferase  55.78 
 
 
411 aa  339  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2400  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  51.39 
 
 
393 aa  339  5.9999999999999996e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22300  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  49.13 
 
 
425 aa  335  7.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.271521  normal  0.79569 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25600  acetylornithine aminotransferase  50.65 
 
 
395 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1499  acetylornithine aminotransferase  47.68 
 
 
426 aa  333  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1114  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.03 
 
 
420 aa  332  5e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.922193  normal  0.423827 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1891  acetylornithine aminotransferase  53.74 
 
 
429 aa  329  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.177986 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14390  acetylornithine/succinylornithine aminotransferase  48.93 
 
 
428 aa  324  1e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0660  acetylornithine aminotransferase  43.46 
 
 
394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0871  acetylornithine aminotransferase  44.47 
 
 
403 aa  317  3e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2204  acetylornithine aminotransferase  42.49 
 
 
390 aa  317  3e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0313  acetylornithine aminotransferase  46.83 
 
 
380 aa  316  4e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0395  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  45.36 
 
 
413 aa  316  6e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.538676 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1330  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.26 
 
 
430 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0110567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1884  acetylornithine aminotransferase  54.81 
 
 
429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0524658  normal  0.0363552 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2493  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.6 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0813  acetylornithine aminotransferase  43.6 
 
 
431 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.470435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2287  acetylornithine aminotransferase  44.56 
 
 
402 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.194315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1644  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  50.13 
 
 
442 aa  305  8.000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1258  acetylornithine aminotransferase  42.39 
 
 
398 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00185503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2414  acetylornithine aminotransferase  45.1 
 
 
396 aa  302  7.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0274  acetylornithine aminotransferase  42.26 
 
 
396 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1566  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
395 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0353  acetylornithine aminotransferase  40 
 
 
395 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00220895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1901  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  46.85 
 
 
374 aa  301  1e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0068  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  47.5 
 
 
375 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.413029  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1698  acetylornithine aminotransferase  41.78 
 
 
394 aa  300  3e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2526  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  47.18 
 
 
356 aa  298  8e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.645919  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1041  acetylornithine aminotransferase  42.6 
 
 
390 aa  298  1e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.370932  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0483  acetylornithine aminotransferase  39.21 
 
 
395 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1710  acetylornithine aminotransferase  44.7 
 
 
392 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0925352  hitchhiker  0.00335003 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1069  acetylornithine aminotransferase  41.9 
 
 
398 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4636  acetylornithine aminotransferase  42.97 
 
 
395 aa  297  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.621133  normal  0.175641 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0533  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  41.03 
 
 
394 aa  297  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3741  acetylornithine aminotransferase  40.91 
 
 
397 aa  296  4e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1041  acetylornithine aminotransferase  41.15 
 
 
398 aa  296  6e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0101251  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2440  acetylornithine aminotransferase  39.02 
 
 
388 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.493949  normal  0.0446911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0406  acetylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
388 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0570  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.33 
 
 
388 aa  293  3e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1346  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.79 
 
 
399 aa  292  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1866  acetylornithine aminotransferase  40.21 
 
 
400 aa  292  8e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2686  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.42 
 
 
402 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0960288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1830  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  43.56 
 
 
395 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.991221  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2464  acetylornithine aminotransferase  43.56 
 
 
392 aa  291  1e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3636  acetylornithine aminotransferase  39.9 
 
 
397 aa  291  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2912  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  38.23 
 
 
400 aa  291  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.386564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2079  acetylornithine aminotransferase  42.12 
 
 
391 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2872  acetylornithine aminotransferase  41.52 
 
 
397 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2358  acetylornithine aminotransferase  43.26 
 
 
400 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284538  normal  0.840689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0569  acetylornithine aminotransferase  40.45 
 
 
400 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160273  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0226  acetylornithine aminotransferase  41.88 
 
 
396 aa  288  1e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1129  acetylornithine aminotransferase  44.27 
 
 
375 aa  287  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3744  acetylornithine aminotransferase  42.63 
 
 
391 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000932106 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2138  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.51 
 
 
383 aa  287  2e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3173  acetylornithine aminotransferase  40.6 
 
 
398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1102  acetylornithine aminotransferase  47.58 
 
 
394 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0151  acetylornithine aminotransferase  42.19 
 
 
399 aa  286  5.999999999999999e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2618  acetylornithine aminotransferase  41.85 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00459682  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5154  acetylornithine aminotransferase  38.94 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000762221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02850  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.43 
 
 
399 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000577952  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0426  acetylornithine aminotransferase  37.86 
 
 
396 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0269327  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1784  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  40.11 
 
 
385 aa  281  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74918  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0204  acetylornithine aminotransferase  41.67 
 
 
399 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000412684 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0982  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.82 
 
 
410 aa  280  3e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0772  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  39.65 
 
 
399 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.200689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1164  acetylornithine aminotransferase  43.38 
 
 
398 aa  280  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.581434  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2288  acetylornithine and succinylornithine aminotransferases  40.38 
 
 
396 aa  279  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.37355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1072  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
385 aa  278  1e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0280572  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0946  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  42.28 
 
 
398 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104291  normal  0.0999204 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0342  acetylornithine and succinylornithine aminotransferase  44.76 
 
 
417 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3146  aminotransferase class-III  42.03 
 
 
408 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.733649  normal  0.0499094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3730  acetylornithine aminotransferase  40.7 
 
 
427 aa  276  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000174283  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3150  acetylornithine aminotransferase  40.2 
 
 
399 aa  277  3e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3572  acetylornithine aminotransferase  43.48 
 
 
404 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1040  acetylornithine aminotransferase  40.31 
 
 
385 aa  276  4e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000111021  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0640  acetylornithine aminotransferase  38.73 
 
 
403 aa  275  8e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.41902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>