More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3057 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3057  ornithine carbamoyltransferase  100 
 
 
315 aa  630  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00484569  normal  0.832325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2155  ornithine carbamoyltransferase  73.68 
 
 
311 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000126395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5467  ornithine carbamoyltransferase  70.36 
 
 
308 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974312  normal  0.0257666 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1115  ornithine carbamoyltransferase  65.81 
 
 
310 aa  427  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2027  ornithine carbamoyltransferase  70.68 
 
 
322 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3157  ornithine carbamoyltransferase  71.15 
 
 
306 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6073  ornithine carbamoyltransferase  67.1 
 
 
338 aa  419  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21700  ornithine carbamoyltransferase  65.51 
 
 
327 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.513987  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2983  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
307 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.886443  normal  0.0522528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2968  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
307 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59447  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3012  ornithine carbamoyltransferase  66.56 
 
 
307 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.296238  normal  0.87649 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2369  ornithine carbamoyltransferase  65.82 
 
 
330 aa  408  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.943792  normal  0.0136411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2837  ornithine carbamoyltransferase  66.23 
 
 
307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.10311  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3310  ornithine carbamoyltransferase  64.59 
 
 
307 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00885285  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1645  ornithine carbamoyltransferase  67.1 
 
 
310 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3024  ornithine carbamoyltransferase  68.59 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.317014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1885  ornithine carbamoyltransferase  63.23 
 
 
323 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0234789  normal  0.0335747 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0812  ornithine carbamoyltransferase  62.17 
 
 
321 aa  391  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2472  ornithine carbamoyltransferase  64.05 
 
 
306 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1331  ornithine carbamoyltransferase  64.29 
 
 
310 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0593865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5452  ornithine carbamoyltransferase  65.02 
 
 
310 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0571066  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3526  ornithine carbamoyltransferase  63.84 
 
 
307 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.550058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11674  ornithine carbamoyltransferase  64.82 
 
 
307 aa  388  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  8.25899e-16  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14380  ornithine carbamoyltransferase  67.87 
 
 
319 aa  387  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4127  ornithine carbamoyltransferase  63.58 
 
 
312 aa  384  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00239827  hitchhiker  0.0000294127 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10130  ornithine carbamoyltransferase  61.31 
 
 
308 aa  379  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1500  ornithine carbamoyltransferase  60.65 
 
 
335 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1501  ornithine carbamoyltransferase  59.68 
 
 
333 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000190622 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25590  ornithine carbamoyltransferase  62.42 
 
 
309 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1892  ornithine carbamoyltransferase  64.17 
 
 
321 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22290  ornithine carbamoyltransferase  66.34 
 
 
314 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.586584  normal  0.554108 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1259  ornithine carbamoyltransferase  61.41 
 
 
312 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0413416 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2399  ornithine carbamoyltransferase  62.82 
 
 
312 aa  368  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3171  ornithine carbamoyltransferase  60.26 
 
 
340 aa  353  2e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1741  ornithine carbamoyltransferase  59.8 
 
 
317 aa  336  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187432 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0343  ornithine carbamoyltransferase  55.92 
 
 
309 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0276  ornithine carbamoyltransferase  53.09 
 
 
315 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3066  ornithine carbamoyltransferase  56.07 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478337  normal  0.328556 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2286  ornithine carbamoyltransferase  51.8 
 
 
314 aa  312  3.9999999999999997e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.102156 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0405  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 
311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0569  ornithine carbamoyltransferase  52.94 
 
 
311 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2465  ornithine carbamoyltransferase  50.98 
 
 
300 aa  309  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3172  ornithine carbamoyltransferase  51.63 
 
 
305 aa  308  5e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0370415  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1234  ornithine carbamoyltransferase  53.64 
 
 
304 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.011055  normal  0.156338 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1869  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
307 aa  306  3e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0479  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
306 aa  302  4.0000000000000003e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.133467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2080  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
298 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2915  ornithine carbamoyltransferase  50.87 
 
 
305 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.595203  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3149  ornithine carbamoyltransferase  49.35 
 
 
303 aa  300  2e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1451  ornithine carbamoyltransferase  49.51 
 
 
311 aa  299  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0205  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
303 aa  299  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000336127 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2514  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
305 aa  298  5e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.292289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1227  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
355 aa  298  7e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.786262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1057  ornithine carbamoyltransferase  47.7 
 
 
301 aa  297  1e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0152  ornithine carbamoyltransferase  49.68 
 
 
303 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2652  ornithine carbamoyltransferase  49.83 
 
 
309 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0251139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2197  ornithine carbamoyltransferase  50.99 
 
 
306 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1829  ornithine carbamoyltransferase  51.32 
 
 
312 aa  296  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2430  ornithine carbamoyltransferase  50.66 
 
 
304 aa  294  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0540  ornithine carbamoyltransferase  44.26 
 
 
304 aa  294  2e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000671603  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1163  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
309 aa  293  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.100026  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3007  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3112  ornithine carbamoyltransferase  50 
 
 
309 aa  292  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3389  ornithine carbamoyltransferase  49.18 
 
 
301 aa  291  8e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345181  normal  0.187028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1542  ornithine carbamoyltransferase  47.19 
 
 
308 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3573  ornithine carbamoyltransferase  48.53 
 
 
329 aa  291  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.510034  normal  0.18722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1101  ornithine carbamoyltransferase  48.22 
 
 
303 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0926  ornithine carbamoyltransferase  52.15 
 
 
318 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.565714 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0532  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
302 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0521808  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2317  ornithine carbamoyltransferase  49.34 
 
 
304 aa  290  2e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0451253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1902  ornithine carbamoyltransferase  49.67 
 
 
306 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0945  ornithine carbamoyltransferase  48.85 
 
 
304 aa  288  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0836212  normal  0.0898024 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2287  ornithine carbamoyltransferase  48.2 
 
 
313 aa  288  8e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0957  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
307 aa  287  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0907  ornithine carbamoyltransferase  46.69 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1609  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 
305 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1461  ornithine carbamoyltransferase  44.44 
 
 
305 aa  286  4e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0742  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
312 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18610  ornithine carbamoyltransferase  47.56 
 
 
305 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0309685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0794  ornithine carbamoyltransferase  49.01 
 
 
313 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2415  ornithine carbamoyltransferase  48.21 
 
 
302 aa  285  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2405  ornithine carbamoyltransferase  48.88 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.324681  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0726  ornithine carbamoyltransferase  49.84 
 
 
300 aa  284  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.853376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0570  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4159  ornithine carbamoyltransferase  46.36 
 
 
338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171177  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1790  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3030  ornithine carbamoyltransferase  47.32 
 
 
320 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.883113 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3742  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
303 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1819  ornithine carbamoyltransferase  49.5 
 
 
323 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3012  ornithine carbamoyltransferase  46.25 
 
 
309 aa  282  6.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3073  ornithine carbamoyltransferase  49.52 
 
 
313 aa  281  9e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0158  ornithine carbamoyltransferase  47.46 
 
 
306 aa  280  2e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3032  ornithine carbamoyltransferase  45.9 
 
 
306 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.710258  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2763  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
307 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2120  ornithine carbamoyltransferase  46.73 
 
 
302 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0533894  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0757  ornithine carbamoyltransferase  46.56 
 
 
309 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1754  ornithine carbamoyltransferase  45.57 
 
 
326 aa  280  2e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0940132  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3637  ornithine carbamoyltransferase  46.43 
 
 
303 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0975  ornithine carbamoyltransferase  47.91 
 
 
312 aa  280  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2441  ornithine carbamoyltransferase  48.04 
 
 
303 aa  279  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617876  normal  0.127265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>