36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2995 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
148 aa  290  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  42.31 
 
 
109 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  45.36 
 
 
119 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  39.78 
 
 
110 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  43.43 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  39.42 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  39.39 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  38.54 
 
 
118 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  41.41 
 
 
122 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  33.02 
 
 
122 aa  67  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  36.56 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  37.11 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  39.58 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  37.78 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  37.78 
 
 
105 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  40.45 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  36 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  34.34 
 
 
116 aa  64.3  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  36.67 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  37.78 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  36.08 
 
 
126 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  35.79 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  33.65 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  36.67 
 
 
116 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  29.91 
 
 
114 aa  60.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  33.05 
 
 
115 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  34.74 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  32.97 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  31.33 
 
 
124 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  37.23 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  27.72 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  22.22 
 
 
112 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  27.08 
 
 
101 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  27.66 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  27.66 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  27.66 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>