255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2978 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2978  6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
248 aa  488  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2007  6-phosphogluconolactonase  57.66 
 
 
261 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.750142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1985  6-phosphogluconolactonase  50.81 
 
 
258 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.446767  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1938  6-phosphogluconolactonase  53.82 
 
 
494 aa  220  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340922  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6018  6-phosphogluconolactonase  49.6 
 
 
257 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.688301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3094  6-phosphogluconolactonase  51.41 
 
 
256 aa  215  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.257113  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2242  6-phosphogluconolactonase  48.61 
 
 
262 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5191  6-phosphogluconolactonase  52.4 
 
 
259 aa  212  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.646883  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15930  6-phosphogluconolactonase  48.81 
 
 
260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2208  6-phosphogluconolactonase  55.91 
 
 
447 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000925433  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19980  6-phosphogluconolactonase  46.77 
 
 
248 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2410  6-phosphogluconolactonase  48.97 
 
 
245 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2456  6-phosphogluconolactonase  48.97 
 
 
245 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213397  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2450  6-phosphogluconolactonase  48.97 
 
 
245 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1833  6-phosphogluconolactonase  45.17 
 
 
272 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11473  6-phosphogluconolactonase  51.43 
 
 
247 aa  196  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.821995 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2417  6-phosphogluconolactonase  50.6 
 
 
257 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.245714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1645  6-phosphogluconolactonase  46.54 
 
 
265 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0205292  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2092  6-phosphogluconolactonase  45.38 
 
 
272 aa  188  5e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3321  6-phosphogluconolactonase  47.79 
 
 
256 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141721 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1260  6-phosphogluconolactonase  44.03 
 
 
249 aa  188  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0812543  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2926  6-phosphogluconolactonase  51.03 
 
 
249 aa  185  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2165  6-phosphogluconolactonase  47.37 
 
 
250 aa  183  3e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.238785  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2526  6-phosphogluconolactonase  45.3 
 
 
254 aa  181  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3696  6-phosphogluconolactonase  54.84 
 
 
243 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.683981  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1122  6-phosphogluconolactonase  45.49 
 
 
254 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2071  6-phosphogluconolactonase  47.37 
 
 
257 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.906484  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2716  6-phosphogluconolactonase  50.82 
 
 
244 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.285533 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2536  6-phosphogluconolactonase  41.3 
 
 
241 aa  169  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1553  6-phosphogluconolactonase  45.38 
 
 
249 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2053  6-phosphogluconolactonase  48.13 
 
 
271 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2370  6-phosphogluconolactonase  45.73 
 
 
246 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.610167  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2257  6-phosphogluconolactonase  42.45 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000113878  normal  0.165396 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  45.21 
 
 
571 aa  148  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0183  6-phosphogluconolactonase  33.85 
 
 
274 aa  143  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6318  gluconate kinase / 6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
429 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.655632  normal  0.977639 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2121  6-phosphogluconolactonase  37.75 
 
 
228 aa  119  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0529  6-phosphogluconolactonase  32.92 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.77766  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1243  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.64 
 
 
280 aa  118  7.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13160  6-phosphogluconolactonase  38.52 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0456  6-phosphogluconolactonase  32.08 
 
 
241 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.52308  normal  0.121254 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2720  6-phosphogluconolactonase  37.5 
 
 
252 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5183  6-phosphogluconolactonase  32.93 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.908662  normal  0.12903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1794  6-phosphogluconolactonase  37.14 
 
 
240 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4692  6-phosphogluconolactonase  37.98 
 
 
233 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.504943 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1213  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 
225 aa  107  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2251  6-phosphogluconolactonase  35.63 
 
 
248 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000880456  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04030  6-phosphogluconolactonase, putative  31.14 
 
 
373 aa  105  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1628  6-phosphogluconolactonase  31.3 
 
 
237 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.179566  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02428  hypothetical protein  32.16 
 
 
238 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003324  6-phosphogluconolactonase eukaryotic type  33.17 
 
 
238 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2071  6-phosphogluconolactonase  39.11 
 
 
232 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.834551  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3272  6-phosphogluconolactonase  35.53 
 
 
235 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5038  6-phosphogluconolactonase  30.42 
 
 
239 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.25902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2753  6-phosphogluconolactonase  31.82 
 
 
244 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1482  6-phosphogluconolactonase  31.54 
 
 
241 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000109648  normal  0.405401 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00285  6-phosphogluconolactonase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02980)  31.5 
 
 
265 aa  102  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.757461 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0340  6-phosphogluconolactonase  29.66 
 
 
238 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000175267  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1455  6-phosphogluconolactonase  29.96 
 
 
236 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1481  6-phosphogluconolactonase  30.21 
 
 
236 aa  101  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.448023  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13316  predicted protein  35.52 
 
 
248 aa  101  9e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0957724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4801  6-phosphogluconolactonase  33.93 
 
 
238 aa  101  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.035982  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2354  6-phosphogluconolactonase  34.01 
 
 
245 aa  101  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.578292  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2455  6-phosphogluconolactonase  33.97 
 
 
236 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.233722  normal  0.737843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2618  6-phosphogluconolactonase  36.2 
 
 
241 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5372  6-phosphogluconolactonase  34.45 
 
 
243 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.364101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2833  6-phosphogluconolactonase  33.97 
 
 
236 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0686  6-phosphogluconolactonase  28.93 
 
 
240 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0919  6-phosphogluconolactonase  34.15 
 
 
235 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.75436 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1063  6-phosphogluconolactonase  34.15 
 
 
235 aa  100  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.301741  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3477  6-phosphogluconolactonase  33.07 
 
 
246 aa  99.8  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2814  6-phosphogluconolactonase  32.35 
 
 
252 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2644  6-phosphogluconolactonase  39.2 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3673  6-phosphogluconolactonase  34.85 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1652  6-phosphogluconolactonase  27.93 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4158  6-phosphogluconolactonase  36.33 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105451  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1889  6-phosphogluconolactonase  34.96 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140296  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND03390  6-phosphogluconolactonase, putative  30.14 
 
 
294 aa  96.3  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.379587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4215  6-phosphogluconolactonase  31.03 
 
 
240 aa  95.9  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0227099  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2103  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 
264 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.22743  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2709  6-phosphogluconolactonase  31.96 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.143593  hitchhiker  0.00000000228855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3477  6-phosphogluconolactonase  36.36 
 
 
248 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82104  6-phosphogluconolactonase-like protein  29.63 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.650309  normal  0.457187 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1522  6-phosphogluconolactonase  32.14 
 
 
240 aa  93.6  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0189067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4827  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.179164 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0923  6-phosphogluconolactonase, glucosamine-6-phosphate isomerase/deaminase  36.02 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0535  6-phosphogluconolactonase  31.91 
 
 
235 aa  92.8  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797573  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1134  6-phosphogluconolactonase  26.91 
 
 
232 aa  92.8  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.488707  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5294  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 
243 aa  92  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.64366  normal  0.948417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0053  6-phosphogluconolactonase  38.74 
 
 
242 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1674  6-phosphogluconolactonase  31 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2075  6-phosphogluconolactonase  28.78 
 
 
279 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1348  6-phosphogluconolactonase  29.44 
 
 
242 aa  88.6  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.824012  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1905  6-phosphogluconolactonase  34.94 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1976  6-phosphogluconolactonase  35.51 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.731811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3023  6-phosphogluconolactonase  31.88 
 
 
240 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.377952  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1278  6-phosphogluconolactonase  34.29 
 
 
246 aa  85.9  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2970  6-phosphogluconolactonase  33.03 
 
 
235 aa  85.5  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.504923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2308  6-phosphogluconolactonase  34.03 
 
 
241 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0267675 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1662  6-phosphogluconolactonase  28 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>