88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2954 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2954  lipolytic protein G-D-S-L family  100 
 
 
319 aa  639    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1978  hypothetical protein  74.32 
 
 
300 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0855  hypothetical protein  53.49 
 
 
267 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.335493  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34730  lysophospholipase L1-like esterase  50.4 
 
 
302 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0437206  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0732  lipolytic protein G-D-S-L family  51.92 
 
 
263 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10792  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2206  lipolytic protein G-D-S-L family  47.35 
 
 
261 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.235445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0386  lipolytic protein G-D-S-L family  48.39 
 
 
258 aa  221  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6531  hypothetical protein  46.51 
 
 
262 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.0269756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0854  hypothetical protein  48.44 
 
 
260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.231592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19770  lysophospholipase L1-like esterase  47.79 
 
 
255 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  hitchhiker  0.000837214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4413  GDSL family lipase  47.81 
 
 
266 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0731  lipolytic protein G-D-S-L family  48.05 
 
 
265 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1363  lipolytic protein G-D-S-L family  42.5 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000348827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5844  lipolytic protein G-D-S-L family  42.91 
 
 
258 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1326  GDSL family lipase  45.6 
 
 
287 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3925  GDSL family lipase  42.06 
 
 
253 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3727  lipolytic protein G-D-S-L family  40.47 
 
 
257 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0684  lipolytic protein G-D-S-L family  40.94 
 
 
273 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0974788  hitchhiker  0.0000166957 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31650  lysophospholipase L1-like esterase  41.44 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0811  lipolytic protein G-D-S-L family  37.17 
 
 
333 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.0157392 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2060  lipolytic protein G-D-S-L family  40.61 
 
 
281 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1490  lipolytic protein G-D-S-L family  44.84 
 
 
264 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1065  lipolytic protein G-D-S-L family  40.73 
 
 
258 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.123175  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0269  GDSL family lipase  41.2 
 
 
296 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0027  GDSL family lipase  43.02 
 
 
255 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06060  lysophospholipase L1-like esterase  40.78 
 
 
297 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0023  GDSL family lipase  42.86 
 
 
259 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0072  GDSL family lipase  43.43 
 
 
294 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3930  GDSL family lipase  39.68 
 
 
283 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4652  hypothetical protein  42.57 
 
 
270 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0687952  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3730  lipolytic protein G-D-S-L family  39.44 
 
 
281 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0263  lipolytic protein G-D-S-L family  40.42 
 
 
301 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23280  lysophospholipase L1-like esterase  38.43 
 
 
290 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2275  lipolytic protein G-D-S-L family  40.55 
 
 
278 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2945  lipolytic protein G-D-S-L family  38.26 
 
 
289 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0254  lipolytic protein G-D-S-L family  40.08 
 
 
254 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21860  GDSL-like Lipase/Acylhydrolase  36.33 
 
 
307 aa  149  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00185801  normal  0.684974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2884  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.32 
 
 
258 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0469503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2914  GDSL family lipase  40.32 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.308919 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2928  GDSL family lipase  40.32 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5121  GDSL family lipase  38.34 
 
 
254 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.245752  normal  0.320087 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3183  GDSL family lipase  37.3 
 
 
256 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3065  lipolytic protein G-D-S-L family  36.55 
 
 
262 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2667  GDSL family lipase  32.38 
 
 
234 aa  94.7  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24646  hitchhiker  0.000175501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3268  lipolytic protein G-D-S-L family  34.52 
 
 
232 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2484  GDSL family lipase  31.84 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2877  hypothetical protein  30.41 
 
 
196 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2458  hypothetical protein  30.93 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.755507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1905  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.4 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00675962  normal  0.682362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0156  lipolytic protein G-D-S-L family  33.17 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0132621  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2933  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.61 
 
 
218 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.594206  normal  0.0718245 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2532  lipase/acylhydrolase, putative  27.6 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0234064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1801  lipolytic protein G-D-S-L family  30.85 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.798982  normal  0.790129 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2320  GDSL family lipase  27.89 
 
 
197 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000848879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2286  lipase/acylhydrolase  28.87 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000040763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2516  putative lipase/acylhydrolase  27.32 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.118211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2501  lipase/acylhydrolase  27.32 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.125082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2242  lipase/acylhydrolase  27.32 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00129971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2589  putative lipase/acylhydrolase  27.32 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00217697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2237  GDSL family lipase  40.44 
 
 
284 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0161232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2321  lipase/acylhydrolase  33.33 
 
 
143 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3278  hypothetical protein  25.67 
 
 
229 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.548369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3144  lipolytic protein G-D-S-L family  25.66 
 
 
225 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21100  lysophospholipase L1-like esterase  27.64 
 
 
223 aa  50.4  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3516  lipolytic protein G-D-S-L family  27.19 
 
 
275 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.41 
 
 
198 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3640  lipolytic protein G-D-S-L family  26.75 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.876075 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3316  GDSL family lipase  26.75 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.17173  normal  0.550495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4423  lipolytic protein G-D-S-L family  28.72 
 
 
348 aa  47.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07130  lysophospholipase L1-like esterase  27.27 
 
 
368 aa  46.6  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.39712  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2048  lipolytic protein G-D-S-L family  31 
 
 
207 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.137191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2484  lipolytic protein G-D-S-L family  25.22 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3416  esterase  24.12 
 
 
188 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0484902  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3153  lipolytic protein G-D-S-L family  25.71 
 
 
305 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3393  lipolytic protein G-D-S-L family  34.17 
 
 
209 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0644196  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3079  GDSL family lipase  27.36 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2456  lipolytic protein G-D-S-L family  26.63 
 
 
219 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00970732  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19520  lysophospholipase L1-like esterase  28.43 
 
 
209 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.347124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0503  lipase/acylhydrolase  36.36 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.833534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.98 
 
 
188 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1616  lipolytic protein G-D-S-L family  29.03 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2692  lipolytic protein G-D-S-L family  27.7 
 
 
217 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2090  GDSL family lipase  29.33 
 
 
277 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0380541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2113  lipolytic protein  28.36 
 
 
270 aa  43.5  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  28.27 
 
 
213 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2434  lipolytic enzyme, G-D-S-L  29.75 
 
 
270 aa  43.1  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.89 
 
 
201 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0079  lipolytic protein G-D-S-L family  27.41 
 
 
279 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>