165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2942 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2942  Alpha-N-arabinofuranosidase  100 
 
 
474 aa  969    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0858983  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4966  Alpha-N-arabinofuranosidase  67.67 
 
 
507 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2848  Alpha-N-arabinofuranosidase  69.87 
 
 
520 aa  671    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.724859  decreased coverage  0.0053695 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3024  glycoside hydrolase family 62  75.83 
 
 
829 aa  476  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  73.51 
 
 
488 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4884  glycoside hydrolase family 62  51.48 
 
 
492 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.918627 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07908  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  71.29 
 
 
325 aa  451  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901711  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02632  arabinoxylan arabinofuranohydrolase (Eurofung)  69.44 
 
 
308 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782111  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  39.31 
 
 
485 aa  215  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  41.3 
 
 
1195 aa  209  1e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.84 
 
 
1221 aa  204  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  65.97 
 
 
691 aa  197  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0376  Endo-1,4-beta-xylanase  67.83 
 
 
495 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3944  Alpha-N-arabinofuranosidase  63.82 
 
 
466 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0383  Ricin B lectin  65.03 
 
 
401 aa  190  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1313  Pectate lyase  59.76 
 
 
430 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0268992  hitchhiker  0.00857009 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1643  parallel beta-helix repeat-containing ricin B lectin  49.47 
 
 
563 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0329  Pectate lyase  48.47 
 
 
445 aa  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0745769 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1461  Ricin B lectin  55.94 
 
 
560 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1428  Ricin B lectin  44.81 
 
 
1139 aa  133  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.737248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2530  Ricin B lectin  42.38 
 
 
412 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00551776  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  44.22 
 
 
436 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0661  Ricin B lectin  42.34 
 
 
571 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2125  Ricin B lectin  41.29 
 
 
491 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  32.46 
 
 
780 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  32.46 
 
 
536 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3710  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  41.06 
 
 
476 aa  110  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000857688  normal  0.462081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4621  Ricin B lectin  46.04 
 
 
497 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4440  Ricin B lectin  41.61 
 
 
566 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0151299  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1962  Endo-1,4-beta-xylanase  43.8 
 
 
411 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.634854  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3586  arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  38.1 
 
 
514 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4176  carbohydrate-binding family 6 protein  40.58 
 
 
884 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4174  carbohydrate-binding family 6 protein  37.75 
 
 
957 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49527  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  44.03 
 
 
618 aa  101  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6977  hypothetical protein  35.85 
 
 
897 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449457  normal  0.690746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  39.26 
 
 
943 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  32.21 
 
 
472 aa  99.4  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4574  Ricin B lectin  43.41 
 
 
672 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  35.29 
 
 
1259 aa  97.1  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  41.79 
 
 
771 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  34.59 
 
 
963 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4084  Ricin B lectin  35.77 
 
 
1413 aa  95.1  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.29 
 
 
695 aa  95.1  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2450  Ricin B lectin  39.71 
 
 
582 aa  94.4  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0349225  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  38.85 
 
 
647 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  37.31 
 
 
537 aa  91.7  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2967  Ricin B lectin  35.66 
 
 
230 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1703  hypothetical protein  34.31 
 
 
392 aa  89.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.595343 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4332  Ricin B lectin  32.31 
 
 
615 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.817761  normal  0.0720026 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  35.51 
 
 
503 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6252  Ricin B lectin  34.94 
 
 
737 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.189274 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  32.26 
 
 
789 aa  86.7  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  39.42 
 
 
510 aa  86.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  35.82 
 
 
1187 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0976  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  34.56 
 
 
507 aa  84.3  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6159  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.68 
 
 
507 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444689  normal  0.0822461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  35.82 
 
 
2073 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0740  Arabinogalactan endo-1,4-beta-galactosidase  32.84 
 
 
507 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0859  Ricin B lectin  35.2 
 
 
483 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4995  Ricin B lectin  34.27 
 
 
1016 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214567  normal  0.0224239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4904  Ricin B lectin  35.51 
 
 
494 aa  77.4  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4855  Ricin B lectin  31.29 
 
 
503 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0410154  normal  0.0144537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4959  Ricin B lectin  29.53 
 
 
576 aa  73.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.572354  normal  0.851755 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4199  Ricin B lectin  33.54 
 
 
474 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876848  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5656  Ricin B lectin  35.43 
 
 
824 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0407757  normal  0.559684 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3068  Ricin B lectin  32.12 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4856  Ricin B lectin  31.65 
 
 
569 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173308  normal  0.0148414 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  31.97 
 
 
982 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5674  Ricin B lectin  36.5 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  33.33 
 
 
1141 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1817  Ricin B lectin  36.96 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599539  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4964  Pectinesterase  34.21 
 
 
794 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.467463  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48282  predicted protein  30.25 
 
 
1567 aa  66.6  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5654  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.54 
 
 
756 aa  64.7  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.171925  normal  0.428495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1625  Ricin B lectin  30.61 
 
 
664 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174665  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  32.17 
 
 
648 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  30.6 
 
 
863 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  31.37 
 
 
663 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0039  Galactose oxidase  32.17 
 
 
1000 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.261385  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  35.43 
 
 
468 aa  62  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6866  Ricin B lectin  28.66 
 
 
493 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.191188  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6915  Pectate lyase-like protein  31.87 
 
 
482 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4198  Pectinesterase  31.5 
 
 
487 aa  61.6  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.018397  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0819  pectate lyase  35.14 
 
 
427 aa  60.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.28547  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0712  lectin repeat-containing protein  31.17 
 
 
806 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.900098  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2317  heme utilization/adhesion protein  31.17 
 
 
806 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2233  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  31.17 
 
 
806 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4931  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.65 
 
 
493 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2157  glycoside hydrolase family 43  28.57 
 
 
627 aa  58.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000434172  hitchhiker  0.0029689 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  33.07 
 
 
1148 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4828  Ricin B lectin  29.61 
 
 
555 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773759 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2050  Alpha-N-arabinofuranosidase  28.1 
 
 
628 aa  57.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.647188  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1075  Ricin B lectin  30 
 
 
239 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1664  lectin repeat-containing protein  29.52 
 
 
806 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.912119  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1713  lectin repeat-containing protein  29.52 
 
 
806 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1921  lectin repeat-containing protein  29.52 
 
 
806 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00570044  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0596  ricin-type beta-trefoil lectin domain/galactose oxidase domain-containing protein  29.52 
 
 
806 aa  56.6  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4424  glycoside hydrolase family protein  29.41 
 
 
709 aa  56.2  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4899  glycoside hydrolase family protein  29.34 
 
 
391 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000537243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4927  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  34.65 
 
 
498 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.290499  normal  0.586744 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>