More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2895 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2895  transposase, IS605 OrfB family  100 
 
 
405 aa  822    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.56532  normal  0.682802 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4909  transposase, IS605 OrfB family  85.43 
 
 
410 aa  684    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.646541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0111  transposase, IS605 OrfB family  84.69 
 
 
410 aa  705    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.976081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1819  transposase, IS605 OrfB family  87.16 
 
 
410 aa  723    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.538618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1924  transposase, IS605 OrfB family  84.69 
 
 
405 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.304571 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0703  transposase, IS605 OrfB  70.41 
 
 
368 aa  526  1e-148  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3044  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  69.17 
 
 
376 aa  517  1.0000000000000001e-145  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396348  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5594  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  68.1 
 
 
381 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0815398  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5745  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  69.71 
 
 
381 aa  482  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0857845  normal  0.0649876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7865  IS605 family transposase OrfB  68.9 
 
 
381 aa  478  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0071  IS891/IS1136/IS1341 transposase  58.9 
 
 
395 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1376  transposase, IS605 OrfB family  56.92 
 
 
391 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.158654  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1346  transposase, IS605 OrfB family  56.15 
 
 
391 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4039  IS605 family transposase OrfB  61.54 
 
 
377 aa  458  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0972683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2165  IS605 family transposase OrfB  63.4 
 
 
377 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.896467  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1784  IS605 family transposase OrfB  63.13 
 
 
375 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125878  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0880  transposase, IS605 OrfB family  55.24 
 
 
391 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1554  IS605 family transposase OrfB  63.66 
 
 
377 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1829  IS891/IS1136/IS1341 transposase  55.53 
 
 
403 aa  437  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3202  transposase, IS605 OrfB family  55.5 
 
 
390 aa  437  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.860584  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05900  transposase IS891/IS1136/IS1341  56.45 
 
 
381 aa  425  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.542736  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3168  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  53.66 
 
 
381 aa  417  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4226  IS605 family transposase OrfB  55.65 
 
 
408 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2805  peyer'S patch-specific virulence factor GipA  53.72 
 
 
416 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.537832 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2689  transposase, IS605 OrfB family  54.93 
 
 
373 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.242406 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3063  transposase, IS605 OrfB family protein  50.54 
 
 
377 aa  398  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.311168  normal  0.0274228 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4184  IS605 family transposase OrfB  51.63 
 
 
367 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.90515  normal  0.53705 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4149  IS605 family transposase OrfB  51.36 
 
 
367 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.247919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4789  IS605 family transposase OrfB  60.44 
 
 
326 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2243  transposase, IS605 OrfB family  50.36 
 
 
424 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1890  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  63.07 
 
 
299 aa  363  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1017  transposase IS605 OrfB family  50.5 
 
 
406 aa  361  2e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  hitchhiker  0.000143802 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1127  transposase, IS605 OrfB family  44.12 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.319632 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4435  transposase, IS605 OrfB family  44.12 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4240  transposase, IS605 OrfB family  44.12 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142269 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1098  transposase, IS605 OrfB family  44.12 
 
 
403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4201  transposase, IS605 OrfB family  43.58 
 
 
403 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0348  IS605 family transposase OrfB  41.79 
 
 
362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0991817  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1594  transposase  43.28 
 
 
393 aa  296  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1508  transposase, IS605 OrfB family  44.74 
 
 
370 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1722  transposase, IS605 OrfB family  44.47 
 
 
370 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1425  IS605 family transposase OrfB  41.03 
 
 
435 aa  295  9e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1520  transposase  42.66 
 
 
393 aa  293  4e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2218  transposase  42.27 
 
 
392 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2543  transposase  40.94 
 
 
390 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1309  transposase  41.44 
 
 
427 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.231489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1692  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 
383 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373543 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0751  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 
383 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4771  transposase, IS605 OrfB family  41.46 
 
 
383 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2962  transposase, IS605 OrfB family  42.51 
 
 
417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0190822  hitchhiker  0.000536788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2948  transposase, IS605 OrfB family  40.9 
 
 
383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0499  transposase  42.15 
 
 
450 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0392  transposase  39.95 
 
 
373 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1505  transposase  42.15 
 
 
392 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.606196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2663  transposase, IS605 OrfB family  39.95 
 
 
440 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4512  transposase, IS605 OrfB family  41.18 
 
 
383 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.276618 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0091  transposase  39.15 
 
 
373 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0888224  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3034  transposase, IS605 OrfB family  44.06 
 
 
394 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.477564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0149  transposase, IS605 OrfB family  40.06 
 
 
383 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00433303  hitchhiker  0.000390892 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0153  transposase, IS605 OrfB family  40.06 
 
 
383 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4154  transposase, IS605 OrfB family  38.94 
 
 
383 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4194  transposase, IS605 OrfB family  38.94 
 
 
383 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2718  transposase  38.89 
 
 
373 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00857929  normal  0.0128228 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2715  transposase  38.89 
 
 
373 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00297087  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2729  transposase  38.89 
 
 
373 aa  276  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000926712  hitchhiker  0.000102458 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2768  transposase  41.87 
 
 
392 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000132039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2946  transposase, IS605 OrfB family  41.19 
 
 
384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420176 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0401  transposase  38.69 
 
 
372 aa  272  9e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2965  transposase, IS605 OrfB family  38.82 
 
 
405 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1973  transposase  38.21 
 
 
370 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662748  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2446  IS605 family transposase OrfB  37.66 
 
 
383 aa  272  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.327325  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0180  transposase  38.36 
 
 
373 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0390004  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0183  transposase  38.62 
 
 
372 aa  271  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.79763  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0334  transposase  38.42 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3241  transposase  37.67 
 
 
370 aa  270  5e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0445  transposase  38.42 
 
 
372 aa  269  8e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1857  transposase, IS605 OrfB family  40.41 
 
 
394 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2694  transposase  37.94 
 
 
370 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.240385  normal  0.200603 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3049  transposase  37.94 
 
 
370 aa  268  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00782519  normal  0.671104 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0442  transposase  42.7 
 
 
384 aa  268  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000469255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3220  transposase, IS605 OrfB family  39.49 
 
 
404 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1883  transposase, IS605 OrfB family  40.41 
 
 
394 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2900  transposase, IS605 OrfB family  39.49 
 
 
404 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355417  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1018  transposase  37.13 
 
 
370 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3357  IS605 family transposase OrfB  38.26 
 
 
383 aa  268  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0182  IS605 family transposase OrfB  36.29 
 
 
383 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2882  transposase  38.21 
 
 
393 aa  266  5e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.201197  normal  0.164603 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3755  transposase  37.4 
 
 
393 aa  265  7e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2738  transposase  36.31 
 
 
370 aa  265  8e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0501233  hitchhiker  0.000170929 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2043  transposase  36.71 
 
 
370 aa  264  2e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.087211  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1991  transposase  40.77 
 
 
383 aa  263  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2264  transposase  37.57 
 
 
373 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4609  transposase, IS605 OrfB family  38.54 
 
 
396 aa  262  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3701  transposase  36.86 
 
 
370 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000275581  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3751  transposase  36.22 
 
 
370 aa  260  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.947255  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1650  putative transposase, IS891/IS1136/IS1341  36.12 
 
 
372 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0889  ISCpe2, transposase orfB  36.6 
 
 
384 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.688854  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1031  ISCpe2, transposase orfB  36.6 
 
 
384 aa  259  7e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5163  transposase, IS608 family  38.28 
 
 
399 aa  259  8e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000648868 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0989  ISCpe2, transposase orfB  36.6 
 
 
384 aa  258  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>