More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2890 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 
432 aa  871  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  69.77 
 
 
433 aa  598  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  63.17 
 
 
441 aa  534  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  53.52 
 
 
434 aa  472  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  55.05 
 
 
438 aa  447  1e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  54.14 
 
 
427 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  50.93 
 
 
447 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  50.58 
 
 
452 aa  391  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  49.41 
 
 
437 aa  387  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  49.47 
 
 
486 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  47.66 
 
 
437 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  49.06 
 
 
437 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  47.2 
 
 
438 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  1.56043e-06 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  45.69 
 
 
435 aa  358  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  47.42 
 
 
425 aa  357  2e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  45.71 
 
 
473 aa  351  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  45.54 
 
 
439 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  46.44 
 
 
475 aa  329  5e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  37.32 
 
 
437 aa  328  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  36.85 
 
 
437 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  37.85 
 
 
437 aa  325  9e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  36.38 
 
 
437 aa  322  9e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  35.92 
 
 
437 aa  320  2e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  36.15 
 
 
437 aa  320  2e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  36.15 
 
 
437 aa  320  2e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  36.15 
 
 
437 aa  320  2e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  36.85 
 
 
437 aa  319  5e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  36.62 
 
 
434 aa  319  6e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  1.5326e-08 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  40.7 
 
 
428 aa  318  8e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  36.38 
 
 
438 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  40.52 
 
 
470 aa  303  5e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  38.93 
 
 
445 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  35.43 
 
 
464 aa  270  3e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  39.2 
 
 
436 aa  270  3e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  37.3 
 
 
442 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  35.75 
 
 
464 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  37.41 
 
 
440 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  36.11 
 
 
460 aa  246  7e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  34.7 
 
 
469 aa  236  6e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  35.45 
 
 
417 aa  234  2e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  33.72 
 
 
424 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.71 
 
 
409 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  32.33 
 
 
429 aa  222  1e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.63 
 
 
445 aa  219  9e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  32.55 
 
 
412 aa  217  3e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  33.72 
 
 
478 aa  209  9e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  31.48 
 
 
411 aa  203  4e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 
415 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  33.1 
 
 
415 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  31.92 
 
 
415 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  28.94 
 
 
423 aa  189  6e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  30.95 
 
 
439 aa  183  4e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  32.87 
 
 
466 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  29.32 
 
 
437 aa  148  2e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.93 
 
 
429 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  27.86 
 
 
574 aa  143  7e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  25.98 
 
 
556 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  29.67 
 
 
421 aa  135  1e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  28.74 
 
 
418 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  29.91 
 
 
421 aa  132  1e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.65 
 
 
449 aa  129  9e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.91 
 
 
417 aa  127  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  28.41 
 
 
427 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  33.95 
 
 
246 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  27.35 
 
 
462 aa  115  1e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  26.93 
 
 
418 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  23.6 
 
 
642 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  44.07 
 
 
424 aa  111  2e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  26.13 
 
 
448 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  30.04 
 
 
572 aa  104  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.65 
 
 
504 aa  97.4  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  26.52 
 
 
446 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  39.67 
 
 
423 aa  94.4  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  29.87 
 
 
483 aa  92.8  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  33.68 
 
 
413 aa  82.8  1e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  1.42311e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.69 
 
 
474 aa  79.7  1e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.36 
 
 
465 aa  79  2e-13  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  37.3 
 
 
499 aa  77.8  3e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.96481e-14 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.34 
 
 
444 aa  74.3  4e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  37.06 
 
 
430 aa  73.9  5e-12  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  35.36 
 
 
473 aa  73.6  7e-12  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7179  hypothetical protein  31.88 
 
 
444 aa  72.4  1e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.37 
 
 
448 aa  72  2e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  25.6 
 
 
464 aa  71.6  3e-11  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  32 
 
 
461 aa  70.9  4e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4160  FAD linked oxidase domain protein  24.88 
 
 
481 aa  68.9  2e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  33.14 
 
 
463 aa  68.9  2e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.93 
 
 
464 aa  67.4  4e-10  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0802  oxidoreductase, FAD-binding  28.57 
 
 
444 aa  67.8  4e-10  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.823765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7235  FAD linked oxidase domain protein  34.09 
 
 
491 aa  67  5e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  27.67 
 
 
366 aa  67.4  5e-10  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  35.4 
 
 
480 aa  67  6e-10  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  9.29143e-06  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  32.48 
 
 
474 aa  67  7e-10  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2308  FAD linked oxidase-like  32.95 
 
 
466 aa  66.6  8e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000469  probable oxidoreductase  29.65 
 
 
563 aa  65.9  1e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0940249  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5664  FAD linked oxidase domain protein  23.37 
 
 
468 aa  66.2  1e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1951  FAD linked oxidase-like  22.77 
 
 
452 aa  65.9  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  24.57 
 
 
558 aa  65.1  2e-09  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  30.51 
 
 
457 aa  65.1  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302451 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  38.55 
 
 
376 aa  65.1  2e-09  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>