More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2885 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2885  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 217 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1941  response regulator receiver  78.8 
 
 		 217 aa  347  1e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1694  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.58 
 
 		 217 aa  324  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00296965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1627  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.58 
 
 		 218 aa  323  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2298  winged helix family two component transcriptional regulator  74.19 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.359979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6773  response regulator receiver protein  73.02 
 
 		 215 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3839  two component transcriptional regulator  68.08 
 
 		 214 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6946  two component transcriptional regulator  63.13 
 
 		 219 aa  274  8e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  62.44 
 
 		 214 aa  272  3e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0304  response regulator receiver protein  65.44 
 
 		 218 aa  271  4.0000000000000004e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.818258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1032  two component transcriptional regulator, winged helix family  64.06 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5939  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.67 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0839  response regulator receiver protein  67.28 
 
 		 217 aa  262  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24140  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  65.44 
 
 		 231 aa  254  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00201668  decreased coverage  0.0036779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0152  two component transcriptional regulator, winged helix family  60.83 
 
 		 218 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1458  two component transcriptional regulator  61.75 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4944  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 224 aa  252  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6645  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 217 aa  250  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.129361 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1496  response regulator receiver  61.29 
 
 		 222 aa  250  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.23196  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0082  two component transcriptional regulator  62.67 
 
 		 219 aa  248  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4784  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.63 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0755771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4521  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 223 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.315032 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3750  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.21 
 
 		 220 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.169526  normal  0.108117 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8629  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0375098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.68 
 
 		 226 aa  234  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.896215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1526  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.75 
 
 		 225 aa  231  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6028  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.45 
 
 		 227 aa  231  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5788  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.06 
 
 		 235 aa  230  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.767422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26840  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.6 
 
 		 227 aa  227  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.871857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4756  response regulator receiver protein  57.6 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666575  normal  0.223314 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3363  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.21 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0520  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.06 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1424  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.53 
 
 		 227 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.962771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7133  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0709918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4514  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.99 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0331921  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1412  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.14 
 
 		 228 aa  216  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5651  response regulator receiver protein  52.11 
 
 		 222 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2444  two component transcriptional regulator  56.22 
 
 		 221 aa  208  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.81 
 
 		 234 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5374  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.85 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1613  response regulator receiver  50.45 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.97266  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2625  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.983258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0196  two component transcriptional regulator  46.85 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0851  two component transcriptional regulator  44.75 
 
 		 222 aa  177  8e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0537  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0716782  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2104  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.27 
 
 		 225 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1213  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.29 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3423  response regulator receiver protein  49.32 
 
 		 224 aa  173  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.699539  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  43.64 
 
 		 223 aa  171  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 240 aa  170  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1713  two component heavy metal response transcriptional regulator  41.78 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0102  response regulator receiver protein  47.96 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0064  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118539 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0047  DNA-binding heavy metal response regulator, putative  44.34 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.116112  hitchhiker  0.00000494979 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.382659  hitchhiker  0.0034413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0061  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.34 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868462 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1806  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.82 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0205791  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0861  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.71 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.156886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1438  DNA-binding response regulator CzrR  43.84 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4283  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.84 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0230752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4842  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.649395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1091  two component heavy metal response transcriptional regulator  46.67 
 
 		 232 aa  164  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 233 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0990  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.37 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000957791  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2330  DNA-binding response regulator  41.36 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.82 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4369  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.38 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3502  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.15 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2599  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.268704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4535  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3859  two component transcriptional regulator  47.51 
 
 		 235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0389848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1370  two component response regulator  42.92 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 223 aa  162  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.47 
 
 		 226 aa  162  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1389  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.55 
 
 		 225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.717226  normal  0.091392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3559  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.710681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3624  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.99 
 
 		 224 aa  161  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5224  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 225 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.57611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10613  two component system DNA binding transcriptional regulatory protein tcrA  44.09 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499525  normal  0.750249 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0767  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.870104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37500  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.45 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0213695  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2259  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.99 
 
 		 225 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1815  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.64 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0704  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205827  normal  0.593451 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1594  response regulator receiver  50.23 
 
 		 219 aa  160  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.349405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5468  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 223 aa  159  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.53 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01690  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.54 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.459553  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1074  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.55 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.798214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.01 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 241 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1986  two component heavy metal response transcriptional regulator  40.83 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0566795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2069  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.27 
 
 		 228 aa  158  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>