More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2783 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
930 aa  1794    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  50.27 
 
 
841 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  44.18 
 
 
825 aa  348  3e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  43.51 
 
 
836 aa  346  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  43.68 
 
 
839 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  37.21 
 
 
855 aa  284  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  38.96 
 
 
838 aa  256  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  34.88 
 
 
861 aa  237  6e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 
852 aa  225  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.24 
 
 
859 aa  219  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  31 
 
 
854 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  35.52 
 
 
849 aa  206  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  34.06 
 
 
878 aa  205  4e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  32.56 
 
 
842 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  34.48 
 
 
834 aa  204  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  35.77 
 
 
849 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  31.23 
 
 
843 aa  192  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.98 
 
 
848 aa  178  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  34.89 
 
 
846 aa  177  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  32.12 
 
 
847 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 
853 aa  174  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  31.4 
 
 
845 aa  172  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  31.26 
 
 
873 aa  172  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  31.06 
 
 
855 aa  171  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  30.73 
 
 
821 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 
856 aa  169  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  35.37 
 
 
846 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  32.39 
 
 
859 aa  160  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.7 
 
 
871 aa  159  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  28.77 
 
 
880 aa  153  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  34.53 
 
 
857 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  30.24 
 
 
806 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  25.17 
 
 
897 aa  140  1e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 
853 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.93 
 
 
835 aa  136  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 
866 aa  134  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  28.96 
 
 
853 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 
857 aa  131  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  33.7 
 
 
828 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  33.45 
 
 
861 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  33.04 
 
 
873 aa  127  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  20.85 
 
 
858 aa  122  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  25.92 
 
 
854 aa  115  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  29.53 
 
 
855 aa  115  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  27.56 
 
 
855 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  31.1 
 
 
801 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
822 aa  95.9  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  27.01 
 
 
863 aa  92.4  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  27.42 
 
 
850 aa  92.8  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  25.24 
 
 
855 aa  89.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30 
 
 
443 aa  87  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  25.27 
 
 
851 aa  84.7  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  43.92 
 
 
738 aa  84.3  0.000000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  22.97 
 
 
857 aa  84  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  33.12 
 
 
452 aa  83.2  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.46 
 
 
870 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  22.46 
 
 
404 aa  80.9  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  23 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  29.22 
 
 
838 aa  77.4  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2922  protein of unknown function DUF214  30.39 
 
 
826 aa  77  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.179873  normal  0.823523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  28.43 
 
 
822 aa  75.1  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  30.94 
 
 
842 aa  74.7  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.56 
 
 
413 aa  73.2  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  26.27 
 
 
404 aa  73.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  24.03 
 
 
833 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  30.74 
 
 
849 aa  72.8  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0189  hypothetical protein  31.85 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0184  hypothetical protein  31.85 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.430576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  31.02 
 
 
842 aa  72  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  24.15 
 
 
658 aa  71.6  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.03 
 
 
664 aa  71.2  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  29.09 
 
 
393 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  33.23 
 
 
841 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.48 
 
 
397 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  25.31 
 
 
408 aa  69.7  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  28.23 
 
 
399 aa  70.1  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  28.62 
 
 
379 aa  69.7  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  23.33 
 
 
896 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  32.07 
 
 
827 aa  69.3  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  22.2 
 
 
850 aa  68.9  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  31.73 
 
 
842 aa  69.3  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  32.35 
 
 
662 aa  68.6  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  26.04 
 
 
850 aa  68.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.89 
 
 
437 aa  68.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4048  protein of unknown function DUF214  28.44 
 
 
826 aa  68.2  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.078752  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3228  permease, putative  23.46 
 
 
794 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.701051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 
828 aa  67.8  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  27.54 
 
 
415 aa  67.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.22 
 
 
404 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.76 
 
 
371 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  20.69 
 
 
393 aa  67.4  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  27.54 
 
 
414 aa  67.4  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28 
 
 
406 aa  66.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1765  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.99 
 
 
413 aa  66.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157209  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  26.83 
 
 
844 aa  66.2  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  26.96 
 
 
419 aa  66.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 
410 aa  65.9  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 
849 aa  65.5  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  22.58 
 
 
362 aa  65.9  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>