82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2770 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 150 aa  299  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  90.6 
 
 		 149 aa  276  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  90 
 
 		 150 aa  275  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  87.33 
 
 		 150 aa  265  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5447  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.51 
 
 		 178 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.97 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 151 aa  61.6  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.93 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.82 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4135  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.11 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  36.79 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  39.42 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  38.68 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  31.46 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  31.5 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.56 
 
 		 288 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2102  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.32 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1228  putative signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.141602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1884  signal transduction histidine kinase  44.68 
 
 		 484 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.857043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  29.55 
 
 		 200 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 532 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 358 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 358 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  33.66 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1629  signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 600 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  36.26 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.35 
 
 		 216 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  38.95 
 
 		 166 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  52.94 
 
 		 382 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1419  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 551 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2857  signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 515 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.207944  normal  0.114386 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 512 aa  44.3  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4220  histidine kinase  38.89 
 
 		 478 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.81 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  35.05 
 
 		 176 aa  43.5  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1426  rsbW protein, putative  24.19 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.96 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  30 
 
 		 365 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4555  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 369 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2043  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  26.37 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000388253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2609  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 492 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.107933  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3198  histidine kinase  34.96 
 
 		 481 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.474153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4962  histidine kinase  34.96 
 
 		 481 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.412893  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4194  ATPase-like/sensor kinase  37.97 
 
 		 344 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5629  putative signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.56187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0755  putative regulatory protein  34.44 
 
 		 164 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1093 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  33.01 
 
 		 137 aa  42  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1228  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  24.11 
 
 		 144 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.011235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.23 
 
 		 151 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1487  signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 924 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.588746 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1522  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  35.14 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5201  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  38.37 
 
 		 728 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171311  normal  0.162808 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5041  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.7 
 
 		 197 aa  41.2  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  38.98 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0585  sensor histidine kinase/response regulator  34.72 
 
 		 494 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.785291 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1503  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 362 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  34.38 
 
 		 356 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1323  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.46 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.105677  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2534  signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 		 356 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  42.22 
 
 		 744 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20510  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 497 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.101775  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 980 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.66 
 
 		 295 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  0.468222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 493 aa  40.4  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2424  signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 354 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.790198 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2552  sensory transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 819 aa  40.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 347 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>