28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2712 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2712  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  751    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.354831 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  56.08 
 
 		 431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  33.71 
 
 		 355 aa  100  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  36.05 
 
 		 371 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  41.29 
 
 		 378 aa  85.9  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  33.49 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  33.49 
 
 		 347 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  33.89 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  32.51 
 
 		 347 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  34.3 
 
 		 341 aa  77.8  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  35.39 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  29.47 
 
 		 425 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  38.06 
 
 		 367 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  28.38 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12810  predicted membrane protein  27.91 
 
 		 396 aa  67  0.0000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.157231  decreased coverage  0.00366432 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  32.59 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  33.11 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  32.48 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3414  hypothetical protein  32.64 
 
 		 379 aa  56.2  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  29.57 
 
 		 369 aa  56.2  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0361  hypothetical protein  27.23 
 
 		 375 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3704  hypothetical protein  30.2 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0978741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0201  hypothetical protein  26.56 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  26.46 
 
 		 373 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4101  membrane protein-like protein  29.38 
 
 		 369 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.453683 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  27.19 
 
 		 409 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  26.02 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  27.74 
 
 		 432 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>